FuNGI

A0A4Q4XP15

Protein Details

Accession

A0A4Q4XP15

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-404	EAEYKRQLKTKRKGGRGGKEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
388-410	KRQLKTKRKGGRGGKEGAGGRGG
466-489	AGHRGRGRGGNRGRGNRGGPRGGG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 15, nucl 14, cyto 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSGFQIPGLTTLSQPQAASMPSVEASRQDEKEKTETADNMVIDHPETTQKPDSVPSMTPNQHQAGTGTADGIDNVAVDQPQSTESDVAPSATSNEEGEKKMENGGAIATADQTQSDRPSENLPGDAPPSPPSLTSGLEALLGGLDPTPAQSNDQAAQGEERQDGEDGQQENPEWEVDSSPYESSSEESSSSDSDDESEDDKDYPILGPEETARLLMEMEGGSDDDGEGRSKAGGSGGQVRTKNELPEEPVPVPDVKLEPDSEIVELGSVEHIVESTMVIKANTTGEYQVLDSGSVICTENRTVVAAIADLIGSVRQPRYTARFTNQDKITEFGLELGSKIFYSPAHVTYVFTEALKGEKGTDASNWHDEEAGEDEMEFSDDEKEAEYKRQLKTKRKGGRGGKEGAGGRGGAKQEQLNSHPAALKYDDDEDDDGPYKPLARPAGFGQGPPTHSVETGYANGYPNNRAGHRGRGRGGNRGRGNRGGPRGGGGGGYSLPPRGQAPTLPQQHHQQQPPPPQQQQQQSYAPPPQQQQFNYPMPPTPQFPFPWPPNMVPPNMVPPPPPPPQFAGQQPNPGMYFNPAFYNAGGQWPGQQGHPGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.2
4	0.19
5	0.2
6	0.16
7	0.15
8	0.14
9	0.15
10	0.15
11	0.16
12	0.21
13	0.26
14	0.28
15	0.32
16	0.35
17	0.39
18	0.43
19	0.43
20	0.41
21	0.4
22	0.39
23	0.38
24	0.39
25	0.34
26	0.31
27	0.29
28	0.26
29	0.21
30	0.19
31	0.16
32	0.17
33	0.19
34	0.23
35	0.27
36	0.27
37	0.28
38	0.31
39	0.33
40	0.31
41	0.32
42	0.3
43	0.34
44	0.36
45	0.38
46	0.4
47	0.39
48	0.36
49	0.35
50	0.31
51	0.25
52	0.25
53	0.22
54	0.16
55	0.14
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.08
60	0.05
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.07
67	0.08
68	0.09
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.13
76	0.12
77	0.13
78	0.12
79	0.13
80	0.11
81	0.14
82	0.17
83	0.18
84	0.19
85	0.2
86	0.2
87	0.21
88	0.22
89	0.18
90	0.15
91	0.14
92	0.13
93	0.11
94	0.1
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.1
101	0.12
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.19
106	0.23
107	0.23
108	0.22
109	0.21
110	0.2
111	0.22
112	0.22
113	0.2
114	0.18
115	0.19
116	0.18
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.13
124	0.13
125	0.12
126	0.09
127	0.07
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.03
133	0.04
134	0.07
135	0.07
136	0.09
137	0.1
138	0.13
139	0.15
140	0.17
141	0.16
142	0.15
143	0.17
144	0.17
145	0.18
146	0.15
147	0.15
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.12
152	0.16
153	0.15
154	0.15
155	0.16
156	0.15
157	0.15
158	0.16
159	0.15
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.07
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.16
223	0.19
224	0.23
225	0.25
226	0.26
227	0.29
228	0.3
229	0.3
230	0.23
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.26
235	0.22
236	0.21
237	0.21
238	0.19
239	0.18
240	0.14
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.04
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.09
305	0.14
306	0.19
307	0.22
308	0.25
309	0.34
310	0.37
311	0.45
312	0.45
313	0.42
314	0.39
315	0.37
316	0.33
317	0.24
318	0.21
319	0.13
320	0.12
321	0.09
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.14
333	0.14
334	0.15
335	0.15
336	0.18
337	0.14
338	0.12
339	0.11
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.12
350	0.15
351	0.18
352	0.18
353	0.17
354	0.16
355	0.15
356	0.15
357	0.15
358	0.13
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.09
364	0.08
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.09
372	0.13
373	0.18
374	0.23
375	0.27
376	0.34
377	0.42
378	0.51
379	0.6
380	0.66
381	0.7
382	0.72
383	0.78
384	0.8
385	0.81
386	0.77
387	0.72
388	0.63
389	0.59
390	0.52
391	0.43
392	0.34
393	0.25
394	0.19
395	0.18
396	0.17
397	0.12
398	0.13
399	0.14
400	0.16
401	0.19
402	0.21
403	0.22
404	0.22
405	0.23
406	0.24
407	0.23
408	0.23
409	0.21
410	0.19
411	0.17
412	0.18
413	0.17
414	0.16
415	0.17
416	0.15
417	0.16
418	0.17
419	0.15
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.17
425	0.2
426	0.19
427	0.21
428	0.23
429	0.31
430	0.3
431	0.29
432	0.29
433	0.28
434	0.28
435	0.29
436	0.29
437	0.21
438	0.2
439	0.22
440	0.18
441	0.17
442	0.17
443	0.16
444	0.15
445	0.16
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.19
450	0.22
451	0.21
452	0.25
453	0.27
454	0.36
455	0.41
456	0.45
457	0.45
458	0.51
459	0.53
460	0.57
461	0.6
462	0.6
463	0.6
464	0.61
465	0.62
466	0.59
467	0.61
468	0.59
469	0.58
470	0.52
471	0.44
472	0.39
473	0.36
474	0.3
475	0.26
476	0.18
477	0.13
478	0.11
479	0.12
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.1
484	0.11
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.22
489	0.31
490	0.39
491	0.41
492	0.43
493	0.49
494	0.56
495	0.62
496	0.61
497	0.58
498	0.59
499	0.67
500	0.73
501	0.74
502	0.71
503	0.7
504	0.72
505	0.75
506	0.72
507	0.68
508	0.64
509	0.6
510	0.59
511	0.59
512	0.56
513	0.52
514	0.51
515	0.51
516	0.52
517	0.5
518	0.5
519	0.51
520	0.52
521	0.51
522	0.46
523	0.44
524	0.42
525	0.43
526	0.41
527	0.36
528	0.36
529	0.35
530	0.39
531	0.44
532	0.43
533	0.48
534	0.48
535	0.47
536	0.52
537	0.53
538	0.49
539	0.43
540	0.41
541	0.41
542	0.41
543	0.39
544	0.32
545	0.32
546	0.37
547	0.42
548	0.43
549	0.39
550	0.39
551	0.42
552	0.46
553	0.51
554	0.54
555	0.5
556	0.56
557	0.53
558	0.52
559	0.49
560	0.44
561	0.36
562	0.32
563	0.3
564	0.23
565	0.25
566	0.23
567	0.23
568	0.23
569	0.26
570	0.21
571	0.23
572	0.23
573	0.2
574	0.22
575	0.26
576	0.27
577	0.23

A0A4Q4XP15

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer