Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4USA4

Protein Details
Accession A0A4Q4USA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-196ASRRPPPPRGGSRPRQQQKRNCEACHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-186AASRRPPPPRGGSRPR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 4, pero 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR009030  Growth_fac_rcpt_cys_sf  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd22584  Rcat_RBR_unk  
Amino Acid Sequences MDVVMASRMDDEDIDLIIQLLQEDCQVAMDAAQGKGKQPEGTETDQQLAFQLLLEELQNAETVAMDRRMTRSIQQAIQADSDALARLRNDERQAQSDRDISIALSNGQVVPAAAPPQDAPQTSGEEDDFLDKLSCIYVTGIEDEADTDSGDDGEETAATSWKRRPESSAWAASRRPPPPRGGSRPRQQQKRNCEACGDRKHFAELARAPCRHEYCRGCLGRLFENAMVDETLFPPRCCKQPIPLHQNLVFLDADVARRFRGKAVEFSTPNRTYCHDGRCRAFVPPSRYVHDAEDGGSVAATARCGECGARTCTACKGAAHRGDCPHDVQLQQVIRLAREQGWQRCRNCWGMVELNMGCNHMTCRCGFQFCYVCGSRWKTCQCEQWDERRLLERAEQIDARDRDRDRDDRDAAPAAAAPMEVVVPAEAAVAPREEAVPPAEPTVVRREDVVLPADAALAARVEEALLQAEAAPRRQLEGARGARIEMLMRDLVANHECEHELWRGRRGPRACEECGDEMPLFIYECRQCHIMACRRCRYHRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.11
17 0.13
18 0.14
19 0.17
20 0.17
21 0.2
22 0.24
23 0.26
24 0.25
25 0.24
26 0.29
27 0.32
28 0.37
29 0.41
30 0.38
31 0.4
32 0.38
33 0.36
34 0.3
35 0.25
36 0.19
37 0.13
38 0.12
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.1
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.18
55 0.2
56 0.22
57 0.25
58 0.3
59 0.34
60 0.36
61 0.4
62 0.41
63 0.4
64 0.39
65 0.35
66 0.27
67 0.21
68 0.19
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.14
74 0.17
75 0.21
76 0.25
77 0.31
78 0.35
79 0.39
80 0.44
81 0.42
82 0.43
83 0.41
84 0.37
85 0.3
86 0.27
87 0.21
88 0.18
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.12
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.18
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.15
148 0.21
149 0.25
150 0.26
151 0.31
152 0.33
153 0.43
154 0.47
155 0.52
156 0.48
157 0.49
158 0.49
159 0.51
160 0.53
161 0.49
162 0.48
163 0.42
164 0.45
165 0.5
166 0.58
167 0.61
168 0.63
169 0.67
170 0.71
171 0.78
172 0.82
173 0.83
174 0.82
175 0.81
176 0.82
177 0.84
178 0.79
179 0.69
180 0.66
181 0.62
182 0.62
183 0.63
184 0.58
185 0.49
186 0.45
187 0.46
188 0.42
189 0.37
190 0.35
191 0.3
192 0.33
193 0.38
194 0.38
195 0.38
196 0.41
197 0.44
198 0.39
199 0.41
200 0.37
201 0.35
202 0.44
203 0.43
204 0.39
205 0.37
206 0.38
207 0.33
208 0.31
209 0.28
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.16
214 0.13
215 0.1
216 0.09
217 0.07
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.17
223 0.21
224 0.25
225 0.25
226 0.29
227 0.38
228 0.48
229 0.54
230 0.56
231 0.57
232 0.54
233 0.55
234 0.46
235 0.39
236 0.29
237 0.2
238 0.16
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.15
248 0.15
249 0.2
250 0.24
251 0.3
252 0.3
253 0.33
254 0.39
255 0.36
256 0.35
257 0.3
258 0.29
259 0.28
260 0.3
261 0.36
262 0.34
263 0.37
264 0.38
265 0.41
266 0.4
267 0.36
268 0.37
269 0.34
270 0.34
271 0.37
272 0.38
273 0.37
274 0.38
275 0.37
276 0.34
277 0.3
278 0.24
279 0.17
280 0.15
281 0.12
282 0.1
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.1
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.2
302 0.17
303 0.19
304 0.24
305 0.29
306 0.3
307 0.31
308 0.33
309 0.35
310 0.35
311 0.32
312 0.27
313 0.24
314 0.23
315 0.2
316 0.22
317 0.19
318 0.18
319 0.2
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.18
326 0.24
327 0.29
328 0.37
329 0.44
330 0.45
331 0.48
332 0.49
333 0.48
334 0.43
335 0.36
336 0.32
337 0.28
338 0.28
339 0.29
340 0.25
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.17
345 0.14
346 0.13
347 0.1
348 0.11
349 0.09
350 0.15
351 0.16
352 0.19
353 0.19
354 0.24
355 0.27
356 0.27
357 0.33
358 0.29
359 0.28
360 0.32
361 0.37
362 0.34
363 0.37
364 0.41
365 0.41
366 0.44
367 0.51
368 0.51
369 0.55
370 0.57
371 0.59
372 0.62
373 0.58
374 0.56
375 0.53
376 0.48
377 0.4
378 0.39
379 0.34
380 0.28
381 0.3
382 0.29
383 0.25
384 0.33
385 0.33
386 0.31
387 0.32
388 0.31
389 0.33
390 0.38
391 0.44
392 0.4
393 0.46
394 0.48
395 0.43
396 0.45
397 0.43
398 0.36
399 0.3
400 0.25
401 0.17
402 0.13
403 0.11
404 0.08
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.11
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.15
427 0.15
428 0.17
429 0.24
430 0.23
431 0.21
432 0.21
433 0.23
434 0.24
435 0.27
436 0.27
437 0.19
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.13
442 0.1
443 0.08
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.11
456 0.13
457 0.15
458 0.16
459 0.15
460 0.18
461 0.2
462 0.21
463 0.21
464 0.3
465 0.33
466 0.35
467 0.35
468 0.33
469 0.32
470 0.31
471 0.28
472 0.18
473 0.17
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.12
478 0.16
479 0.16
480 0.17
481 0.14
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.2
486 0.23
487 0.29
488 0.31
489 0.38
490 0.43
491 0.46
492 0.54
493 0.56
494 0.57
495 0.59
496 0.63
497 0.59
498 0.55
499 0.57
500 0.52
501 0.49
502 0.45
503 0.35
504 0.28
505 0.26
506 0.22
507 0.18
508 0.13
509 0.19
510 0.19
511 0.2
512 0.23
513 0.24
514 0.23
515 0.28
516 0.38
517 0.41
518 0.47
519 0.55
520 0.62
521 0.69