Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4X0E5

Protein Details
Accession A0A4Q4X0E5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-91GVRRAGKGLKSPRKRPTDRKIDPSKYSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-83GVRRAGKGLKSPRKRPTDRK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MADRSEYGRWTKDALIKRIQYLETEIRERDLRNPRPVEATTSTDAAAADAATTHSPGPGRASDGVRRAGKGLKSPRKRPTDRKIDPSKYSTRLVALKLAYVGKNYGGFEFQASANLPTIEEELWKALVKSCLIFPENPDEVRFDDWQYSKCGRTDRGVSAFGQVIAIRLRSNRPKASEKEKKEEKAAQEAGGVDDVNKDDGAEVQAEMGVQEDIDPSASEEKIEKEFNNFTDEIQYCRVLNRLLPKDIRVLAWCPTTPKDFSARHHCRERQYRYFFTQPAYPPIPSSLENPRAHAAATNTRADKPKDGWLDIAAMRTAAKKFEGLHDFRNFCKVDASKQITNFDRRIFESDVVEVEDVATALPFLDGDEFRPPNSTAAVGEDSPRGKFPKVYYFHVRGSAFLWHQIRCMVAVLFMVAQGLEEPAVVDRLLDAAAQPRRPNYVLANETPLVLWDCIFPQLEGENDDVSERIPPRDPAERHVDAMRWVYLGEENPLSKHSPHGLVEDLWEYWRERKLDELLAGQLLSLVAAQSDVGRRLDRRAPLYVAASQRVFEGGNRAHMVGRYQPMASKATLPAPDEVYDREARRKGYRDALEWREAIARKRAEALADLVDADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.53
4 0.56
5 0.58
6 0.52
7 0.46
8 0.45
9 0.46
10 0.42
11 0.43
12 0.4
13 0.38
14 0.41
15 0.4
16 0.43
17 0.46
18 0.48
19 0.54
20 0.57
21 0.55
22 0.58
23 0.57
24 0.55
25 0.49
26 0.46
27 0.39
28 0.37
29 0.34
30 0.29
31 0.27
32 0.2
33 0.16
34 0.1
35 0.07
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.16
46 0.2
47 0.24
48 0.28
49 0.32
50 0.37
51 0.43
52 0.42
53 0.41
54 0.39
55 0.41
56 0.39
57 0.43
58 0.49
59 0.52
60 0.59
61 0.68
62 0.75
63 0.79
64 0.86
65 0.87
66 0.87
67 0.87
68 0.86
69 0.87
70 0.88
71 0.86
72 0.83
73 0.8
74 0.77
75 0.7
76 0.64
77 0.56
78 0.5
79 0.46
80 0.41
81 0.39
82 0.32
83 0.28
84 0.28
85 0.3
86 0.26
87 0.23
88 0.22
89 0.18
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.12
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.22
120 0.22
121 0.21
122 0.27
123 0.28
124 0.28
125 0.27
126 0.24
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.19
131 0.22
132 0.24
133 0.24
134 0.29
135 0.3
136 0.29
137 0.31
138 0.34
139 0.31
140 0.34
141 0.38
142 0.38
143 0.39
144 0.38
145 0.36
146 0.33
147 0.31
148 0.26
149 0.21
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.19
157 0.26
158 0.34
159 0.37
160 0.42
161 0.49
162 0.55
163 0.63
164 0.67
165 0.65
166 0.68
167 0.72
168 0.69
169 0.68
170 0.68
171 0.6
172 0.59
173 0.54
174 0.44
175 0.37
176 0.34
177 0.28
178 0.22
179 0.19
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.15
212 0.17
213 0.2
214 0.2
215 0.24
216 0.22
217 0.19
218 0.24
219 0.24
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.13
227 0.15
228 0.21
229 0.23
230 0.27
231 0.28
232 0.29
233 0.31
234 0.32
235 0.3
236 0.23
237 0.21
238 0.19
239 0.2
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.2
244 0.19
245 0.2
246 0.24
247 0.25
248 0.3
249 0.39
250 0.44
251 0.47
252 0.55
253 0.57
254 0.59
255 0.66
256 0.7
257 0.68
258 0.68
259 0.66
260 0.63
261 0.63
262 0.56
263 0.48
264 0.45
265 0.36
266 0.35
267 0.33
268 0.28
269 0.23
270 0.23
271 0.24
272 0.19
273 0.21
274 0.22
275 0.28
276 0.29
277 0.3
278 0.29
279 0.27
280 0.26
281 0.25
282 0.2
283 0.18
284 0.2
285 0.21
286 0.22
287 0.24
288 0.27
289 0.27
290 0.27
291 0.23
292 0.27
293 0.27
294 0.26
295 0.24
296 0.21
297 0.23
298 0.2
299 0.19
300 0.12
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.15
310 0.21
311 0.21
312 0.27
313 0.31
314 0.33
315 0.32
316 0.37
317 0.32
318 0.26
319 0.29
320 0.24
321 0.22
322 0.3
323 0.35
324 0.32
325 0.33
326 0.38
327 0.36
328 0.4
329 0.38
330 0.32
331 0.28
332 0.27
333 0.3
334 0.27
335 0.25
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.02
351 0.03
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.16
362 0.15
363 0.1
364 0.12
365 0.14
366 0.11
367 0.12
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.16
372 0.15
373 0.14
374 0.18
375 0.19
376 0.27
377 0.3
378 0.36
379 0.41
380 0.44
381 0.45
382 0.48
383 0.45
384 0.36
385 0.33
386 0.31
387 0.24
388 0.25
389 0.26
390 0.2
391 0.2
392 0.2
393 0.19
394 0.15
395 0.16
396 0.1
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.11
420 0.15
421 0.18
422 0.2
423 0.21
424 0.25
425 0.26
426 0.28
427 0.25
428 0.29
429 0.31
430 0.31
431 0.35
432 0.31
433 0.3
434 0.27
435 0.25
436 0.18
437 0.14
438 0.13
439 0.08
440 0.09
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.11
450 0.1
451 0.11
452 0.1
453 0.09
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.16
458 0.18
459 0.22
460 0.31
461 0.33
462 0.33
463 0.4
464 0.39
465 0.39
466 0.4
467 0.37
468 0.3
469 0.31
470 0.27
471 0.18
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.15
480 0.17
481 0.18
482 0.16
483 0.19
484 0.2
485 0.22
486 0.23
487 0.25
488 0.26
489 0.24
490 0.25
491 0.23
492 0.2
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.18
497 0.23
498 0.22
499 0.21
500 0.25
501 0.29
502 0.32
503 0.32
504 0.3
505 0.27
506 0.26
507 0.25
508 0.2
509 0.16
510 0.11
511 0.09
512 0.06
513 0.04
514 0.03
515 0.04
516 0.04
517 0.06
518 0.09
519 0.11
520 0.13
521 0.17
522 0.18
523 0.24
524 0.31
525 0.35
526 0.37
527 0.39
528 0.4
529 0.4
530 0.42
531 0.42
532 0.4
533 0.38
534 0.34
535 0.29
536 0.27
537 0.25
538 0.22
539 0.17
540 0.21
541 0.19
542 0.24
543 0.25
544 0.26
545 0.26
546 0.27
547 0.29
548 0.27
549 0.29
550 0.25
551 0.24
552 0.26
553 0.28
554 0.29
555 0.28
556 0.25
557 0.24
558 0.27
559 0.3
560 0.29
561 0.29
562 0.29
563 0.29
564 0.28
565 0.27
566 0.27
567 0.3
568 0.31
569 0.37
570 0.38
571 0.42
572 0.48
573 0.52
574 0.54
575 0.57
576 0.6
577 0.59
578 0.64
579 0.65
580 0.63
581 0.57
582 0.52
583 0.49
584 0.47
585 0.45
586 0.45
587 0.41
588 0.37
589 0.41
590 0.41
591 0.36
592 0.35
593 0.33
594 0.27
595 0.24