Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8Q3J3

Protein Details
Accession J8Q3J3    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-280VKPSGGAPKGKKRKIRAAGETRLKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-280GGAPKGKKRKIRAAGETRLKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MEPQDPQLKEDIETTVSYIKQHGISFESKLLEDERFSFIRKDDPLHEYYLKVLNEATTTAVDENDVGKREREIARPQEFLFSQYDTGISRKDMEIIKLTAQYCAQDERNLESIRSKHSESLLQFSDSSHPLYKIFTDFVAQYKWINSSKGQKMKKSRREIIDQCYCRAQYWEFVKDQDREHDKLVELSKIQFAAIPWDKFTQVTKFLVPDDTDVVQDALDLSQMRLRRVQPDMKIFDSIRPVNEEEKTVSDIVKPSGGAPKGKKRKIRAAGETRLKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.23
12 0.25
13 0.27
14 0.26
15 0.22
16 0.23
17 0.24
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.22
26 0.27
27 0.27
28 0.29
29 0.29
30 0.34
31 0.34
32 0.37
33 0.38
34 0.31
35 0.32
36 0.34
37 0.29
38 0.24
39 0.22
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.15
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.2
57 0.23
58 0.27
59 0.33
60 0.4
61 0.44
62 0.46
63 0.46
64 0.45
65 0.41
66 0.37
67 0.31
68 0.23
69 0.19
70 0.16
71 0.16
72 0.13
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.19
82 0.19
83 0.2
84 0.22
85 0.22
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.24
96 0.23
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.27
102 0.25
103 0.21
104 0.22
105 0.27
106 0.24
107 0.27
108 0.24
109 0.22
110 0.21
111 0.19
112 0.21
113 0.16
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.22
135 0.3
136 0.38
137 0.41
138 0.45
139 0.55
140 0.64
141 0.71
142 0.72
143 0.71
144 0.68
145 0.73
146 0.71
147 0.69
148 0.69
149 0.61
150 0.53
151 0.49
152 0.44
153 0.35
154 0.32
155 0.24
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.24
160 0.27
161 0.31
162 0.31
163 0.32
164 0.33
165 0.33
166 0.32
167 0.33
168 0.32
169 0.28
170 0.3
171 0.3
172 0.24
173 0.2
174 0.19
175 0.18
176 0.16
177 0.16
178 0.12
179 0.11
180 0.17
181 0.22
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.24
187 0.26
188 0.22
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.21
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.1
210 0.12
211 0.14
212 0.18
213 0.2
214 0.24
215 0.31
216 0.37
217 0.41
218 0.48
219 0.52
220 0.49
221 0.52
222 0.47
223 0.44
224 0.45
225 0.4
226 0.33
227 0.32
228 0.32
229 0.32
230 0.32
231 0.31
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.24
236 0.23
237 0.21
238 0.22
239 0.21
240 0.2
241 0.18
242 0.17
243 0.24
244 0.27
245 0.31
246 0.37
247 0.47
248 0.56
249 0.64
250 0.7
251 0.71
252 0.79
253 0.82
254 0.84
255 0.84
256 0.83
257 0.85
258 0.88
259 0.88
260 0.84