Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XA89

Protein Details
Accession A0A4V1XA89    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
615-643EDVDKVQRQMPRKVKRRRRIEDDTFEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
626-633RKVKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 11, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQETGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRVNMNNWMRYAAWELEQKEFKRARSIFERALDVDPTSVVLWIRYIEAEMKNRNVNHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIPGARQVFERWMSWEPDEAAWSAYIKLEKRYGEIQRARDIFERFTIVHPEPRNWLKWAKFEEEYGTSDLVRHVFGAAVESLGDEFVDEKLFVAYARFETKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSMGLHKAYTTFEKQFGDRSGVEDVILSKRRRLYEDQVKENPKNYDIWFDYARLEETSGDVDRARDVYERAVAQIPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMEANDINRAGQVYKLCLDLIPHKKFTFAKVWLLKAEFEIRQGRLTAARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYINLELKLFEFVRCRTLYEKHLEWNHANGQTWIKFAELERGLDDLERTRAIFELAISQPDLDMPELVWKAYIDFEEEEGEYDRTRALYERLLEKTGHVKVWISYAHFEVNVQEEDEEAGDEAEEDRPISEKAKARARRIFERAYRSMKENDLKEERVSLLNAWLSFERTHGSVEDVDKVQRQMPRKVKRRRRIEDDTFEEYIDYVFPADDEQKQAQLKMLAMAQAWKQSGGGMIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.18
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.26
30 0.24
31 0.22
32 0.27
33 0.22
34 0.24
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.45
47 0.54
48 0.6
49 0.61
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.76
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.61
62 0.61
63 0.52
64 0.46
65 0.42
66 0.34
67 0.28
68 0.27
69 0.28
70 0.33
71 0.4
72 0.39
73 0.44
74 0.46
75 0.43
76 0.48
77 0.47
78 0.47
79 0.48
80 0.54
81 0.51
82 0.5
83 0.52
84 0.45
85 0.46
86 0.4
87 0.32
88 0.25
89 0.19
90 0.16
91 0.13
92 0.12
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.13
101 0.18
102 0.24
103 0.28
104 0.31
105 0.36
106 0.37
107 0.44
108 0.46
109 0.45
110 0.46
111 0.48
112 0.47
113 0.45
114 0.49
115 0.42
116 0.36
117 0.31
118 0.27
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.23
154 0.25
155 0.25
156 0.26
157 0.23
158 0.21
159 0.21
160 0.18
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.16
169 0.2
170 0.2
171 0.23
172 0.3
173 0.33
174 0.4
175 0.44
176 0.45
177 0.48
178 0.49
179 0.48
180 0.46
181 0.43
182 0.35
183 0.3
184 0.29
185 0.22
186 0.23
187 0.26
188 0.23
189 0.28
190 0.28
191 0.28
192 0.31
193 0.34
194 0.35
195 0.32
196 0.37
197 0.34
198 0.39
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.37
203 0.37
204 0.33
205 0.32
206 0.26
207 0.22
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.14
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.16
242 0.22
243 0.23
244 0.29
245 0.28
246 0.34
247 0.39
248 0.39
249 0.38
250 0.33
251 0.33
252 0.28
253 0.29
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.4
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.22
280 0.22
281 0.18
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.2
290 0.18
291 0.2
292 0.23
293 0.25
294 0.29
295 0.33
296 0.37
297 0.41
298 0.48
299 0.53
300 0.57
301 0.61
302 0.59
303 0.57
304 0.49
305 0.39
306 0.35
307 0.28
308 0.27
309 0.22
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.05
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.18
381 0.27
382 0.29
383 0.31
384 0.3
385 0.34
386 0.35
387 0.37
388 0.36
389 0.29
390 0.34
391 0.35
392 0.36
393 0.35
394 0.35
395 0.31
396 0.26
397 0.27
398 0.18
399 0.19
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.2
404 0.19
405 0.22
406 0.25
407 0.24
408 0.24
409 0.24
410 0.23
411 0.24
412 0.28
413 0.22
414 0.2
415 0.18
416 0.18
417 0.23
418 0.24
419 0.23
420 0.18
421 0.19
422 0.22
423 0.21
424 0.22
425 0.19
426 0.22
427 0.26
428 0.29
429 0.36
430 0.35
431 0.35
432 0.31
433 0.28
434 0.25
435 0.23
436 0.21
437 0.15
438 0.15
439 0.15
440 0.2
441 0.19
442 0.21
443 0.22
444 0.25
445 0.29
446 0.32
447 0.33
448 0.34
449 0.38
450 0.4
451 0.38
452 0.38
453 0.38
454 0.34
455 0.33
456 0.29
457 0.29
458 0.26
459 0.25
460 0.21
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.21
465 0.18
466 0.18
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.17
471 0.17
472 0.11
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.09
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.11
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.12
509 0.12
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.15
516 0.19
517 0.24
518 0.27
519 0.28
520 0.28
521 0.28
522 0.33
523 0.31
524 0.28
525 0.23
526 0.22
527 0.2
528 0.24
529 0.25
530 0.2
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.19
535 0.19
536 0.16
537 0.18
538 0.16
539 0.14
540 0.13
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.07
546 0.06
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.12
557 0.18
558 0.23
559 0.3
560 0.4
561 0.47
562 0.54
563 0.6
564 0.65
565 0.68
566 0.69
567 0.71
568 0.68
569 0.7
570 0.69
571 0.69
572 0.65
573 0.6
574 0.58
575 0.57
576 0.57
577 0.51
578 0.52
579 0.51
580 0.5
581 0.47
582 0.45
583 0.39
584 0.34
585 0.32
586 0.24
587 0.22
588 0.23
589 0.22
590 0.22
591 0.2
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.18
596 0.15
597 0.17
598 0.15
599 0.17
600 0.18
601 0.2
602 0.24
603 0.23
604 0.25
605 0.27
606 0.28
607 0.3
608 0.31
609 0.35
610 0.41
611 0.49
612 0.58
613 0.65
614 0.74
615 0.81
616 0.86
617 0.91
618 0.91
619 0.9
620 0.9
621 0.9
622 0.89
623 0.85
624 0.82
625 0.72
626 0.62
627 0.52
628 0.41
629 0.31
630 0.21
631 0.14
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.09
636 0.12
637 0.14
638 0.19
639 0.21
640 0.27
641 0.29
642 0.3
643 0.31
644 0.31
645 0.29
646 0.26
647 0.27
648 0.22
649 0.21
650 0.24
651 0.23
652 0.25
653 0.25
654 0.23
655 0.21
656 0.19