Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XQZ3

Protein Details
Accession A0A4V1XQZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-234SRANRAARPRRFRRRSCTPESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-183RRRRSEARRYRDRAG
219-227AARPRRFRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDSMDLDIDMDLDVDLVPDEPIVPELAAEELPGDRSDGEVAEEPDVLAPTKVHIRGLDVLKPDDVKAYVAEHFPESPFEKIEWIDDSSANLIFPLEPVAARALEALAVEPIEDVALLPARQLLPAKRYSQMPDIALQVRLAVLSDKKQAGAAQRSRFYLLNPEYDPEERRRRSEARRYRDRAGSGYGRGRGRDFRDEEPTEPFDVNLYDDDEASRANRAARPRRFRRRSCTPESDRSEPFRNENRGKELFPEGSGNRHASRRDRSASPMRDRDGDRSMDDMSSDRPAARNRDRARAIKNGMSRSDRSRELFPQKLKSGNGRLGDAVEDAADLMAKGITLPLMDGSSDVKTSTRGRRLEDRITVPGKGKLADRISSPGEAADGGSAFSIRGSANQKSADQGFTIKGVAGKSVKELFPDKFGGNSGKELFADRLEGRTRRRQRAGDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.07
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.14
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.11
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.22
42 0.29
43 0.33
44 0.35
45 0.32
46 0.33
47 0.33
48 0.33
49 0.29
50 0.25
51 0.22
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.11
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.04
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.13
109 0.15
110 0.18
111 0.23
112 0.26
113 0.27
114 0.3
115 0.33
116 0.35
117 0.35
118 0.32
119 0.29
120 0.3
121 0.29
122 0.27
123 0.22
124 0.17
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.23
137 0.31
138 0.35
139 0.37
140 0.39
141 0.4
142 0.42
143 0.4
144 0.34
145 0.34
146 0.29
147 0.28
148 0.26
149 0.26
150 0.26
151 0.27
152 0.3
153 0.28
154 0.35
155 0.33
156 0.35
157 0.4
158 0.45
159 0.53
160 0.61
161 0.64
162 0.64
163 0.72
164 0.75
165 0.74
166 0.72
167 0.65
168 0.56
169 0.52
170 0.45
171 0.38
172 0.37
173 0.36
174 0.32
175 0.31
176 0.31
177 0.3
178 0.31
179 0.34
180 0.34
181 0.32
182 0.39
183 0.4
184 0.39
185 0.38
186 0.36
187 0.3
188 0.26
189 0.23
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.08
204 0.11
205 0.18
206 0.28
207 0.36
208 0.46
209 0.56
210 0.66
211 0.74
212 0.78
213 0.79
214 0.8
215 0.8
216 0.79
217 0.79
218 0.74
219 0.74
220 0.73
221 0.7
222 0.61
223 0.58
224 0.55
225 0.46
226 0.45
227 0.42
228 0.45
229 0.44
230 0.44
231 0.46
232 0.43
233 0.42
234 0.39
235 0.35
236 0.27
237 0.24
238 0.25
239 0.18
240 0.19
241 0.21
242 0.21
243 0.19
244 0.22
245 0.24
246 0.26
247 0.32
248 0.35
249 0.37
250 0.37
251 0.42
252 0.48
253 0.54
254 0.55
255 0.55
256 0.5
257 0.51
258 0.51
259 0.48
260 0.43
261 0.37
262 0.29
263 0.26
264 0.25
265 0.2
266 0.19
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.13
273 0.17
274 0.25
275 0.31
276 0.39
277 0.4
278 0.49
279 0.54
280 0.57
281 0.58
282 0.58
283 0.55
284 0.51
285 0.53
286 0.48
287 0.47
288 0.46
289 0.44
290 0.41
291 0.42
292 0.4
293 0.38
294 0.38
295 0.42
296 0.46
297 0.5
298 0.5
299 0.52
300 0.52
301 0.53
302 0.51
303 0.5
304 0.48
305 0.47
306 0.43
307 0.37
308 0.35
309 0.31
310 0.29
311 0.22
312 0.15
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.19
338 0.28
339 0.34
340 0.36
341 0.41
342 0.5
343 0.57
344 0.61
345 0.61
346 0.57
347 0.57
348 0.56
349 0.53
350 0.46
351 0.43
352 0.37
353 0.32
354 0.29
355 0.29
356 0.31
357 0.3
358 0.3
359 0.31
360 0.32
361 0.3
362 0.28
363 0.21
364 0.17
365 0.15
366 0.13
367 0.1
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.07
375 0.06
376 0.11
377 0.16
378 0.19
379 0.24
380 0.27
381 0.27
382 0.31
383 0.33
384 0.29
385 0.25
386 0.24
387 0.21
388 0.2
389 0.19
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.22
397 0.26
398 0.26
399 0.28
400 0.32
401 0.29
402 0.32
403 0.35
404 0.31
405 0.27
406 0.3
407 0.31
408 0.28
409 0.32
410 0.29
411 0.27
412 0.27
413 0.29
414 0.27
415 0.23
416 0.26
417 0.22
418 0.25
419 0.31
420 0.36
421 0.41
422 0.5
423 0.59
424 0.64
425 0.72
426 0.72
427 0.75