Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VMW5

Protein Details
Accession A0A4Q4VMW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-530MVHNQPTKPKPQLPKKSNPLAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-367KKRK
515-523KPKPQLPKK
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPTGLVMTRVIAKENRRVVVEIVVTEIMTIHETVITAVHVMDTQLTYHPTTRATMASTIDQSLRDQGAAGLVEVRIKSDDRNGSRRRYAFAEFQSDDDAIDFMERHYPTIDISAPNGTYVKVYIEYSRERRPAPNPDDWICPMCHFQNFSRRATSETTTDMRLDGKSDECPQQAPSQFLVIRDLPSSANETTLSNGIKSLYITKGEEPKQPSGPAPKLKSTAPVGNTSGLGAKSGSLVRVFLIRDRVTEISCNYGFAEFSTLDDARGAMAKYNATPQFTIGSRPVTIAYIHSGVFIPHLYPVQEHDSKFSFSATHNPSLRLAYWNPSVFASEFTVFNESLYEDKSREPTESQKDADQSSGKETKKRKADKDLAAPSGKKVIAMAPQLQRWANKHAELHSSQEAKRAEVSSKDKTPATGPNAVGPAQVNSPAPTPAPSVSYADLDNMCCLLCRRKFSNEPSLRRHEQISDMHKTNLENEELIAKATRDLKAMGKEPISNYRDRAKERRMVHNQPTKPKPQLPKKSNPLAKDTTPAKPAISKGAGLLAKMGWSTGEGLGAEGSGRTNIIETMAYNPGVGLGAEGGKLGDAVEEAARATKNDYSDFVAKAKDKARERYERMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.43
4 0.44
5 0.41
6 0.42
7 0.39
8 0.3
9 0.26
10 0.23
11 0.2
12 0.18
13 0.17
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.11
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.22
43 0.24
44 0.24
45 0.25
46 0.24
47 0.23
48 0.21
49 0.23
50 0.21
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.1
58 0.1
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.13
64 0.15
65 0.21
66 0.3
67 0.34
68 0.45
69 0.5
70 0.56
71 0.64
72 0.64
73 0.6
74 0.56
75 0.54
76 0.52
77 0.5
78 0.51
79 0.43
80 0.42
81 0.41
82 0.36
83 0.31
84 0.24
85 0.18
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.18
97 0.2
98 0.14
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.18
112 0.25
113 0.3
114 0.37
115 0.4
116 0.41
117 0.46
118 0.5
119 0.56
120 0.55
121 0.58
122 0.56
123 0.54
124 0.57
125 0.53
126 0.49
127 0.39
128 0.34
129 0.29
130 0.26
131 0.26
132 0.25
133 0.27
134 0.34
135 0.37
136 0.38
137 0.41
138 0.39
139 0.39
140 0.4
141 0.38
142 0.3
143 0.31
144 0.3
145 0.26
146 0.26
147 0.23
148 0.21
149 0.18
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.16
154 0.19
155 0.23
156 0.22
157 0.23
158 0.23
159 0.28
160 0.29
161 0.29
162 0.25
163 0.26
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.19
171 0.14
172 0.14
173 0.18
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.16
180 0.15
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.18
191 0.25
192 0.28
193 0.33
194 0.34
195 0.37
196 0.37
197 0.37
198 0.37
199 0.37
200 0.41
201 0.43
202 0.42
203 0.42
204 0.42
205 0.41
206 0.42
207 0.38
208 0.36
209 0.3
210 0.3
211 0.28
212 0.27
213 0.26
214 0.22
215 0.2
216 0.15
217 0.13
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.19
233 0.2
234 0.18
235 0.2
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.13
245 0.07
246 0.08
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.19
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.13
290 0.17
291 0.17
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.14
298 0.11
299 0.2
300 0.21
301 0.25
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.27
306 0.27
307 0.21
308 0.19
309 0.16
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.08
330 0.1
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.22
336 0.28
337 0.31
338 0.31
339 0.3
340 0.31
341 0.3
342 0.31
343 0.25
344 0.19
345 0.21
346 0.27
347 0.26
348 0.3
349 0.35
350 0.4
351 0.48
352 0.55
353 0.56
354 0.59
355 0.67
356 0.67
357 0.72
358 0.7
359 0.65
360 0.6
361 0.54
362 0.45
363 0.4
364 0.33
365 0.23
366 0.18
367 0.16
368 0.17
369 0.19
370 0.24
371 0.23
372 0.24
373 0.26
374 0.27
375 0.28
376 0.26
377 0.29
378 0.26
379 0.26
380 0.27
381 0.28
382 0.32
383 0.3
384 0.32
385 0.32
386 0.33
387 0.3
388 0.35
389 0.32
390 0.28
391 0.29
392 0.26
393 0.22
394 0.25
395 0.31
396 0.3
397 0.33
398 0.35
399 0.33
400 0.32
401 0.34
402 0.34
403 0.33
404 0.33
405 0.3
406 0.3
407 0.32
408 0.31
409 0.28
410 0.22
411 0.18
412 0.12
413 0.14
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.17
427 0.15
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.13
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.11
436 0.17
437 0.2
438 0.25
439 0.29
440 0.37
441 0.45
442 0.51
443 0.61
444 0.62
445 0.66
446 0.68
447 0.72
448 0.68
449 0.62
450 0.58
451 0.49
452 0.45
453 0.45
454 0.44
455 0.43
456 0.41
457 0.41
458 0.4
459 0.38
460 0.37
461 0.32
462 0.27
463 0.19
464 0.17
465 0.18
466 0.16
467 0.17
468 0.14
469 0.1
470 0.12
471 0.16
472 0.17
473 0.16
474 0.18
475 0.22
476 0.26
477 0.29
478 0.3
479 0.28
480 0.3
481 0.32
482 0.4
483 0.39
484 0.36
485 0.36
486 0.4
487 0.44
488 0.49
489 0.54
490 0.52
491 0.57
492 0.61
493 0.68
494 0.7
495 0.73
496 0.76
497 0.77
498 0.76
499 0.78
500 0.8
501 0.76
502 0.74
503 0.73
504 0.74
505 0.75
506 0.79
507 0.78
508 0.81
509 0.83
510 0.86
511 0.84
512 0.77
513 0.73
514 0.68
515 0.61
516 0.59
517 0.54
518 0.49
519 0.46
520 0.44
521 0.38
522 0.35
523 0.35
524 0.34
525 0.32
526 0.27
527 0.24
528 0.3
529 0.29
530 0.25
531 0.25
532 0.17
533 0.16
534 0.15
535 0.14
536 0.07
537 0.08
538 0.1
539 0.09
540 0.1
541 0.09
542 0.1
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.09
556 0.13
557 0.15
558 0.15
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.12
564 0.08
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.04
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.14
583 0.16
584 0.19
585 0.21
586 0.23
587 0.26
588 0.3
589 0.31
590 0.3
591 0.34
592 0.33
593 0.38
594 0.42
595 0.44
596 0.48
597 0.56
598 0.63
599 0.67