Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8Q578

Protein Details
Accession J8Q578    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSKGRSNQRRYKCPLPIHPIDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-154K
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11.5, cyto_mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR006676  tRNA_splic  
IPR016589  tRNA_splic_SEN2  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
Amino Acid Sequences MSKGRSNQRRYKCPLPIHPIDDLPDLILHNPLSWVYWAYRYYKSTNALNKKIHVDFMGKSTLHIIVQNHSQMLYLWDNGFFGTGQFSRSEPTWKGRTEARLGLNDDLPQIQRGTKSNEETQLTLEKITQQRRLLRLEFKKERARLEKELLELRKKRGHIDEENILLEKQRESLRKFKVKQTENINTITQQQSVSESTFRNEDNDLVDENGDLLELESLELMPVEAMFLTFALPVLDISPASLAATLYPFDVKYKDIHSFVRYYVIYHHYRSHGWCVRSGIKFGCDYLLYKRGPPFQHAEFCVMGLDHDVSKAYTWYSSIARVVGGAKKTFVLCYVERLISEEDAVALWKANNFTKLFNSYQVAEVIYKRWVPGRNRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.83
3 0.81
4 0.75
5 0.7
6 0.62
7 0.56
8 0.48
9 0.38
10 0.3
11 0.23
12 0.2
13 0.17
14 0.17
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.29
27 0.32
28 0.34
29 0.38
30 0.41
31 0.44
32 0.52
33 0.57
34 0.6
35 0.6
36 0.61
37 0.62
38 0.58
39 0.52
40 0.45
41 0.39
42 0.32
43 0.31
44 0.33
45 0.26
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.21
50 0.23
51 0.2
52 0.17
53 0.22
54 0.24
55 0.22
56 0.2
57 0.2
58 0.16
59 0.2
60 0.18
61 0.15
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.1
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.15
76 0.2
77 0.19
78 0.26
79 0.3
80 0.3
81 0.33
82 0.36
83 0.4
84 0.4
85 0.43
86 0.4
87 0.39
88 0.41
89 0.4
90 0.36
91 0.32
92 0.27
93 0.23
94 0.19
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.15
99 0.17
100 0.23
101 0.26
102 0.3
103 0.33
104 0.38
105 0.38
106 0.36
107 0.35
108 0.32
109 0.28
110 0.23
111 0.2
112 0.2
113 0.25
114 0.3
115 0.33
116 0.35
117 0.4
118 0.44
119 0.48
120 0.47
121 0.5
122 0.52
123 0.57
124 0.58
125 0.6
126 0.64
127 0.62
128 0.65
129 0.64
130 0.62
131 0.57
132 0.56
133 0.51
134 0.46
135 0.5
136 0.46
137 0.46
138 0.43
139 0.43
140 0.43
141 0.41
142 0.42
143 0.41
144 0.44
145 0.4
146 0.42
147 0.41
148 0.37
149 0.37
150 0.34
151 0.27
152 0.21
153 0.17
154 0.12
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.22
159 0.3
160 0.38
161 0.47
162 0.5
163 0.54
164 0.58
165 0.57
166 0.6
167 0.61
168 0.6
169 0.53
170 0.52
171 0.46
172 0.37
173 0.36
174 0.31
175 0.23
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.11
240 0.14
241 0.17
242 0.19
243 0.22
244 0.24
245 0.25
246 0.24
247 0.28
248 0.24
249 0.21
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.31
255 0.27
256 0.3
257 0.32
258 0.38
259 0.38
260 0.36
261 0.37
262 0.38
263 0.43
264 0.42
265 0.42
266 0.34
267 0.31
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.26
275 0.24
276 0.27
277 0.31
278 0.36
279 0.37
280 0.39
281 0.4
282 0.38
283 0.44
284 0.42
285 0.42
286 0.35
287 0.33
288 0.29
289 0.23
290 0.18
291 0.13
292 0.12
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.12
303 0.13
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.18
310 0.2
311 0.22
312 0.2
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.23
321 0.27
322 0.26
323 0.26
324 0.28
325 0.28
326 0.23
327 0.23
328 0.17
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.1
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.14
337 0.17
338 0.23
339 0.23
340 0.25
341 0.3
342 0.35
343 0.35
344 0.36
345 0.36
346 0.32
347 0.33
348 0.32
349 0.28
350 0.25
351 0.24
352 0.21
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.27
357 0.33