Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XX26

Protein Details
Accession A0A4Q4XX26    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-61LSLPEPPSKKAKRLLKKGKPLPVKPASHydrophilic
300-323ETELKEKKFKTRKWFVNRLHGRELHydrophilic
331-359DQTRYKKRFGKDAPEKKARFQKKTPAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-56PSKKAKRLLKKGKPLP
336-356KKRFGKDAPEKKARFQKKTPA
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAAVSAVEVETHVSTDEAASSKKRKSQVEEIEVDLSLPEPPSKKAKRLLKKGKPLPVKPASEDEAEDDGVPPSKTTTKDGKEKRSDYGIWIGNLPFYLTRADLFKWLIDNSGGAITEENITRVNLPMMKASGGKDRQKTGGAEQKPQNRGFAYVDFDSETAHVAAMALTESELGARRVLIKDSKSFEGRPQKESTSTENGPQNGTNGMPAAKNITSKKIYVGNLSFQATEDDLRAQFDKCGGIEWLKVATFEDSGKCKGYGWVKFKEPEAAEWAVKGFVKLREEVETEDDFREPKEGDAETELKEKKFKTRKWFVNRLHGRELKIDYAEDDQTRYKKRFGKDAPEKKARFQKKTPAAAAGGEGDSGSSKPAPAKKSYGNAGVASYLTGSVVKPEGKKIIFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.11
4 0.11
5 0.13
6 0.2
7 0.26
8 0.31
9 0.38
10 0.44
11 0.49
12 0.55
13 0.63
14 0.68
15 0.7
16 0.68
17 0.64
18 0.59
19 0.52
20 0.43
21 0.33
22 0.22
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.16
28 0.27
29 0.33
30 0.39
31 0.47
32 0.57
33 0.64
34 0.74
35 0.82
36 0.82
37 0.87
38 0.89
39 0.9
40 0.89
41 0.83
42 0.82
43 0.8
44 0.74
45 0.66
46 0.63
47 0.56
48 0.48
49 0.44
50 0.37
51 0.31
52 0.27
53 0.23
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.12
59 0.13
60 0.17
61 0.18
62 0.23
63 0.31
64 0.36
65 0.46
66 0.55
67 0.62
68 0.68
69 0.69
70 0.67
71 0.64
72 0.58
73 0.52
74 0.52
75 0.45
76 0.36
77 0.35
78 0.31
79 0.25
80 0.24
81 0.21
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.22
119 0.27
120 0.33
121 0.34
122 0.36
123 0.37
124 0.39
125 0.39
126 0.37
127 0.39
128 0.36
129 0.4
130 0.44
131 0.5
132 0.53
133 0.52
134 0.48
135 0.39
136 0.39
137 0.33
138 0.29
139 0.25
140 0.2
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.14
145 0.12
146 0.11
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.14
167 0.15
168 0.19
169 0.22
170 0.25
171 0.26
172 0.26
173 0.31
174 0.39
175 0.39
176 0.39
177 0.38
178 0.37
179 0.38
180 0.39
181 0.37
182 0.33
183 0.31
184 0.32
185 0.32
186 0.31
187 0.29
188 0.26
189 0.22
190 0.16
191 0.15
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.13
200 0.14
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.26
209 0.23
210 0.24
211 0.25
212 0.22
213 0.17
214 0.17
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.19
246 0.25
247 0.3
248 0.33
249 0.37
250 0.39
251 0.41
252 0.42
253 0.44
254 0.37
255 0.31
256 0.3
257 0.28
258 0.24
259 0.22
260 0.22
261 0.16
262 0.16
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.16
267 0.18
268 0.19
269 0.21
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.22
274 0.22
275 0.22
276 0.21
277 0.18
278 0.17
279 0.17
280 0.13
281 0.12
282 0.14
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.2
287 0.19
288 0.26
289 0.28
290 0.25
291 0.29
292 0.29
293 0.35
294 0.43
295 0.48
296 0.52
297 0.61
298 0.7
299 0.76
300 0.85
301 0.82
302 0.83
303 0.85
304 0.81
305 0.8
306 0.74
307 0.66
308 0.61
309 0.57
310 0.49
311 0.41
312 0.35
313 0.27
314 0.26
315 0.27
316 0.22
317 0.22
318 0.24
319 0.29
320 0.36
321 0.37
322 0.41
323 0.44
324 0.48
325 0.56
326 0.58
327 0.63
328 0.68
329 0.76
330 0.78
331 0.82
332 0.8
333 0.77
334 0.8
335 0.79
336 0.76
337 0.73
338 0.74
339 0.74
340 0.81
341 0.75
342 0.7
343 0.61
344 0.53
345 0.47
346 0.39
347 0.29
348 0.2
349 0.16
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.08
355 0.1
356 0.16
357 0.22
358 0.27
359 0.31
360 0.38
361 0.43
362 0.49
363 0.54
364 0.54
365 0.51
366 0.48
367 0.43
368 0.38
369 0.31
370 0.25
371 0.19
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.14
378 0.18
379 0.2
380 0.25
381 0.33