Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4V8B8

Protein Details
Accession A0A4Q4V8B8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-280LKKAEEVRMRKRRERMAKNGDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-270MRKRRE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPTKKRKTASSAKTTADTDTAAPIEKNEQVAVNSEDTSKADSTEQPATKPEAHDEGKSPTTAPTTNSADKAKERMARFRALQARAKTSSDQNLQEATKESQRLATDPTALTALHRRRDIAAHKLLKAETEDRGEDFERKRAWDWTAEESERWDRRLRKKAAHRDNNAFQDYRAEGVKAYKRQVREMAAPDLERYARDKMAAIERAAASGGLDIVETEDGELVAVDRDGSFYSTADSTAFVENKPDKAAVDRLVSDLKKAEEVRMRKRRERMAKNGDEGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTADIRDSFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.61
3 0.54
4 0.45
5 0.36
6 0.26
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.16
11 0.15
12 0.18
13 0.18
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.17
18 0.21
19 0.22
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.2
26 0.16
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.21
31 0.29
32 0.29
33 0.27
34 0.3
35 0.33
36 0.34
37 0.33
38 0.32
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.33
43 0.34
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.23
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.23
52 0.27
53 0.3
54 0.33
55 0.34
56 0.33
57 0.34
58 0.37
59 0.37
60 0.37
61 0.37
62 0.42
63 0.44
64 0.47
65 0.46
66 0.5
67 0.52
68 0.5
69 0.55
70 0.49
71 0.51
72 0.48
73 0.49
74 0.43
75 0.4
76 0.41
77 0.39
78 0.37
79 0.33
80 0.34
81 0.31
82 0.3
83 0.29
84 0.24
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.19
100 0.22
101 0.24
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.31
106 0.34
107 0.34
108 0.38
109 0.37
110 0.37
111 0.39
112 0.37
113 0.33
114 0.31
115 0.25
116 0.18
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.18
121 0.18
122 0.2
123 0.19
124 0.22
125 0.21
126 0.22
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.25
132 0.25
133 0.28
134 0.27
135 0.25
136 0.26
137 0.31
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.31
142 0.4
143 0.5
144 0.52
145 0.54
146 0.63
147 0.71
148 0.77
149 0.79
150 0.75
151 0.72
152 0.74
153 0.7
154 0.62
155 0.52
156 0.4
157 0.34
158 0.28
159 0.22
160 0.17
161 0.11
162 0.1
163 0.15
164 0.2
165 0.21
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.31
170 0.35
171 0.33
172 0.33
173 0.33
174 0.33
175 0.31
176 0.3
177 0.27
178 0.25
179 0.21
180 0.17
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.21
188 0.23
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.16
195 0.1
196 0.07
197 0.07
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.19
229 0.2
230 0.21
231 0.22
232 0.21
233 0.18
234 0.21
235 0.25
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.23
240 0.29
241 0.28
242 0.26
243 0.25
244 0.22
245 0.24
246 0.24
247 0.28
248 0.31
249 0.39
250 0.48
251 0.55
252 0.62
253 0.65
254 0.73
255 0.77
256 0.79
257 0.81
258 0.81
259 0.83
260 0.82
261 0.8
262 0.75
263 0.65
264 0.55
265 0.45
266 0.38
267 0.28
268 0.22
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.26
273 0.27
274 0.31
275 0.38
276 0.48
277 0.5
278 0.57
279 0.65
280 0.66
281 0.73
282 0.74
283 0.76
284 0.7
285 0.7
286 0.7
287 0.63
288 0.61
289 0.57
290 0.54
291 0.5
292 0.48
293 0.48
294 0.44
295 0.43
296 0.39