FuNGI

A0A4Q4XQL6

Protein Details

Accession

A0A4Q4XQL6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-224	APVARDPNPKRQQPKEREKKHGTQVH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-45	TPPPGAPPLRRPRGNGNPLVARKPPIKRPPP
212-216	PKERE
430-443	KLFGKGLRKALKRR
504-525	GKKAAAEAAKKGKSLKRPGSPL
535-541	TRKKKKT

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPPLGPHGQKPTPPPGAPPLRRPRGNGNPLVARKPPIKRPPPVPGSSSAKITNLPGTAPKPAPPRQQAQQALPNFDEIRRQNDGWTFPKPPDAQDYPLYITKKALKEGLRFHVMKFVPPHGRLARSGSTGIDPTNQDEFARPVTLQRRDPRQPPPGREVKEEVSEPIPVDSEEAQKIAQAKADREAQRALDDAQKAPVARDPNPKRQQPKEREKKHGTQVHYEARTEEQKKQAEIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGQYEAPLSHAKVGLQIHGGGFRMIPLEKWYKFTSKRGAIQTMSIEEAEKVMGKKMPIGRWAIRDAQREKTEQAMNESRTIINGRTAVKQESGTFKQASRREKQDHDDIDFSGEEFQDDDENPGYEPDRDEEVKEVNDRIRREQLKANAFGETDEKEVDKEEDEEKREELERKLFGKGLRKALKRRDKQFQYDDSDSSRERDPFASSESETDTDTEDEKKGEEQQKGDKDKANGSENNTKGSNTPQGKKAAAEAAKKGKSLKRPGSPLPSDSSGTESTRKKKKTGPSSAVPGSRGDTPLPRRTGAGSASDAEGTAGDMSDGAVAKKKRGPLGQASPAGSRAGSPAPPQQDKSVASSSKGAPTGTPRAGSPDNRAEPIDVSKYINPPTVQEIIDALPPRPEGVSMKKFITTFKSRLERDGQPDLMPQKVFLKLVLSCSVYSKEDKLLRRKPDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.56
3	0.55
4	0.54
5	0.54
6	0.6
7	0.62
8	0.66
9	0.67
10	0.69
11	0.72
12	0.73
13	0.73
14	0.73
15	0.77
16	0.73
17	0.69
18	0.69
19	0.69
20	0.7
21	0.62
22	0.57
23	0.55
24	0.57
25	0.6
26	0.61
27	0.66
28	0.69
29	0.74
30	0.79
31	0.8
32	0.76
33	0.7
34	0.67
35	0.66
36	0.6
37	0.56
38	0.48
39	0.41
40	0.38
41	0.36
42	0.33
43	0.25
44	0.24
45	0.25
46	0.25
47	0.31
48	0.3
49	0.34
50	0.38
51	0.45
52	0.53
53	0.54
54	0.58
55	0.59
56	0.67
57	0.67
58	0.66
59	0.67
60	0.62
61	0.6
62	0.54
63	0.51
64	0.43
65	0.37
66	0.38
67	0.32
68	0.34
69	0.35
70	0.35
71	0.35
72	0.39
73	0.44
74	0.4
75	0.44
76	0.4
77	0.36
78	0.43
79	0.4
80	0.38
81	0.4
82	0.4
83	0.38
84	0.39
85	0.42
86	0.38
87	0.42
88	0.41
89	0.33
90	0.34
91	0.37
92	0.36
93	0.35
94	0.38
95	0.38
96	0.43
97	0.5
98	0.52
99	0.53
100	0.5
101	0.48
102	0.5
103	0.44
104	0.43
105	0.39
106	0.4
107	0.4
108	0.4
109	0.47
110	0.43
111	0.46
112	0.42
113	0.45
114	0.4
115	0.35
116	0.35
117	0.29
118	0.26
119	0.25
120	0.23
121	0.21
122	0.19
123	0.19
124	0.21
125	0.2
126	0.18
127	0.19
128	0.2
129	0.18
130	0.19
131	0.15
132	0.2
133	0.28
134	0.34
135	0.4
136	0.45
137	0.53
138	0.58
139	0.65
140	0.67
141	0.69
142	0.71
143	0.7
144	0.71
145	0.71
146	0.68
147	0.66
148	0.62
149	0.55
150	0.51
151	0.46
152	0.39
153	0.31
154	0.29
155	0.24
156	0.19
157	0.16
158	0.12
159	0.13
160	0.12
161	0.14
162	0.14
163	0.14
164	0.13
165	0.14
166	0.16
167	0.15
168	0.17
169	0.16
170	0.17
171	0.21
172	0.3
173	0.3
174	0.31
175	0.33
176	0.3
177	0.28
178	0.28
179	0.26
180	0.22
181	0.22
182	0.2
183	0.2
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.21
188	0.2
189	0.23
190	0.33
191	0.39
192	0.48
193	0.56
194	0.62
195	0.67
196	0.73
197	0.78
198	0.78
199	0.82
200	0.82
201	0.83
202	0.86
203	0.86
204	0.84
205	0.83
206	0.8
207	0.72
208	0.69
209	0.67
210	0.66
211	0.6
212	0.52
213	0.43
214	0.4
215	0.44
216	0.4
217	0.38
218	0.37
219	0.38
220	0.39
221	0.44
222	0.45
223	0.43
224	0.43
225	0.41
226	0.36
227	0.34
228	0.32
229	0.27
230	0.25
231	0.18
232	0.16
233	0.13
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.11
251	0.12
252	0.11
253	0.12
254	0.12
255	0.1
256	0.14
257	0.14
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.1
271	0.16
272	0.17
273	0.2
274	0.22
275	0.28
276	0.32
277	0.37
278	0.41
279	0.41
280	0.47
281	0.47
282	0.49
283	0.42
284	0.41
285	0.37
286	0.29
287	0.24
288	0.18
289	0.14
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.13
299	0.18
300	0.2
301	0.22
302	0.27
303	0.28
304	0.29
305	0.32
306	0.35
307	0.35
308	0.4
309	0.39
310	0.41
311	0.41
312	0.4
313	0.38
314	0.36
315	0.33
316	0.27
317	0.3
318	0.29
319	0.28
320	0.28
321	0.28
322	0.22
323	0.21
324	0.21
325	0.16
326	0.12
327	0.14
328	0.14
329	0.15
330	0.17
331	0.17
332	0.17
333	0.18
334	0.18
335	0.21
336	0.21
337	0.22
338	0.22
339	0.22
340	0.28
341	0.32
342	0.37
343	0.36
344	0.41
345	0.43
346	0.46
347	0.49
348	0.5
349	0.47
350	0.44
351	0.4
352	0.33
353	0.29
354	0.25
355	0.21
356	0.14
357	0.11
358	0.08
359	0.06
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.13
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.15
380	0.16
381	0.2
382	0.21
383	0.23
384	0.3
385	0.31
386	0.33
387	0.37
388	0.41
389	0.42
390	0.44
391	0.41
392	0.34
393	0.31
394	0.29
395	0.25
396	0.18
397	0.13
398	0.1
399	0.1
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.1
405	0.12
406	0.16
407	0.19
408	0.2
409	0.19
410	0.2
411	0.23
412	0.24
413	0.23
414	0.24
415	0.25
416	0.26
417	0.27
418	0.28
419	0.28
420	0.34
421	0.36
422	0.42
423	0.46
424	0.5
425	0.56
426	0.64
427	0.71
428	0.71
429	0.73
430	0.74
431	0.73
432	0.75
433	0.75
434	0.71
435	0.68
436	0.62
437	0.57
438	0.49
439	0.45
440	0.37
441	0.32
442	0.29
443	0.22
444	0.21
445	0.2
446	0.2
447	0.18
448	0.2
449	0.21
450	0.18
451	0.18
452	0.19
453	0.18
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.19
465	0.25
466	0.27
467	0.28
468	0.36
469	0.44
470	0.48
471	0.5
472	0.47
473	0.43
474	0.45
475	0.46
476	0.44
477	0.39
478	0.41
479	0.46
480	0.42
481	0.43
482	0.39
483	0.34
484	0.29
485	0.3
486	0.33
487	0.3
488	0.34
489	0.35
490	0.39
491	0.39
492	0.39
493	0.37
494	0.36
495	0.35
496	0.34
497	0.35
498	0.4
499	0.4
500	0.41
501	0.44
502	0.42
503	0.46
504	0.52
505	0.55
506	0.54
507	0.59
508	0.65
509	0.68
510	0.66
511	0.6
512	0.55
513	0.49
514	0.42
515	0.36
516	0.34
517	0.27
518	0.26
519	0.31
520	0.32
521	0.38
522	0.46
523	0.48
524	0.49
525	0.54
526	0.62
527	0.65
528	0.7
529	0.69
530	0.66
531	0.71
532	0.72
533	0.68
534	0.59
535	0.49
536	0.4
537	0.35
538	0.3
539	0.24
540	0.25
541	0.3
542	0.36
543	0.38
544	0.37
545	0.35
546	0.36
547	0.38
548	0.32
549	0.29
550	0.23
551	0.21
552	0.21
553	0.2
554	0.18
555	0.14
556	0.12
557	0.09
558	0.07
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.12
567	0.13
568	0.18
569	0.21
570	0.26
571	0.31
572	0.35
573	0.41
574	0.44
575	0.52
576	0.57
577	0.58
578	0.56
579	0.5
580	0.47
581	0.41
582	0.32
583	0.23
584	0.17
585	0.16
586	0.15
587	0.17
588	0.23
589	0.3
590	0.34
591	0.36
592	0.37
593	0.4
594	0.4
595	0.42
596	0.43
597	0.37
598	0.35
599	0.37
600	0.36
601	0.36
602	0.36
603	0.3
604	0.25
605	0.3
606	0.35
607	0.34
608	0.32
609	0.27
610	0.32
611	0.38
612	0.39
613	0.4
614	0.42
615	0.43
616	0.44
617	0.44
618	0.39
619	0.36
620	0.38
621	0.35
622	0.26
623	0.27
624	0.29
625	0.32
626	0.34
627	0.37
628	0.32
629	0.3
630	0.33
631	0.33
632	0.3
633	0.26
634	0.25
635	0.21
636	0.25
637	0.25
638	0.2
639	0.19
640	0.19
641	0.19
642	0.17
643	0.18
644	0.19
645	0.27
646	0.34
647	0.35
648	0.37
649	0.39
650	0.4
651	0.41
652	0.44
653	0.42
654	0.4
655	0.46
656	0.53
657	0.51
658	0.56
659	0.6
660	0.59
661	0.58
662	0.61
663	0.54
664	0.46
665	0.51
666	0.48
667	0.46
668	0.38
669	0.33
670	0.29
671	0.3
672	0.29
673	0.24
674	0.26
675	0.23
676	0.27
677	0.3
678	0.28
679	0.25
680	0.28
681	0.3
682	0.29
683	0.3
684	0.28
685	0.32
686	0.37
687	0.45
688	0.53
689	0.58

A0A4Q4XQL6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer