Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VQA3

Protein Details
Accession A0A4Q4VQA3    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-77DAFGTQGRVTRRKRERRARAAVKLRGQPGHydrophilic
652-688DKMICRKCYARLPPRATNCRKRKCGHTNQLRPKKKLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-73TRRKRERRARAAVKLR
540-557AKERREKGKGEEGKGKGR
682-688RPKKKLK
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto_nucl 8.5, cyto 6, mito 4, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038587  L40e_sf  
IPR001975  Ribosomal_L40e  
IPR033599  TAF1B/Rrn7  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01020  Ribosomal_L40e  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01803  Ubl_ubiquitin  
Amino Acid Sequences MAPTKYHKFRDGERCDECGARQWYAENALRYCRNGHRLEGFAAHEEDEDAFGTQGRVTRRKRERRARAAVKLRGQPGRELYLEVLQLVLRRLVSALVGDGDGALGLPPELEDTVRSLWVLRVRNLPLRVEGERSSGASDMEGGDGGTGGETDIDTVGSEASTATARTWESDARRRWKLPKLIDALALCYLGCLVRRLPVTTADFHWWAQRGDIEFLAAINTVPKNVRDRLPAEYHRALQVQDHIRPGHLQATVQQLVISFHANFDLRFPPLNYVPILVQYIKHLLLPVETYTAAKCLAEILDADFSYPHGGRRIQSMSNPEILLAALVVVAAKLLYSPDGTERAPRGEHDPRRLRLDWAVWRENIEDRSRQAPTHLRPGEEYKVDPNDALTMDKTKLDDYMDWFEKMWIGDADPRTAEAFREPFTNQKRISSPAPRTTTGEAVGRDGESTRRYRAVNRTVKVVEAAPDSPAGKEEEEEEDTRQRQPRDSCPVWRSEEDLPDVARLLYSEAAEMAAVPLASLVRAAAQAERRLEVWCTQRAKERREKGKGEEGKGKGRAVLVQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLKALASKFNCDKMICRKCYARLPPRATNCRKRKCGHTNQLRPKKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.6
3 0.58
4 0.49
5 0.47
6 0.43
7 0.35
8 0.32
9 0.3
10 0.3
11 0.35
12 0.39
13 0.35
14 0.33
15 0.39
16 0.41
17 0.41
18 0.44
19 0.45
20 0.48
21 0.46
22 0.49
23 0.48
24 0.48
25 0.49
26 0.47
27 0.41
28 0.36
29 0.34
30 0.29
31 0.23
32 0.21
33 0.18
34 0.15
35 0.13
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.13
42 0.2
43 0.28
44 0.34
45 0.44
46 0.55
47 0.65
48 0.75
49 0.82
50 0.86
51 0.88
52 0.94
53 0.93
54 0.93
55 0.92
56 0.89
57 0.86
58 0.82
59 0.79
60 0.74
61 0.65
62 0.6
63 0.55
64 0.51
65 0.43
66 0.38
67 0.33
68 0.3
69 0.29
70 0.23
71 0.19
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.14
105 0.2
106 0.24
107 0.25
108 0.3
109 0.34
110 0.41
111 0.43
112 0.41
113 0.39
114 0.39
115 0.38
116 0.36
117 0.32
118 0.29
119 0.28
120 0.26
121 0.23
122 0.19
123 0.18
124 0.13
125 0.13
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.12
155 0.16
156 0.22
157 0.3
158 0.39
159 0.45
160 0.51
161 0.55
162 0.6
163 0.64
164 0.67
165 0.65
166 0.66
167 0.64
168 0.59
169 0.58
170 0.51
171 0.44
172 0.36
173 0.29
174 0.19
175 0.13
176 0.12
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.12
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.21
186 0.23
187 0.24
188 0.26
189 0.25
190 0.26
191 0.24
192 0.27
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.15
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.08
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.12
211 0.16
212 0.19
213 0.22
214 0.25
215 0.27
216 0.31
217 0.38
218 0.4
219 0.42
220 0.42
221 0.4
222 0.38
223 0.36
224 0.31
225 0.25
226 0.29
227 0.26
228 0.26
229 0.28
230 0.26
231 0.25
232 0.26
233 0.26
234 0.22
235 0.18
236 0.15
237 0.15
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.2
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.18
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.17
300 0.2
301 0.19
302 0.21
303 0.25
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.2
308 0.17
309 0.15
310 0.12
311 0.07
312 0.05
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.19
334 0.26
335 0.31
336 0.38
337 0.44
338 0.45
339 0.51
340 0.51
341 0.46
342 0.39
343 0.41
344 0.37
345 0.36
346 0.37
347 0.31
348 0.31
349 0.3
350 0.3
351 0.27
352 0.23
353 0.19
354 0.18
355 0.21
356 0.22
357 0.2
358 0.22
359 0.26
360 0.26
361 0.35
362 0.35
363 0.32
364 0.32
365 0.37
366 0.37
367 0.3
368 0.29
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.16
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.19
388 0.2
389 0.2
390 0.2
391 0.19
392 0.19
393 0.18
394 0.15
395 0.09
396 0.08
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.14
409 0.14
410 0.22
411 0.26
412 0.33
413 0.31
414 0.33
415 0.35
416 0.36
417 0.42
418 0.43
419 0.45
420 0.46
421 0.5
422 0.48
423 0.49
424 0.47
425 0.42
426 0.35
427 0.32
428 0.23
429 0.2
430 0.19
431 0.16
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.16
437 0.17
438 0.2
439 0.21
440 0.27
441 0.36
442 0.44
443 0.49
444 0.47
445 0.51
446 0.48
447 0.47
448 0.42
449 0.34
450 0.25
451 0.19
452 0.19
453 0.13
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.13
463 0.16
464 0.17
465 0.19
466 0.22
467 0.23
468 0.28
469 0.32
470 0.3
471 0.33
472 0.37
473 0.43
474 0.48
475 0.51
476 0.54
477 0.52
478 0.56
479 0.54
480 0.5
481 0.46
482 0.4
483 0.39
484 0.34
485 0.32
486 0.27
487 0.22
488 0.22
489 0.17
490 0.13
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.09
513 0.13
514 0.17
515 0.19
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.22
520 0.24
521 0.25
522 0.29
523 0.32
524 0.33
525 0.42
526 0.48
527 0.55
528 0.6
529 0.65
530 0.68
531 0.73
532 0.76
533 0.73
534 0.77
535 0.76
536 0.72
537 0.71
538 0.64
539 0.63
540 0.61
541 0.55
542 0.46
543 0.39
544 0.36
545 0.3
546 0.3
547 0.24
548 0.24
549 0.23
550 0.22
551 0.21
552 0.19
553 0.17
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.13
559 0.17
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.14
564 0.15
565 0.14
566 0.15
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.13
572 0.12
573 0.15
574 0.18
575 0.22
576 0.27
577 0.31
578 0.36
579 0.36
580 0.45
581 0.49
582 0.49
583 0.48
584 0.48
585 0.48
586 0.47
587 0.45
588 0.36
589 0.33
590 0.34
591 0.32
592 0.3
593 0.31
594 0.26
595 0.3
596 0.31
597 0.29
598 0.26
599 0.25
600 0.24
601 0.2
602 0.2
603 0.17
604 0.23
605 0.26
606 0.27
607 0.3
608 0.28
609 0.27
610 0.27
611 0.3
612 0.27
613 0.26
614 0.22
615 0.24
616 0.28
617 0.29
618 0.31
619 0.27
620 0.23
621 0.2
622 0.21
623 0.18
624 0.16
625 0.18
626 0.15
627 0.18
628 0.18
629 0.17
630 0.17
631 0.16
632 0.23
633 0.22
634 0.31
635 0.33
636 0.37
637 0.42
638 0.42
639 0.48
640 0.5
641 0.57
642 0.53
643 0.56
644 0.57
645 0.6
646 0.69
647 0.73
648 0.72
649 0.72
650 0.76
651 0.79
652 0.83
653 0.87
654 0.87
655 0.87
656 0.88
657 0.88
658 0.89
659 0.86
660 0.86
661 0.86
662 0.87
663 0.88
664 0.88
665 0.89
666 0.91
667 0.96
668 0.94