FuNGI

A0A4Q4YX27

Protein Details

Accession

A0A4Q4YX27

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-51	VTPASDRKDKSSKKEQKSKKRPRDTTDNTEGSERKLKKSKSRVSLGD	Hydrophilic
71-93	DEVGADRKKSKKSKKADLAIDEE	Hydrophilic
118-143	QGDAPSKEKKKSKKDKRRNDTQEGET	Basic
160-186	QGAMSSQHKKKKKEKRKERQIEAVQPE	Hydrophilic
447-468	MEADRRRKLKHGGLLRKPFKRL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-27	RKDKSSKKEQKSKKRPR
38-43	RKLKKS
77-85	RKKSKKSKK
121-135	APSKEKKKSKKDKRR
167-178	HKKKKKEKRKER
451-467	RRRKLKHGGLLRKPFKR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSSPVTPASDRKDKSSKKEQKSKKRPRDTTDNTEGSERKLKKSKSRVSLGDGDGVAADQPESSAPAPPVADEVGADRKKSKKSKKADLAIDEEPKSEAAEDDGKHKGKSEKQLGGIVQGDAPSKEKKKSKKDKRRNDTQEGETAAADVDVAQAVVIPDSQGAMSSQHKKKKKEKRKERQIEAVQPEPMDIDSVPFQPTPATSQAHGDRPDVSFPFFTQTVSQYLPLFPSGMIEPIEGYAEQHLRPLLNRYVPAFRGVLLSYRNPRIGEAPGKGSLTEASQTEDTALLESIDEYAVGFSWLTIEADLFCPKRGSWMEGSLNLQSEGFIGVICFGMFNASIEASRLPSGWKWVDMLSKEGGKQQNGKSAAEAKLPTPEPQDENEAEDGGTDQAHSTGYWVDESGSKVGGKLRFRIKNYEVGSVGDYGYLSIEGTMLDEGAERAKVAEEMEADRRRKLKHGGLLRKPFKRLPEFSMTKFGKDDEQEDDILRSKKSKSNRPGTVASE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.72
3	0.74
4	0.76
5	0.85
6	0.88
7	0.89
8	0.92
9	0.95
10	0.95
11	0.95
12	0.94
13	0.92
14	0.92
15	0.9
16	0.88
17	0.87
18	0.8
19	0.7
20	0.67
21	0.59
22	0.53
23	0.54
24	0.47
25	0.46
26	0.51
27	0.57
28	0.61
29	0.7
30	0.75
31	0.75
32	0.81
33	0.77
34	0.75
35	0.76
36	0.67
37	0.61
38	0.51
39	0.42
40	0.33
41	0.27
42	0.2
43	0.12
44	0.1
45	0.04
46	0.05
47	0.05
48	0.08
49	0.08
50	0.12
51	0.12
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.16
56	0.14
57	0.13
58	0.1
59	0.13
60	0.2
61	0.22
62	0.23
63	0.26
64	0.32
65	0.41
66	0.51
67	0.59
68	0.59
69	0.68
70	0.78
71	0.83
72	0.86
73	0.85
74	0.81
75	0.76
76	0.72
77	0.68
78	0.57
79	0.48
80	0.39
81	0.31
82	0.25
83	0.19
84	0.13
85	0.1
86	0.15
87	0.15
88	0.19
89	0.25
90	0.27
91	0.26
92	0.31
93	0.34
94	0.36
95	0.46
96	0.5
97	0.49
98	0.5
99	0.55
100	0.51
101	0.48
102	0.42
103	0.33
104	0.25
105	0.2
106	0.18
107	0.14
108	0.17
109	0.19
110	0.22
111	0.29
112	0.36
113	0.45
114	0.55
115	0.66
116	0.75
117	0.79
118	0.87
119	0.91
120	0.93
121	0.94
122	0.93
123	0.91
124	0.87
125	0.79
126	0.73
127	0.64
128	0.55
129	0.44
130	0.34
131	0.24
132	0.16
133	0.12
134	0.07
135	0.05
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.05
149	0.07
150	0.13
151	0.22
152	0.29
153	0.37
154	0.45
155	0.53
156	0.63
157	0.72
158	0.78
159	0.8
160	0.85
161	0.88
162	0.92
163	0.94
164	0.91
165	0.9
166	0.87
167	0.85
168	0.78
169	0.7
170	0.6
171	0.49
172	0.41
173	0.31
174	0.23
175	0.15
176	0.09
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.1
185	0.12
186	0.14
187	0.15
188	0.14
189	0.18
190	0.21
191	0.26
192	0.27
193	0.24
194	0.23
195	0.22
196	0.24
197	0.2
198	0.19
199	0.14
200	0.13
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.15
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.14
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.2
238	0.2
239	0.21
240	0.17
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.15
247	0.17
248	0.19
249	0.2
250	0.19
251	0.19
252	0.19
253	0.21
254	0.22
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.2
259	0.2
260	0.18
261	0.14
262	0.11
263	0.11
264	0.08
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.07
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.11
297	0.18
298	0.18
299	0.2
300	0.2
301	0.26
302	0.27
303	0.28
304	0.31
305	0.25
306	0.25
307	0.21
308	0.19
309	0.12
310	0.1
311	0.08
312	0.06
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.17
338	0.21
339	0.21
340	0.23
341	0.2
342	0.21
343	0.21
344	0.27
345	0.29
346	0.27
347	0.33
348	0.33
349	0.39
350	0.39
351	0.39
352	0.35
353	0.36
354	0.35
355	0.33
356	0.31
357	0.23
358	0.27
359	0.28
360	0.28
361	0.26
362	0.27
363	0.25
364	0.26
365	0.31
366	0.25
367	0.27
368	0.26
369	0.22
370	0.19
371	0.16
372	0.15
373	0.1
374	0.09
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.19
393	0.24
394	0.24
395	0.3
396	0.38
397	0.44
398	0.48
399	0.55
400	0.53
401	0.56
402	0.56
403	0.55
404	0.46
405	0.4
406	0.38
407	0.3
408	0.27
409	0.19
410	0.16
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.07
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.11
432	0.11
433	0.15
434	0.24
435	0.31
436	0.32
437	0.37
438	0.41
439	0.42
440	0.46
441	0.51
442	0.51
443	0.52
444	0.62
445	0.67
446	0.73
447	0.81
448	0.84
449	0.82
450	0.79
451	0.75
452	0.73
453	0.72
454	0.67
455	0.63
456	0.65
457	0.64
458	0.62
459	0.68
460	0.6
461	0.53
462	0.49
463	0.43
464	0.39
465	0.36
466	0.35
467	0.3
468	0.32
469	0.31
470	0.31
471	0.32
472	0.32
473	0.31
474	0.3
475	0.29
476	0.3
477	0.35
478	0.44
479	0.52
480	0.56
481	0.64
482	0.72
483	0.75

A0A4Q4YX27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer