Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8LPR7

Protein Details
Accession J8LPR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-85LTVASQSGKRKQQRQQQQQNDYSQNRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR047575  Sm  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS52002  SM  
PS51385  YJEF_N  
CDD cd22576  Edc3_Lsm  
Amino Acid Sequences MSQFVGFGVQVELKDGKLIQGKIAKATSKGLTLNDVQFGDGGKSQAFKVRASRLKDLKVLTVASQSGKRKQQRQQQQQNDYSQNRGEHIDWQDDDVSKIKQQEDFDFQRNLGMFNKKDVFAQLKQNDDILPENRLQGHNRKQPQSQQNNYQIDELVIPDAKKDSWNKISTKNEQSAQQSQPQQEDEDDLELEDDEHEYDVDDIDDPKYLPITQSLNITHLIHSAANSPSTDDKTQNTTINDKDQVLAKLGQMIISQSRSNSTSLPAANKQTTIKSKNTKQIIPMATPVQLLEMESITSEFFSINSSVLLENFAVNASFFLKQKLGGRARLRLQNANPEPLVVILASDSNRSGAKALALGRHLCQTGHIRVITLFTCSQNELQDSVVKQQTEIYKKCGGKIVNSISSLESAMETLNSPVEMVIDAMQGYDCTLSDLAGTSETVEVRIENMITWCNKQRGSTKVWSLDIPNGFDAGSGLPDIFFPNRIEATGIICSSWPLLAINNLVINSPKLEDAVLIDMGIPQGVYSQRTSLRKFQNCDLFVTDGSLLLDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.19
4 0.24
5 0.25
6 0.27
7 0.33
8 0.34
9 0.37
10 0.42
11 0.39
12 0.34
13 0.38
14 0.34
15 0.32
16 0.34
17 0.3
18 0.3
19 0.32
20 0.32
21 0.31
22 0.29
23 0.25
24 0.23
25 0.23
26 0.21
27 0.17
28 0.16
29 0.13
30 0.14
31 0.15
32 0.21
33 0.22
34 0.23
35 0.29
36 0.37
37 0.44
38 0.49
39 0.58
40 0.59
41 0.62
42 0.65
43 0.59
44 0.54
45 0.5
46 0.45
47 0.36
48 0.33
49 0.29
50 0.27
51 0.32
52 0.33
53 0.38
54 0.46
55 0.53
56 0.58
57 0.65
58 0.72
59 0.77
60 0.82
61 0.86
62 0.87
63 0.88
64 0.87
65 0.86
66 0.85
67 0.76
68 0.7
69 0.63
70 0.54
71 0.46
72 0.41
73 0.34
74 0.32
75 0.33
76 0.34
77 0.29
78 0.3
79 0.31
80 0.29
81 0.29
82 0.25
83 0.23
84 0.2
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.28
89 0.31
90 0.37
91 0.4
92 0.42
93 0.4
94 0.38
95 0.37
96 0.35
97 0.32
98 0.29
99 0.3
100 0.26
101 0.31
102 0.34
103 0.3
104 0.31
105 0.33
106 0.34
107 0.31
108 0.4
109 0.38
110 0.39
111 0.39
112 0.39
113 0.36
114 0.31
115 0.32
116 0.23
117 0.22
118 0.19
119 0.2
120 0.21
121 0.24
122 0.26
123 0.31
124 0.4
125 0.46
126 0.53
127 0.57
128 0.59
129 0.66
130 0.73
131 0.74
132 0.71
133 0.71
134 0.73
135 0.72
136 0.68
137 0.59
138 0.48
139 0.39
140 0.32
141 0.23
142 0.14
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.15
149 0.18
150 0.24
151 0.3
152 0.36
153 0.39
154 0.46
155 0.54
156 0.57
157 0.6
158 0.58
159 0.53
160 0.52
161 0.54
162 0.52
163 0.48
164 0.46
165 0.45
166 0.42
167 0.42
168 0.38
169 0.34
170 0.27
171 0.26
172 0.2
173 0.16
174 0.14
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.16
201 0.16
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.17
218 0.15
219 0.17
220 0.21
221 0.24
222 0.26
223 0.26
224 0.26
225 0.26
226 0.29
227 0.29
228 0.24
229 0.22
230 0.21
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.2
254 0.2
255 0.21
256 0.21
257 0.22
258 0.27
259 0.28
260 0.32
261 0.37
262 0.42
263 0.48
264 0.51
265 0.48
266 0.44
267 0.47
268 0.43
269 0.37
270 0.33
271 0.27
272 0.23
273 0.21
274 0.19
275 0.12
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.12
309 0.16
310 0.25
311 0.27
312 0.33
313 0.36
314 0.4
315 0.44
316 0.48
317 0.47
318 0.44
319 0.42
320 0.45
321 0.44
322 0.42
323 0.37
324 0.31
325 0.28
326 0.22
327 0.2
328 0.09
329 0.07
330 0.04
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.18
349 0.15
350 0.17
351 0.2
352 0.2
353 0.23
354 0.22
355 0.2
356 0.2
357 0.22
358 0.19
359 0.17
360 0.16
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.17
367 0.15
368 0.14
369 0.16
370 0.16
371 0.2
372 0.22
373 0.2
374 0.19
375 0.22
376 0.28
377 0.33
378 0.34
379 0.34
380 0.39
381 0.4
382 0.42
383 0.43
384 0.37
385 0.33
386 0.4
387 0.41
388 0.38
389 0.38
390 0.37
391 0.31
392 0.31
393 0.27
394 0.19
395 0.12
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.13
437 0.15
438 0.19
439 0.24
440 0.28
441 0.29
442 0.33
443 0.38
444 0.4
445 0.46
446 0.5
447 0.51
448 0.52
449 0.53
450 0.5
451 0.46
452 0.48
453 0.43
454 0.37
455 0.3
456 0.24
457 0.22
458 0.2
459 0.18
460 0.11
461 0.09
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.1
467 0.1
468 0.12
469 0.12
470 0.16
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.19
476 0.19
477 0.18
478 0.15
479 0.14
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.1
484 0.07
485 0.08
486 0.1
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.15
491 0.15
492 0.15
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.14
502 0.13
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.08
509 0.05
510 0.08
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.18
515 0.26
516 0.33
517 0.38
518 0.45
519 0.54
520 0.6
521 0.64
522 0.68
523 0.71
524 0.65
525 0.64
526 0.59
527 0.51
528 0.43
529 0.4
530 0.32
531 0.22