Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VSA6

Protein Details
Accession A0A4Q4VSA6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25RDYQGKEKMRTDKARDVPRNBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016069  Translin_C  
IPR002848  Translin_fam  
IPR016068  Translin_N  
IPR036081  Translin_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01997  Translin  
CDD cd14820  TRAX  
Amino Acid Sequences MGGVKRDYQGKEKMRTDKARDVPRNAYTSMFEAFRDELDEHHDRRMRIQKVSRDVTALSKKIVRKLRQPIPQRIQSEIDERMKEIVDLLSTIEDDVQGMNRHRYNLICLEEFAEAVSFAHYLRHQTLITPRELSAALPLRIDLTPSEYVFGVFDLTGEMMRFATSVTALSGSMPASCGDGDSDEAGRRTILADLQDVSSMLQICPPLGGGGKNSNYSKKTDVMIEQVRKVERLAYGVTVRGTERPKGWMPDLNEGSRGGGDAEDVAMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.77
3 0.78
4 0.78
5 0.78
6 0.8
7 0.8
8 0.77
9 0.75
10 0.72
11 0.67
12 0.58
13 0.51
14 0.42
15 0.37
16 0.33
17 0.26
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.18
23 0.15
24 0.13
25 0.2
26 0.25
27 0.24
28 0.31
29 0.35
30 0.32
31 0.4
32 0.49
33 0.47
34 0.5
35 0.57
36 0.57
37 0.63
38 0.67
39 0.59
40 0.52
41 0.48
42 0.48
43 0.47
44 0.4
45 0.33
46 0.34
47 0.36
48 0.42
49 0.5
50 0.47
51 0.49
52 0.57
53 0.64
54 0.67
55 0.74
56 0.76
57 0.76
58 0.78
59 0.71
60 0.65
61 0.59
62 0.52
63 0.48
64 0.44
65 0.4
66 0.33
67 0.31
68 0.29
69 0.25
70 0.22
71 0.19
72 0.13
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.06
84 0.09
85 0.1
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.2
92 0.23
93 0.24
94 0.2
95 0.19
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.15
100 0.09
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.04
105 0.04
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.16
198 0.19
199 0.24
200 0.26
201 0.32
202 0.32
203 0.35
204 0.36
205 0.33
206 0.32
207 0.31
208 0.31
209 0.33
210 0.4
211 0.41
212 0.41
213 0.43
214 0.42
215 0.39
216 0.37
217 0.32
218 0.24
219 0.22
220 0.2
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.22
228 0.24
229 0.25
230 0.25
231 0.29
232 0.34
233 0.38
234 0.41
235 0.42
236 0.43
237 0.49
238 0.53
239 0.48
240 0.45
241 0.4
242 0.37
243 0.31
244 0.26
245 0.16
246 0.11
247 0.1
248 0.08