FuNGI

A0A4Q4VYS2

Protein Details

Accession

A0A4Q4VYS2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
150-169	IPPHLRRRQEQPSRDKNQQD	Hydrophilic
724-745	RSPHQKTPSKHRRKASAQPDVS	Hydrophilic
835-857	YYVDYNKRKRKISQPLPGKESNF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
263-269	KKAAKKK
722-737	ANRSPHQKTPSKHRRK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10, pero 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036412 HAD-like_sf IPR023214 HAD_sf IPR040450 TFIIF_beta_HTH IPR040504 TFIIF_beta_N IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF12710 HAD PF02270 TFIIF_beta PF17683 TFIIF_beta_N
CDD	cd07980 TFIIF_beta

Amino Acid Sequences

MASTSQVKPESGIKNDPDDVKPSPAALSDDDIYEDAGDLEFYTDNPAPDNYAGNVYLTHVPKYLYDAWVHLDDDAEIRIGTIRQWNEVGPDGQPRQRIAMLLDHRQPEHQNVPKEYNLDVKDMQLINTFMFTEQDLPGYKNKSQGANRNIPPHLRRRQEQPSRDKNQQDANAGVKKRYQPYYRKAIPKKTVLAGKFAHELNCQPVMNAETRHILTTRASDAMKPKATTKMMAAARGMPSGIIQAGSFAPDKFSTLVRPLADAKKAAKKKQEERAARLSQSELRDRIFQCYDRFNYWSMKAFKQTLNQPEAWLRENLEELAVLHKTGRFANHWELKPEYKRGNLQGVESAAPDLGPEGDESDFDADDDNVEMEDKPVSQSSPPPFSQLSPIAISHNHSPPPPAMSIFLDFDGTITAQDTIGELAGFALRLQRSDAGRDLSCEWDAVVQAYIDDYRAGADGHHTPAAARLEPAQEVEFLRALKHLETCSLDRVRRCGLFRGIGGGAFREAGRALVANGTINLRPGFREFVDVRAREGWRVWVVSVNWSASFIEGACGHPGITVVANDVREDGSVAGPAILNRGGGEPRTLTNSQDKLDVMEAVLRQESLADKLSVYVGDSNTDLECLLAAHRGIVIADSPDTTLLETLRRIGKKAPHVREADGISTFLLEKSNYLVIMSRSGKPAKGKEKVNDKSRDPYIEEPIEPSDNPAYYGRADKSSSKPANRSPHQKTPSKHRRKASAQPDVSGPSPAAPIVPPPAPDPPLPALYALSVTPDTSLAASYTPPQALVIPSVVPDPPPSLESAWRAHQLPHDMFWKQIKERYGFESWYEPEQVDYYVDYNKRKRKISQPLPGKESNFVAYFLQLDFPITRRRRLSSILRDLDDLYTQYSKKNKLDLGYKPGYEIRLMDPEDPEGEVLETMWDPPTAVWDLNDGRYRVNKMKGQYDHTTEGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.49
3	0.52
4	0.46
5	0.44
6	0.42
7	0.4
8	0.37
9	0.32
10	0.29
11	0.26
12	0.26
13	0.23
14	0.24
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.19
19	0.17
20	0.14
21	0.13
22	0.09
23	0.08
24	0.07
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.07
29	0.13
30	0.14
31	0.15
32	0.17
33	0.17
34	0.19
35	0.2
36	0.22
37	0.17
38	0.19
39	0.19
40	0.17
41	0.17
42	0.17
43	0.23
44	0.22
45	0.23
46	0.21
47	0.21
48	0.21
49	0.28
50	0.28
51	0.24
52	0.24
53	0.24
54	0.26
55	0.28
56	0.28
57	0.21
58	0.18
59	0.15
60	0.15
61	0.14
62	0.11
63	0.08
64	0.08
65	0.1
66	0.09
67	0.11
68	0.17
69	0.18
70	0.2
71	0.22
72	0.22
73	0.24
74	0.27
75	0.26
76	0.21
77	0.28
78	0.3
79	0.33
80	0.36
81	0.34
82	0.34
83	0.34
84	0.34
85	0.28
86	0.32
87	0.34
88	0.37
89	0.42
90	0.42
91	0.41
92	0.44
93	0.44
94	0.42
95	0.46
96	0.46
97	0.48
98	0.5
99	0.54
100	0.53
101	0.52
102	0.47
103	0.46
104	0.4
105	0.37
106	0.32
107	0.28
108	0.31
109	0.3
110	0.29
111	0.24
112	0.23
113	0.19
114	0.19
115	0.18
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.11
121	0.13
122	0.14
123	0.16
124	0.21
125	0.25
126	0.27
127	0.3
128	0.34
129	0.4
130	0.45
131	0.53
132	0.57
133	0.62
134	0.65
135	0.66
136	0.65
137	0.64
138	0.63
139	0.63
140	0.63
141	0.61
142	0.6
143	0.62
144	0.7
145	0.73
146	0.77
147	0.78
148	0.79
149	0.78
150	0.83
151	0.78
152	0.73
153	0.71
154	0.67
155	0.6
156	0.53
157	0.52
158	0.51
159	0.48
160	0.44
161	0.4
162	0.42
163	0.44
