Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8LJN2

Protein Details
Accession J8LJN2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-239DYDYSVKRNLKKRKFNNEDWLFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 9.833, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MSRKNSKKLKVYYLPVTLTQFQKDLSEILISLHAISFKTSIAGGLQANSSNKSDDSSANHQTHSYPRLSERQLTYIFDSNIRAIANHPSLLVDHYMPRQLLRMEPTESSIAGSHKFQVLNHLINSLCFRDKVETPNKVIKCAIIAHSIKELDLLEGLVLGKKFRIKRLSGTSLYNEKHKFPTLTMVDSTTNKDGTPNSLSSTSSNSNSTSYTGYSKDDYDYSVKRNLKKRKFNNEDWLFLATTKHLKHDPCLLANYDLDVIISFDPMLYIELPALQLLKNSSNKTIPIIKLLVQNSPDHYLLDSEIKNSGTGPRCVNGEDHVDDDSEYEEMKSSLLYFLQARNSKVENFNVDYAALIQCCLQGKDCNYLLPTLDLTTLDETSKDLSCPELWQPRLTALHYCTTKLPLWDGPLDIKSYQTELMHRAVIRLRDTQDEYEKGTAPLNEKRFKENQRQNKLDEIKHSAGVTFKKKQDLDKSINDSEKRYRHAMTESAKLDTKLNALLKIKLELENFGKLYPEVTSSGDHSEKEPALTSKLNEYIVTNVTLTETLKELEEANAKKSEENDELRSQYQIESSKAAESAQTVKTLQESMKSLENEMNGPLTKFSTQSLKKELECLRNDFQSLKSRNKFLKDYINSMNRQYDLKNKSNVQVEKTAATGTRFRSTRSNTPNYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.62
3 0.6
4 0.54
5 0.49
6 0.43
7 0.37
8 0.31
9 0.29
10 0.27
11 0.22
12 0.18
13 0.16
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.17
34 0.19
35 0.21
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.2
40 0.22
41 0.21
42 0.27
43 0.31
44 0.39
45 0.39
46 0.4
47 0.39
48 0.39
49 0.42
50 0.4
51 0.36
52 0.3
53 0.33
54 0.41
55 0.44
56 0.49
57 0.46
58 0.47
59 0.47
60 0.47
61 0.46
62 0.44
63 0.41
64 0.35
65 0.34
66 0.28
67 0.27
68 0.24
69 0.2
70 0.15
71 0.22
72 0.22
73 0.2
74 0.2
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.24
88 0.25
89 0.27
90 0.26
91 0.26
92 0.29
93 0.27
94 0.25
95 0.23
96 0.2
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.19
102 0.2
103 0.18
104 0.25
105 0.29
106 0.31
107 0.3
108 0.3
109 0.26
110 0.27
111 0.29
112 0.24
113 0.2
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.23
118 0.31
119 0.37
120 0.4
121 0.44
122 0.52
123 0.51
124 0.5
125 0.47
126 0.39
127 0.32
128 0.3
129 0.27
130 0.26
131 0.27
132 0.25
133 0.29
134 0.28
135 0.25
136 0.23
137 0.21
138 0.13
139 0.12
140 0.1
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.15
149 0.18
150 0.25
151 0.32
152 0.32
153 0.4
154 0.49
155 0.55
156 0.53
157 0.54
158 0.52
159 0.53
160 0.51
161 0.51
162 0.44
163 0.39
164 0.4
165 0.4
166 0.36
167 0.29
168 0.37
169 0.31
170 0.32
171 0.3
172 0.29
173 0.28
174 0.28
175 0.31
176 0.23
177 0.21
178 0.18
179 0.19
180 0.17
181 0.19
182 0.21
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.2
188 0.25
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.29
210 0.33
211 0.38
212 0.47
213 0.56
214 0.61
215 0.69
216 0.76
217 0.79
218 0.83
219 0.83
220 0.85
221 0.79
222 0.71
223 0.62
224 0.54
225 0.43
226 0.35
227 0.28
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.18
232 0.2
233 0.21
234 0.22
235 0.31
236 0.32
237 0.29
238 0.31
239 0.29
240 0.27
241 0.26
242 0.24
243 0.15
244 0.12
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.12
266 0.16
267 0.17
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.23
272 0.27
273 0.23
274 0.22
275 0.22
276 0.22
277 0.26
278 0.26
279 0.26
280 0.22
281 0.22
282 0.21
283 0.23
284 0.2
285 0.15
286 0.14
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.13
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.17
297 0.15
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.15
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.04
323 0.06
324 0.06
325 0.08
326 0.14
327 0.17
328 0.17
329 0.2
330 0.21
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.17
339 0.14
340 0.13
341 0.11
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.13
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.16
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.24
381 0.25
382 0.25
383 0.23
384 0.18
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.21
389 0.23
390 0.23
391 0.2
392 0.21
393 0.16
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.15
401 0.14
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.16
409 0.17
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.21
414 0.22
415 0.23
416 0.23
417 0.24
418 0.27
419 0.28
420 0.3
421 0.28
422 0.28
423 0.26
424 0.25
425 0.22
426 0.21
427 0.2
428 0.2
429 0.25
430 0.3
431 0.34
432 0.35
433 0.4
434 0.46
435 0.51
436 0.58
437 0.61
438 0.65
439 0.69
440 0.71
441 0.68
442 0.69
443 0.69
444 0.61
445 0.56
446 0.53
447 0.45
448 0.42
449 0.4
450 0.31
451 0.29
452 0.32
453 0.33
454 0.32
455 0.33
456 0.39
457 0.41
458 0.47
459 0.52
460 0.55
461 0.55
462 0.56
463 0.6
464 0.58
465 0.62
466 0.57
467 0.51
468 0.5
469 0.48
470 0.45
471 0.41
472 0.37
473 0.35
474 0.37
475 0.4
476 0.36
477 0.39
478 0.36
479 0.35
480 0.36
481 0.33
482 0.31
483 0.25
484 0.23
485 0.2
486 0.21
487 0.23
488 0.23
489 0.26
490 0.25
491 0.27
492 0.27
493 0.25
494 0.24
495 0.23
496 0.24
497 0.25
498 0.24
499 0.22
500 0.21
501 0.17
502 0.17
503 0.14
504 0.14
505 0.11
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.19
510 0.2
511 0.19
512 0.19
513 0.22
514 0.21
515 0.21
516 0.22
517 0.18
518 0.2
519 0.22
520 0.22
521 0.22
522 0.25
523 0.24
524 0.22
525 0.22
526 0.21
527 0.21
528 0.21
529 0.16
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.1
535 0.1
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.13
541 0.2
542 0.2
543 0.22
544 0.26
545 0.26
546 0.27
547 0.28
548 0.31
549 0.3
550 0.34
551 0.36
552 0.37
553 0.4
554 0.39
555 0.38
556 0.33
557 0.27
558 0.27
559 0.25
560 0.22
561 0.21
562 0.22
563 0.22
564 0.21
565 0.21
566 0.16
567 0.15
568 0.19
569 0.18
570 0.19
571 0.18
572 0.18
573 0.2
574 0.21
575 0.2
576 0.2
577 0.21
578 0.21
579 0.28
580 0.28
581 0.28
582 0.29
583 0.29
584 0.26
585 0.24
586 0.25
587 0.19
588 0.19
589 0.18
590 0.18
591 0.17
592 0.17
593 0.18
594 0.25
595 0.29
596 0.35
597 0.41
598 0.43
599 0.43
600 0.51
601 0.56
602 0.55
603 0.55
604 0.56
605 0.54
606 0.52
607 0.53
608 0.46
609 0.44
610 0.45
611 0.46
612 0.49
613 0.5
614 0.55
615 0.6
616 0.65
617 0.65
618 0.61
619 0.66
620 0.61
621 0.61
622 0.63
623 0.64
624 0.6
625 0.59
626 0.58
627 0.48
628 0.46
629 0.42
630 0.42
631 0.42
632 0.47
633 0.51
634 0.5
635 0.55
636 0.62
637 0.63
638 0.59
639 0.57
640 0.52
641 0.46
642 0.43
643 0.39
644 0.32
645 0.31
646 0.31
647 0.29
648 0.35
649 0.34
650 0.37
651 0.44
652 0.49
653 0.56
654 0.6