FuNGI

J8PW88

Protein Details

Accession

J8PW88

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
269-296	VGDFKKLKIRKRKIKDQRSSKPRKVKIA	Basic
474-495	LKQANETKPIRKKVRNETHTDT	Hydrophilic
550-582	AYKKLSQKFHGTKSNKKKKAKMHSRIEARKSAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
273-294	KKLKIRKRKIKDQRSSKPRKVK
558-578	FHGTKSNKKKKAKMHSRIEAR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MNKQESLSIAETNEIREKLGLKPIPLTQERDAKLKQSLSIEETNKLRISLGLKPIVPQGNVNPPGTDVHRTAKVNSLRQKIAKFKKINTSLRKDDLNEESNANDDNSWLDNLGAITTPGEVNPSKILLSDENKEKDGEDVDLHNVQVSYNFEQLGPENETILTLKESSIFDDAGSSDVLENEKVAQETVDKEKLRLRQMNKDRRQGRMNLHISSLDIEEEEEYSHTNIPLTIGAEQGIINTSKTKSAKLPMGKIKVKFDDTDDFSDEDVGDFKKLKIRKRKIKDQRSSKPRKVKIADRMEVVKLLDEDEDLSWMDDEQPITMINTKPTSKKPTENAEHLKKEVERVTFEEKQRAEDILRMRESTNNFVIDEKTAFLDTLDMSFPETSDTANQALLNDNGETNVGNITYQDFKVGGDCSKTSGYVNESADEEHNHDPPNFFSGLASTLGLLRKKNVLPTEYADPNVKEQHKARILKQANETKPIRKKVRNETHTDTNTYTAEELYSLNRFEGSEVSNEVSNTENKKLDHYDPEVQLVYRDEKGNQLTTKEAYKKLSQKFHGTKSNKKKKAKMHSRIEARKSAFEIDNTFGFGNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.23
4	0.25
5	0.25
6	0.34
7	0.33
8	0.29
9	0.33
10	0.36
11	0.43
12	0.45
13	0.47
14	0.43
15	0.49
16	0.5
17	0.53
18	0.51
19	0.46
20	0.49
21	0.45
22	0.43
23	0.39
24	0.4
25	0.39
26	0.45
27	0.43
28	0.42
29	0.42
30	0.42
31	0.38
32	0.35
33	0.3
34	0.25
35	0.26
36	0.28
37	0.33
38	0.34
39	0.33
40	0.34
41	0.4
42	0.41
43	0.38
44	0.34
45	0.32
46	0.37
47	0.4
48	0.4
49	0.33
50	0.3
51	0.33
52	0.33
53	0.33
54	0.26
55	0.27
56	0.33
57	0.34
58	0.35
59	0.4
60	0.44
61	0.49
62	0.54
63	0.56
64	0.56
65	0.6
66	0.65
67	0.67
68	0.69
69	0.71
70	0.68
71	0.68
72	0.72
73	0.77
74	0.8
75	0.79
76	0.78
77	0.75
78	0.73
79	0.71
80	0.63
81	0.59
82	0.56
83	0.5
84	0.42
85	0.36
86	0.32
87	0.29
88	0.27
89	0.22
90	0.15
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.1
96	0.09
97	0.09
98	0.09
99	0.1
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.07
104	0.07
105	0.06
106	0.1
107	0.09
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.12
112	0.13
113	0.15
114	0.17
115	0.2
116	0.25
117	0.31
118	0.33
119	0.34
120	0.34
121	0.31
122	0.28
123	0.26
124	0.21
125	0.15
126	0.14
127	0.17
128	0.17
129	0.17
130	0.16
131	0.15
132	0.13
133	0.13
134	0.16
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.15
139	0.16
140	0.17
141	0.18
142	0.18
143	0.15
144	0.15
145	0.14
146	0.15
147	0.14
148	0.14
149	0.11
150	0.08
151	0.08
152	0.1
153	0.11
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.1
161	0.09
162	0.08
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.08
174	0.11
175	0.16
176	0.22
177	0.21
178	0.23
179	0.28
180	0.33
181	0.4
182	0.44
183	0.44
184	0.48
185	0.58
186	0.68
187	0.71
188	0.75
189	0.71
190	0.69
191	0.7
192	0.66
193	0.61
194	0.61
195	0.57
196	0.49
197	0.46
198	0.4
199	0.35
200	0.3
201	0.24
202	0.13
203	0.09
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.08
229	0.13
230	0.14
231	0.16
232	0.18
233	0.22
234	0.28
235	0.31
236	0.38
237	0.41
238	0.48
239	0.51
240	0.51
241	0.51
242	0.47
243	0.45
244	0.38
245	0.34
246	0.31
247	0.3
248	0.3
249	0.27
250	0.24
251	0.22
252	0.22
253	0.18
254	0.12
255	0.1
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.13
261	0.17
262	0.25
263	0.35
264	0.45
265	0.54
266	0.62
267	0.73
268	0.79
269	0.86
270	0.88
271	0.88
272	0.88
273	0.89
274	0.9
275	0.87
276	0.86
277	0.8
278	0.79
279	0.74
280	0.71
281	0.7
282	0.7
283	0.63
284	0.55
285	0.52
286	0.43
287	0.39
288	0.31
289	0.22
290	0.12
291	0.11
292	0.08
293	0.06
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.13
312	0.15
313	0.18
314	0.23
315	0.3
316	0.31
317	0.36
318	0.4
319	0.46
320	0.5
321	0.54
322	0.58
323	0.59
324	0.57
325	0.52
326	0.49
327	0.4
328	0.39
329	0.35
330	0.28
331	0.22
332	0.24
333	0.3
334	0.34
335	0.35
336	0.37
337	0.33
338	0.34
339	0.33
340	0.31
341	0.24
342	0.22
343	0.25
344	0.25
345	0.26
346	0.24
347	0.23
348	0.26
349	0.28
350	0.28
351	0.26
352	0.21
353	0.21
354	0.2
355	0.21
356	0.18
357	0.16
358	0.12
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.08
375	0.1
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.07
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.11
400	0.13
401	0.12
402	0.12
403	0.12
404	0.14
405	0.15
406	0.15
407	0.14
408	0.15
409	0.17
410	0.2
411	0.2
412	0.19
413	0.19
414	0.19
415	0.2
416	0.19
417	0.2
418	0.17
419	0.18
420	0.19
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.21
425	0.17
426	0.15
427	0.13
428	0.12
429	0.13
430	0.13
431	0.12
432	0.08
433	0.1
434	0.14
435	0.17
436	0.16
437	0.16
438	0.21
439	0.23
440	0.29
441	0.31
442	0.29
443	0.3
444	0.34
445	0.39
446	0.35
447	0.36
448	0.33
449	0.29
450	0.31
451	0.35
452	0.33
453	0.32
454	0.32
455	0.4
456	0.46
457	0.49
458	0.49
459	0.52
460	0.56
461	0.57
462	0.63
463	0.63
464	0.58
465	0.62
466	0.62
467	0.61
468	0.65
469	0.68
470	0.69
471	0.67
472	0.73
473	0.75
474	0.83
475	0.81
476	0.8
477	0.78
478	0.79
479	0.74
480	0.69
481	0.59
482	0.51
483	0.44
484	0.37
485	0.29
486	0.19
487	0.16
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.15
498	0.14
499	0.14
500	0.15
501	0.17
502	0.18
503	0.17
504	0.17
505	0.17
506	0.2
507	0.22
508	0.25
509	0.28
510	0.27
511	0.32
512	0.37
513	0.39
514	0.41
515	0.44
516	0.47
517	0.44
518	0.48
519	0.44
520	0.39
521	0.36
522	0.32
523	0.29
524	0.25
525	0.25
526	0.22
527	0.27
528	0.31
529	0.35
530	0.34
531	0.33
532	0.33
533	0.34
534	0.41
535	0.42
536	0.43
537	0.41
538	0.47
539	0.54
540	0.59
541	0.66
542	0.64
543	0.68
544	0.72
545	0.76
546	0.78
547	0.76
548	0.78
549	0.8
550	0.85
551	0.84
552	0.85
553	0.85
554	0.85
555	0.89
556	0.9
557	0.89
558	0.89
559	0.89
560	0.91
561	0.92
562	0.89
563	0.86
564	0.79
565	0.73
566	0.65
567	0.61
568	0.53
569	0.46
570	0.43
571	0.38
572	0.35
573	0.32

J8PW88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer