Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XUD7

Protein Details
Accession A0A4V1XUD7    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-432SPEIKPQASMPPRKRKPVDIFMKPKPKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-146RRKLPRPPRDGRGGGGPRKPGMGRRGGG
167-176SILKKARREA
415-435PPRKRKPVDIFMKPKPKVQKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPRTPDVTDIGNMAYPTVRTILLQINSAKQLRHLEINSPQLEGDDAECWVRLINRDFPVLAKRHNFEPKNPTSWHKIYARYERLEAEQKREAEEKLKAAFAGIKKEKQENVSTIVDFDRRKLPRPPRDGRGGGGPRKPGMGRRGGGPDEGDLRFTGGTRTKVTSAKSILKKARREAREISARNRLATPTGLLPVNRSQIVSAPKGMVEAARIKAQPATRIHAPGLPSKDEQKHSRELEEREARLRKMKNVGAKKGATVVSDSDLEDEEGYDDEDGYDDEDVSGPGGLDPDDLEDMFDEKPKPSPTRPTKPSTASTSSGGFSASTTRSNITKRSGLLSNAPGSSKNNLIISTKPVPKPTTSKPASASASTSKPVSASTNPKSFSPPLENSSPPKRSPPAGTASSMSPEIKPQASMPPRKRKPVDIFMKPKPKVQKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.1
7 0.14
8 0.21
9 0.21
10 0.25
11 0.26
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.34
16 0.31
17 0.37
18 0.35
19 0.41
20 0.38
21 0.38
22 0.43
23 0.51
24 0.47
25 0.41
26 0.38
27 0.3
28 0.29
29 0.23
30 0.18
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.16
39 0.2
40 0.26
41 0.28
42 0.3
43 0.3
44 0.32
45 0.37
46 0.36
47 0.38
48 0.37
49 0.37
50 0.43
51 0.53
52 0.54
53 0.54
54 0.6
55 0.6
56 0.6
57 0.6
58 0.57
59 0.56
60 0.56
61 0.55
62 0.51
63 0.52
64 0.54
65 0.61
66 0.64
67 0.58
68 0.58
69 0.52
70 0.53
71 0.54
72 0.49
73 0.45
74 0.44
75 0.41
76 0.42
77 0.43
78 0.39
79 0.35
80 0.36
81 0.33
82 0.29
83 0.29
84 0.25
85 0.23
86 0.26
87 0.23
88 0.3
89 0.3
90 0.33
91 0.36
92 0.41
93 0.43
94 0.43
95 0.46
96 0.38
97 0.39
98 0.37
99 0.34
100 0.3
101 0.28
102 0.29
103 0.24
104 0.24
105 0.27
106 0.26
107 0.31
108 0.39
109 0.48
110 0.53
111 0.62
112 0.67
113 0.65
114 0.72
115 0.69
116 0.61
117 0.61
118 0.59
119 0.55
120 0.52
121 0.48
122 0.4
123 0.41
124 0.4
125 0.36
126 0.33
127 0.34
128 0.31
129 0.32
130 0.37
131 0.35
132 0.35
133 0.29
134 0.25
135 0.22
136 0.21
137 0.18
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.14
143 0.13
144 0.16
145 0.17
146 0.2
147 0.22
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.29
152 0.35
153 0.37
154 0.43
155 0.48
156 0.52
157 0.56
158 0.59
159 0.63
160 0.57
161 0.58
162 0.55
163 0.56
164 0.58
165 0.56
166 0.53
167 0.53
168 0.51
169 0.47
170 0.43
171 0.35
172 0.26
173 0.23
174 0.2
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.16
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.16
201 0.17
202 0.21
203 0.2
204 0.23
205 0.22
206 0.24
207 0.24
208 0.23
209 0.24
210 0.22
211 0.23
212 0.21
213 0.2
214 0.24
215 0.28
216 0.3
217 0.33
218 0.33
219 0.37
220 0.36
221 0.4
222 0.4
223 0.38
224 0.43
225 0.45
226 0.42
227 0.41
228 0.43
229 0.39
230 0.41
231 0.4
232 0.36
233 0.37
234 0.39
235 0.41
236 0.46
237 0.5
238 0.49
239 0.47
240 0.43
241 0.41
242 0.38
243 0.29
244 0.23
245 0.19
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.16
287 0.2
288 0.25
289 0.28
290 0.39
291 0.46
292 0.55
293 0.61
294 0.63
295 0.65
296 0.65
297 0.66
298 0.62
299 0.57
300 0.49
301 0.45
302 0.4
303 0.34
304 0.29
305 0.24
306 0.17
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.19
314 0.22
315 0.26
316 0.27
317 0.29
318 0.29
319 0.32
320 0.34
321 0.32
322 0.34
323 0.34
324 0.33
325 0.3
326 0.3
327 0.27
328 0.26
329 0.26
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.2
334 0.22
335 0.22
336 0.26
337 0.32
338 0.37
339 0.37
340 0.41
341 0.42
342 0.45
343 0.5
344 0.51
345 0.54
346 0.49
347 0.51
348 0.49
349 0.54
350 0.53
351 0.47
352 0.43
353 0.38
354 0.38
355 0.35
356 0.32
357 0.25
358 0.22
359 0.22
360 0.23
361 0.25
362 0.31
363 0.37
364 0.43
365 0.44
366 0.44
367 0.49
368 0.46
369 0.45
370 0.44
371 0.42
372 0.4
373 0.44
374 0.47
375 0.49
376 0.56
377 0.55
378 0.49
379 0.52
380 0.52
381 0.51
382 0.53
383 0.52
384 0.5
385 0.48
386 0.49
387 0.43
388 0.41
389 0.38
390 0.35
391 0.3
392 0.23
393 0.23
394 0.25
395 0.24
396 0.23
397 0.22
398 0.3
399 0.38
400 0.48
401 0.55
402 0.62
403 0.68
404 0.78
405 0.81
406 0.81
407 0.81
408 0.81
409 0.81
410 0.81
411 0.82
412 0.82
413 0.88
414 0.79
415 0.77