Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PNX0

Protein Details
Accession J8PNX0    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-369SNSNDDNAKPRRRKIKCKNARSSPTPKPQVKHydrophilic
418-442ISLNFDTKNEPPKKKKPFYLIGLNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-356KPRRRKIKCK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MSFRFNEDVFGDNSFNERIREKLSTALNSPSKKKLDILKSGITVQKVDFPTIPQLEILDLDIITQPRSLAKGICKISCKDAMLRIQTVIESNLLLINEQDTPSFTTPRLINNGSFTIPITMTFSAIELEAITNIFVKNPGIGISFNDVDLDFKFDCSIKILQSTIERRLKESMHVVFKDVLPSLIFNTSQNWFTSHGEGTSTIPNKRDHHHQQTTMSRNVILDGSDFQDLSPINMLRLSSIVSSRSTLSLHSTVMNSLSAIPGYLERQNLYRFISRMPSLNNYYSSPSLPQSKASNISPSQLVKPFYCSHNLLPKAVLDSSQYELPTITKIQSRLFDRSNSNDDNAKPRRRKIKCKNARSSPTPKPQVKQNVGDETPTIETVTPTPVAIPVPMPEEQSPPYLTTIVSIRDKYVIPEEISLNFDTKNEPPKKKKPFYLIGLNSQDSSNNWKLGMEDSPPPYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.25
7 0.28
8 0.27
9 0.31
10 0.36
11 0.38
12 0.39
13 0.45
14 0.47
15 0.49
16 0.53
17 0.54
18 0.52
19 0.49
20 0.52
21 0.52
22 0.54
23 0.58
24 0.6
25 0.57
26 0.56
27 0.59
28 0.57
29 0.48
30 0.41
31 0.32
32 0.34
33 0.29
34 0.3
35 0.25
36 0.24
37 0.31
38 0.31
39 0.31
40 0.23
41 0.22
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.11
46 0.09
47 0.09
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.14
56 0.16
57 0.21
58 0.28
59 0.33
60 0.37
61 0.4
62 0.4
63 0.44
64 0.45
65 0.42
66 0.38
67 0.4
68 0.42
69 0.42
70 0.42
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.28
75 0.22
76 0.15
77 0.11
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.13
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.2
93 0.21
94 0.25
95 0.3
96 0.28
97 0.27
98 0.29
99 0.31
100 0.27
101 0.25
102 0.22
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.14
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.21
150 0.24
151 0.3
152 0.34
153 0.33
154 0.33
155 0.37
156 0.35
157 0.32
158 0.34
159 0.31
160 0.32
161 0.32
162 0.32
163 0.3
164 0.29
165 0.28
166 0.22
167 0.17
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.16
181 0.18
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.21
191 0.25
192 0.26
193 0.29
194 0.36
195 0.4
196 0.47
197 0.51
198 0.51
199 0.53
200 0.59
201 0.61
202 0.54
203 0.46
204 0.36
205 0.3
206 0.28
207 0.21
208 0.13
209 0.09
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.11
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.21
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.24
266 0.25
267 0.27
268 0.27
269 0.25
270 0.26
271 0.25
272 0.23
273 0.2
274 0.19
275 0.23
276 0.21
277 0.23
278 0.23
279 0.25
280 0.28
281 0.27
282 0.31
283 0.25
284 0.27
285 0.26
286 0.26
287 0.26
288 0.26
289 0.28
290 0.22
291 0.26
292 0.27
293 0.26
294 0.29
295 0.28
296 0.28
297 0.35
298 0.36
299 0.33
300 0.31
301 0.29
302 0.27
303 0.25
304 0.21
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.16
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.17
318 0.19
319 0.25
320 0.29
321 0.33
322 0.34
323 0.37
324 0.38
325 0.42
326 0.45
327 0.41
328 0.39
329 0.38
330 0.37
331 0.42
332 0.47
333 0.51
334 0.51
335 0.57
336 0.65
337 0.7
338 0.79
339 0.81
340 0.84
341 0.84
342 0.89
343 0.92
344 0.92
345 0.91
346 0.88
347 0.86
348 0.85
349 0.84
350 0.83
351 0.78
352 0.7
353 0.71
354 0.74
355 0.71
356 0.69
357 0.65
358 0.64
359 0.59
360 0.57
361 0.48
362 0.4
363 0.34
364 0.27
365 0.21
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.15
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.1
378 0.13
379 0.14
380 0.17
381 0.17
382 0.2
383 0.21
384 0.23
385 0.24
386 0.22
387 0.22
388 0.2
389 0.18
390 0.17
391 0.18
392 0.21
393 0.24
394 0.23
395 0.23
396 0.25
397 0.26
398 0.27
399 0.29
400 0.28
401 0.25
402 0.27
403 0.27
404 0.26
405 0.29
406 0.27
407 0.23
408 0.19
409 0.18
410 0.19
411 0.21
412 0.3
413 0.37
414 0.46
415 0.55
416 0.65
417 0.76
418 0.81
419 0.85
420 0.84
421 0.84
422 0.82
423 0.83
424 0.79
425 0.77
426 0.74
427 0.67
428 0.58
429 0.49
430 0.42
431 0.33
432 0.36
433 0.31
434 0.26
435 0.25
436 0.24
437 0.25
438 0.26
439 0.28
440 0.23
441 0.26