Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PJ56

Protein Details
Accession J8PJ56    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-73QQYEKETGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-67TGKKASKRKLRKVSKVK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.833, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MNGIFAIEKPSGITSNQFMLKLQHALTKSQVFSKEIQRATAERKQQYEKETGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTLDPLASGVLVIGIGTGTKKLANYLSGTVKVYESEALFGVSTTSGDVEGEILSQNSVKHLNFDDLKTVEEKFVGQLKQTPPIYAALKMDGKPLHEYAREGKPLPRAIEPRQVNIYDLKVFSDSLKRDHDYTFLRPTTEEAVATVKNLNANMLNDVLYFSKNYTDKHGLDSEVAKVEEPFPLSKEEEQEIEKEGNSYKAPKLHFKANVSSGTYIRSLVSDIGKAMRSSCYMVKLIRLQQQDWSLERNNVFQLGDFTERDEKVWSKVLEKVLDEGASVDVIEELKKAEKDVPVDVKEDVIPDDQTKNGYTAETLENANVEESSNELKRKIEQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.28
11 0.26
12 0.28
13 0.33
14 0.35
15 0.34
16 0.35
17 0.38
18 0.35
19 0.38
20 0.45
21 0.47
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.42
26 0.48
27 0.5
28 0.5
29 0.47
30 0.53
31 0.57
32 0.59
33 0.6
34 0.62
35 0.62
36 0.62
37 0.65
38 0.66
39 0.68
40 0.71
41 0.75
42 0.75
43 0.77
44 0.79
45 0.82
46 0.85
47 0.87
48 0.9
49 0.92
50 0.92
51 0.92
52 0.89
53 0.83
54 0.81
55 0.72
56 0.64
57 0.54
58 0.45
59 0.36
60 0.29
61 0.24
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.18
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.15
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.14
119 0.19
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.2
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.2
135 0.21
136 0.29
137 0.29
138 0.27
139 0.22
140 0.26
141 0.26
142 0.22
143 0.21
144 0.17
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.26
157 0.27
158 0.26
159 0.28
160 0.3
161 0.33
162 0.33
163 0.33
164 0.33
165 0.34
166 0.42
167 0.4
168 0.37
169 0.37
170 0.35
171 0.31
172 0.27
173 0.25
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.2
184 0.21
185 0.22
186 0.22
187 0.25
188 0.23
189 0.25
190 0.28
191 0.25
192 0.24
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.2
197 0.16
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.19
222 0.24
223 0.24
224 0.28
225 0.29
226 0.25
227 0.25
228 0.25
229 0.2
230 0.17
231 0.16
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.21
257 0.23
258 0.3
259 0.33
260 0.38
261 0.43
262 0.43
263 0.46
264 0.46
265 0.47
266 0.41
267 0.4
268 0.32
269 0.29
270 0.25
271 0.21
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.24
291 0.29
292 0.34
293 0.38
294 0.39
295 0.36
296 0.38
297 0.43
298 0.42
299 0.37
300 0.36
301 0.32
302 0.33
303 0.34
304 0.31
305 0.27
306 0.25
307 0.24
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.2
312 0.18
313 0.2
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.26
318 0.24
319 0.24
320 0.31
321 0.29
322 0.26
323 0.31
324 0.35
325 0.35
326 0.34
327 0.33
328 0.28
329 0.27
330 0.24
331 0.2
332 0.15
333 0.11
334 0.1
335 0.08
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.12
342 0.12
343 0.14
344 0.18
345 0.22
346 0.24
347 0.32
348 0.38
349 0.36
350 0.38
351 0.36
352 0.33
353 0.3
354 0.28
355 0.23
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.2
360 0.19
361 0.21
362 0.21
363 0.2
364 0.19
365 0.17
366 0.15
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.13
376 0.11
377 0.09
378 0.11
379 0.16
380 0.21
381 0.22
382 0.23
383 0.25