164	0.49
165	0.51
166	0.53
167	0.59
168	0.68
169	0.72
170	0.76
171	0.78
172	0.8
173	0.79
174	0.76
175	0.74
176	0.69
177	0.68
178	0.59
179	0.56
180	0.47
181	0.43
182	0.39
183	0.36
184	0.32
185	0.26
186	0.26
187	0.24
188	0.27
189	0.24
190	0.2
191	0.21
192	0.21
193	0.22
194	0.22
195	0.19
196	0.19
197	0.19
198	0.21
199	0.2
200	0.19
201	0.17
202	0.19
203	0.19
204	0.19
205	0.18
206	0.2
207	0.25
208	0.31
209	0.34
210	0.32
211	0.32
212	0.36
213	0.38
214	0.36
215	0.32
216	0.33
217	0.31
218	0.32
219	0.3
220	0.26
221	0.26
222	0.25
223	0.23
224	0.14
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.07
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.1
236	0.1
237	0.12
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.16
242	0.2
243	0.18
244	0.2
245	0.24
246	0.27
247	0.28
248	0.28
249	0.3
250	0.36
251	0.42
252	0.46
253	0.49
254	0.55
255	0.61
256	0.68
257	0.74
258	0.71
259	0.72
260	0.75
261	0.71
262	0.63
263	0.56
264	0.49
265	0.44
266	0.41
267	0.4
268	0.32
269	0.29
270	0.34
271	0.34
272	0.36
273	0.35
274	0.34
275	0.31
276	0.36
277	0.37
278	0.34
279	0.35
280	0.32
281	0.32
282	0.31
283	0.36
284	0.34
285	0.33
286	0.35
287	0.37
288	0.37
289	0.39
290	0.44
291	0.43
292	0.43
293	0.41
294	0.38
295	0.38
296	0.38
297	0.34
298	0.28
299	0.22
300	0.18
301	0.19
302	0.17
303	0.13
304	0.11
305	0.09
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.11
313	0.13
314	0.13
315	0.17
316	0.26
317	0.34
318	0.34
319	0.36
320	0.38
321	0.42
322	0.43
323	0.45
324	0.39
325	0.35
326	0.38
327	0.39
328	0.43
329	0.38
330	0.35
331	0.32
332	0.3
333	0.27
334	0.22
335	0.19
336	0.11
337	0.1
338	0.08
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.14
366	0.17
367	0.22
368	0.23
369	0.25
370	0.25
371	0.25
372	0.28
373	0.24
374	0.23
375	0.19
376	0.19
377	0.17
378	0.17
379	0.19
380	0.18
381	0.19
382	0.18
383	0.17
384	0.18
385	0.18
386	0.2
387	0.18
388	0.15
389	0.13
390	0.13
391	0.15
392	0.14
393	0.14
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.08
398	0.07
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.08
417	0.11
418	0.12
419	0.14
420	0.16
421	0.16
422	0.16
423	0.18
424	0.18
425	0.16
426	0.16
427	0.14
428	0.12
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.06
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.12
451	0.14
452	0.12
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.08
468	0.1
469	0.09
470	0.1
471	0.12
472	0.13
473	0.18
474	0.21
475	0.23
476	0.22
477	0.24
478	0.26
479	0.26
480	0.27
481	0.26
482	0.25
483	0.24
484	0.23
485	0.24
486	0.21
487	0.18
488	0.17
489	0.12
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.07
504	0.07
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.1
510	0.11
511	0.1
512	0.16
513	0.15
514	0.2
515	0.27
516	0.26
517	0.27
518	0.29
519	0.29
520	0.25
521	0.25
522	0.21
523	0.16
524	0.17
525	0.15
526	0.14
527	0.14
528	0.16
529	0.17
530	0.15
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.1
535	0.1
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.06
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.08
556	0.07
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.14
574	0.15
575	0.16
576	0.22
577	0.24
578	0.24
579	0.25
580	0.24
581	0.2
582	0.2
583	0.18
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.1
588	0.1
589	0.08
590	0.07
591	0.08
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.09
607	0.09
608	0.08
609	0.06
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.08
631	0.08
632	0.11
633	0.17
634	0.18
635	0.19
636	0.24
637	0.3
638	0.39
639	0.48
640	0.51
641	0.52
642	0.54
643	0.55
644	0.54
645	0.5
646	0.41
647	0.32
648	0.26
649	0.18
650	0.16
651	0.14
652	0.1
653	0.09
654	0.07
655	0.07
656	0.09
657	0.1
658	0.09
659	0.09
660	0.11
661	0.1
662	0.17
663	0.2
664	0.19
665	0.23
666	0.25
667	0.27
668	0.31
669	0.39
670	0.41
671	0.46
672	0.5
673	0.54
674	0.63
675	0.69
676	0.72
677	0.71
678	0.65
679	0.65
680	0.63
681	0.59
682	0.52
683	0.48
684	0.45
685	0.41
686	0.38
687	0.33
688	0.32
689	0.3
690	0.25
691	0.24
692	0.2
693	0.17
694	0.19
695	0.17
696	0.16
697	0.16
698	0.2
699	0.19
700	0.2
701	0.22
702	0.25
703	0.3
704	0.39
705	0.45
706	0.46
707	0.5
708	0.55
709	0.64
710	0.66
711	0.71
712	0.68
713	0.72
714	0.73
715	0.75
716	0.71
717	0.72
718	0.76
719	0.77
720	0.77
721	0.73
722	0.76
723	0.77
724	0.83
725	0.82
726	0.81
727	0.72
728	0.66
729	0.61
730	0.54
731	0.47
732	0.37
733	0.27
734	0.17
735	0.15
736	0.13
737	0.11
738	0.08
739	0.1
740	0.12
741	0.14
742	0.14
743	0.16
744	0.2
745	0.22
746	0.22
747	0.25
748	0.25
749	0.25
750	0.24
751	0.22
752	0.19
753	0.17
754	0.17
755	0.12
756	0.11
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.09
762	0.08
763	0.09
764	0.07
765	0.07
766	0.08
767	0.1
768	0.12
769	0.12
770	0.12
771	0.12
772	0.13
773	0.13
774	0.14
775	0.13
776	0.1
777	0.11
778	0.12
779	0.12
780	0.11
781	0.11
782	0.12
783	0.12
784	0.13
785	0.15
786	0.15
787	0.19
788	0.22
789	0.24
790	0.26
791	0.29
792	0.29
793	0.3
794	0.32
795	0.37
796	0.35
797	0.35
798	0.36
799	0.32
800	0.35
801	0.39
802	0.41
803	0.36
804	0.4
805	0.42
806	0.41
807	0.43
808	0.46
809	0.44
810	0.39
811	0.37
812	0.39
813	0.35
814	0.35
815	0.33
816	0.27
817	0.24
818	0.23
819	0.22
820	0.16
821	0.15
822	0.13
823	0.19
824	0.24
825	0.3
826	0.38
827	0.46
828	0.52
829	0.57
830	0.64
831	0.68
832	0.74
833	0.77
834	0.79
835	0.81
836	0.82
837	0.83
838	0.81
839	0.72
840	0.64
841	0.56
842	0.49
843	0.4
844	0.32
845	0.26
846	0.21
847	0.2
848	0.17
849	0.16
850	0.12
851	0.13
852	0.13
853	0.15
854	0.25
855	0.27
856	0.33
857	0.37
858	0.41
859	0.44
860	0.5
861	0.58
862	0.58
863	0.66
864	0.65
865	0.62
866	0.59
867	0.56
868	0.5
869	0.42
870	0.32
871	0.25
872	0.23
873	0.22
874	0.26
875	0.31
876	0.37
877	0.4
878	0.46
879	0.46
880	0.48
881	0.56
882	0.58
883	0.61
884	0.6
885	0.55
886	0.52
887	0.51
888	0.45
889	0.38
890	0.33
891	0.28
892	0.29
893	0.31
894	0.3
895	0.28
896	0.29
897	0.28
898	0.27
899	0.22
900	0.16
901	0.14
902	0.11
903	0.1
904	0.1
905	0.09
906	0.1
907	0.11
908	0.1
909	0.1
910	0.09
911	0.14
912	0.14
913	0.14
914	0.14
915	0.19
916	0.22
917	0.28
918	0.34
919	0.3
920	0.32
921	0.37
922	0.44
923	0.45
924	0.51
925	0.49
926	0.5
927	0.59
928	0.61
929	0.63
930	0.63
931	0.63

A0A4Q4VYS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer