Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YBE1

Protein Details
Accession A0A4Q4YBE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-88QSQSSESLRPRPKGRRRSTNLANISPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-78RPKGRR
Subcellular Location(s) nucl 13mito 13mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040939  Vps38  
Gene Ontology GO:0034272  C:phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II  
Pfam View protein in Pfam  
PF17649  VPS38  
Amino Acid Sequences MLPQNRRLRHLQGIYLRNLSFSVNRGRTIDDLDADLKPNTNSSHNSGKLEAQGDDAPGPQLHQSQSSESLRPRPKGRRRSTNLANISPVTRQKRLEYAVEGRAADVFFSLHCEGVEYPVYISEVGERAMNFNFRFFDLSELGPFVTRSSVFTVKVWAKRWHAWSLLLEQHVDLRSLNYLGTLRNHQFPPNCLVFHLADGIYCLELSGKRPEPKQSPVLPTSSYNALMKLSNLDNSIQDALATRETLTAQINEILERTPSNNAPQARESSLLASKYLSSQRRSLRAAQARRAELQASIDTRRKAIRDGREAQSRAEADVQHEQSKLSAARAHLAGTREGIRGQRRRICEDLAAIFPIAPPRGPGSATGGSAPPLSFGICGVALPNTDYDPASSSAAEDSLSAALGYVAQLTDLLQYYLCVPLPYPVTPFGSLSSVRDDISLLPEAALPKQRQQKQPRLGQGRDFPLFLRGGATAQYRFDYAWFLLNKDIEALCVAGAGLKVVDIRHTLPNLKYLLYVCSAGTDGVPERRRGGIRGLLWAGRVMKSRAGIGSSASADGLLAPDDAGSAAASSRCGSTDSEAVGGGGGGARLQEQLRLALAKENGHDADAAGLPFDEGTKLTLRTKGLREDVGAHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.55
4 0.46
5 0.41
6 0.36
7 0.29
8 0.27
9 0.32
10 0.3
11 0.32
12 0.33
13 0.35
14 0.34
15 0.37
16 0.35
17 0.26
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.24
23 0.21
24 0.19
25 0.21
26 0.2
27 0.23
28 0.25
29 0.29
30 0.38
31 0.4
32 0.42
33 0.41
34 0.42
35 0.41
36 0.4
37 0.35
38 0.28
39 0.26
40 0.24
41 0.23
42 0.21
43 0.18
44 0.15
45 0.16
46 0.15
47 0.17
48 0.17
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.31
53 0.34
54 0.37
55 0.37
56 0.46
57 0.49
58 0.54
59 0.6
60 0.63
61 0.69
62 0.75
63 0.82
64 0.83
65 0.84
66 0.88
67 0.88
68 0.87
69 0.84
70 0.76
71 0.69
72 0.6
73 0.53
74 0.48
75 0.47
76 0.43
77 0.4
78 0.4
79 0.4
80 0.45
81 0.47
82 0.46
83 0.45
84 0.45
85 0.44
86 0.44
87 0.41
88 0.34
89 0.31
90 0.27
91 0.2
92 0.14
93 0.1
94 0.06
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.17
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.18
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.21
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.15
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.26
140 0.3
141 0.35
142 0.39
143 0.41
144 0.43
145 0.48
146 0.53
147 0.5
148 0.46
149 0.43
150 0.4
151 0.39
152 0.38
153 0.32
154 0.28
155 0.23
156 0.25
157 0.22
158 0.2
159 0.15
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.13
168 0.19
169 0.2
170 0.25
171 0.26
172 0.3
173 0.31
174 0.32
175 0.36
176 0.33
177 0.31
178 0.26
179 0.28
180 0.23
181 0.22
182 0.21
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.1
193 0.16
194 0.21
195 0.25
196 0.28
197 0.35
198 0.39
199 0.44
200 0.49
201 0.49
202 0.49
203 0.48
204 0.48
205 0.42
206 0.38
207 0.35
208 0.29
209 0.25
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.18
248 0.19
249 0.21
250 0.23
251 0.24
252 0.23
253 0.24
254 0.21
255 0.19
256 0.2
257 0.18
258 0.16
259 0.14
260 0.12
261 0.14
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.28
266 0.32
267 0.37
268 0.4
269 0.42
270 0.44
271 0.49
272 0.51
273 0.52
274 0.53
275 0.49
276 0.48
277 0.44
278 0.35
279 0.27
280 0.23
281 0.19
282 0.15
283 0.17
284 0.19
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.23
290 0.27
291 0.31
292 0.36
293 0.41
294 0.45
295 0.5
296 0.51
297 0.46
298 0.43
299 0.36
300 0.28
301 0.25
302 0.2
303 0.15
304 0.2
305 0.21
306 0.19
307 0.19
308 0.18
309 0.16
310 0.18
311 0.16
312 0.11
313 0.12
314 0.1
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.22
327 0.26
328 0.33
329 0.37
330 0.38
331 0.43
332 0.44
333 0.42
334 0.35
335 0.32
336 0.28
337 0.23
338 0.2
339 0.15
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.14
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.09
408 0.12
409 0.12
410 0.14
411 0.15
412 0.17
413 0.18
414 0.18
415 0.16
416 0.17
417 0.16
418 0.16
419 0.18
420 0.16
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.15
426 0.15
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.14
432 0.19
433 0.17
434 0.23
435 0.32
436 0.4
437 0.48
438 0.57
439 0.65
440 0.69
441 0.76
442 0.79
443 0.78
444 0.74
445 0.71
446 0.68
447 0.64
448 0.56
449 0.48
450 0.38
451 0.33
452 0.3
453 0.24
454 0.18
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.16
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.12
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.19
471 0.2
472 0.19
473 0.19
474 0.18
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.08
489 0.09
490 0.12
491 0.16
492 0.19
493 0.23
494 0.23
495 0.28
496 0.28
497 0.27
498 0.26
499 0.23
500 0.22
501 0.2
502 0.2
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.19
511 0.22
512 0.23
513 0.25
514 0.3
515 0.31
516 0.31
517 0.35
518 0.34
519 0.32
520 0.37
521 0.37
522 0.33
523 0.32
524 0.33
525 0.29
526 0.25
527 0.27
528 0.22
529 0.23
530 0.23
531 0.25
532 0.23
533 0.23
534 0.2
535 0.18
536 0.2
537 0.17
538 0.17
539 0.14
540 0.12
541 0.11
542 0.1
543 0.09
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.11
560 0.12
561 0.14
562 0.18
563 0.18
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.15
568 0.13
569 0.09
570 0.06
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.07
576 0.08
577 0.1
578 0.11
579 0.13
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.2
584 0.22
585 0.23
586 0.23
587 0.27
588 0.25
589 0.24
590 0.24
591 0.18
592 0.18
593 0.17
594 0.16
595 0.11
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.08
601 0.06
602 0.09
603 0.12
604 0.15
605 0.19
606 0.24
607 0.28
608 0.34
609 0.39
610 0.45
611 0.47
612 0.47
613 0.46