Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TA00

Protein Details
Accession A0A4Q4TA00    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-251VVAKARKKVLRRQPIRESKPFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-243KVVAKARKKVLRRQP
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11.5, nucl 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MVAPTSDPDSYFSGQNPRFLLKKGTPREYDTLEFHVSTKAGMLWAYINPNVAQVPPLLPMPTFPDPSYFQHGVTDKLGLSLDNYTKYERALKSYDRKQSLFLAQEKALAEVSTFLNQSVHPDYHWVYWKKVTLRGRLIALKNKFKPTAEKEPTATVPEDESDLKDEIIFESKNEDFVPEPLIQEFLPSKLVLQQKLYGNSSRLPLKPLKGDATIWYRKLAHLGPRALEKVVAKARKKVLRRQPIRESKPFSTICADLFEFSNAFDRRTKALIITCPVIRARISYTLKRKKHALTALMNAVAFLERQFHIKVKTIVLDGETAFGNRFRRWLLDIGISHEPSPPYTKEPAGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.37
4 0.36
5 0.37
6 0.38
7 0.43
8 0.4
9 0.49
10 0.53
11 0.59
12 0.59
13 0.63
14 0.65
15 0.63
16 0.59
17 0.52
18 0.48
19 0.43
20 0.39
21 0.34
22 0.31
23 0.25
24 0.21
25 0.18
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.12
47 0.18
48 0.21
49 0.23
50 0.21
51 0.24
52 0.28
53 0.32
54 0.39
55 0.33
56 0.29
57 0.33
58 0.33
59 0.32
60 0.29
61 0.27
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.12
66 0.12
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.27
75 0.24
76 0.26
77 0.29
78 0.35
79 0.43
80 0.51
81 0.58
82 0.56
83 0.56
84 0.53
85 0.53
86 0.51
87 0.47
88 0.43
89 0.38
90 0.33
91 0.35
92 0.33
93 0.29
94 0.23
95 0.17
96 0.13
97 0.11
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.13
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.16
109 0.17
110 0.2
111 0.28
112 0.27
113 0.25
114 0.29
115 0.33
116 0.33
117 0.39
118 0.41
119 0.4
120 0.43
121 0.43
122 0.43
123 0.45
124 0.46
125 0.47
126 0.47
127 0.48
128 0.48
129 0.5
130 0.48
131 0.43
132 0.47
133 0.46
134 0.51
135 0.47
136 0.46
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.38
141 0.31
142 0.2
143 0.16
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.13
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.29
184 0.25
185 0.23
186 0.24
187 0.25
188 0.25
189 0.22
190 0.23
191 0.24
192 0.25
193 0.27
194 0.28
195 0.28
196 0.25
197 0.25
198 0.26
199 0.31
200 0.32
201 0.29
202 0.29
203 0.27
204 0.25
205 0.28
206 0.26
207 0.26
208 0.29
209 0.3
210 0.29
211 0.32
212 0.33
213 0.29
214 0.29
215 0.21
216 0.21
217 0.26
218 0.32
219 0.31
220 0.36
221 0.44
222 0.49
223 0.54
224 0.58
225 0.61
226 0.65
227 0.72
228 0.74
229 0.77
230 0.81
231 0.83
232 0.82
233 0.79
234 0.7
235 0.7
236 0.62
237 0.53
238 0.46
239 0.39
240 0.31
241 0.28
242 0.25
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.13
247 0.12
248 0.19
249 0.16
250 0.18
251 0.2
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.26
256 0.21
257 0.25
258 0.28
259 0.28
260 0.29
261 0.27
262 0.28
263 0.27
264 0.26
265 0.21
266 0.19
267 0.19
268 0.25
269 0.3
270 0.36
271 0.47
272 0.56
273 0.6
274 0.63
275 0.67
276 0.62
277 0.66
278 0.65
279 0.62
280 0.58
281 0.59
282 0.58
283 0.53
284 0.47
285 0.38
286 0.3
287 0.22
288 0.16
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.12
293 0.15
294 0.18
295 0.21
296 0.27
297 0.3
298 0.3
299 0.33
300 0.31
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.2
305 0.18
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.16
310 0.18
311 0.16
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.25
316 0.29
317 0.29
318 0.33
319 0.34
320 0.37
321 0.42
322 0.39
323 0.36
324 0.35
325 0.32
326 0.27
327 0.31
328 0.28
329 0.27
330 0.31