Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XQ58

Protein Details
Accession A0A4Q4XQ58    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-42CSTTMASPFKRRKTRWGPENGAHydrophilic
99-122DASGKRVNTRHRRYRERLENERHABasic
244-265AVTTPEPKNERKRQQLRDLAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 11, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences MMAQAGNHEQIKHTVELSDGCSTTMASPFKRRKTRWGPENGALGLSNFTTAITAPMTSEQIDAYVMQVRIEEITQKLRFDHVVPADLDRRSPSPPPRYDASGKRVNTRHRRYRERLENERHALVRHAAHAIPNYRAPQGYVRGPRRLITDRVYIPVKDFPEVNFIGQLLGPRGRSIAIMNAQSGATIAIRGKGSVKEGRGRVRDGPARTDINDQEGPLHCLITADTQDKVDKAKALVQAVIETAVTTPEPKNERKRQQLRDLAVANGTFRDDEGRCGTAGARERPMAIGVICHVCNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.23
5 0.23
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.32
15 0.41
16 0.51
17 0.6
18 0.62
19 0.67
20 0.74
21 0.81
22 0.81
23 0.83
24 0.8
25 0.76
26 0.78
27 0.67
28 0.57
29 0.47
30 0.37
31 0.28
32 0.2
33 0.14
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.1
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.27
68 0.21
69 0.23
70 0.22
71 0.25
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.26
79 0.31
80 0.36
81 0.4
82 0.43
83 0.44
84 0.48
85 0.52
86 0.52
87 0.51
88 0.49
89 0.47
90 0.51
91 0.53
92 0.58
93 0.62
94 0.65
95 0.68
96 0.69
97 0.78
98 0.78
99 0.83
100 0.83
101 0.82
102 0.82
103 0.8
104 0.79
105 0.72
106 0.68
107 0.58
108 0.47
109 0.4
110 0.32
111 0.25
112 0.18
113 0.16
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.18
126 0.22
127 0.28
128 0.31
129 0.34
130 0.35
131 0.35
132 0.37
133 0.37
134 0.34
135 0.29
136 0.31
137 0.28
138 0.3
139 0.3
140 0.25
141 0.23
142 0.24
143 0.21
144 0.17
145 0.16
146 0.13
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.15
181 0.18
182 0.21
183 0.25
184 0.3
185 0.37
186 0.38
187 0.4
188 0.4
189 0.43
190 0.46
191 0.42
192 0.42
193 0.39
194 0.38
195 0.37
196 0.38
197 0.31
198 0.31
199 0.3
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.25
204 0.21
205 0.2
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.16
220 0.21
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.23
225 0.21
226 0.19
227 0.18
228 0.13
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.15
236 0.21
237 0.29
238 0.39
239 0.49
240 0.59
241 0.68
242 0.77
243 0.8
244 0.85
245 0.87
246 0.81
247 0.79
248 0.71
249 0.61
250 0.54
251 0.45
252 0.35
253 0.26
254 0.22
255 0.14
256 0.12
257 0.16
258 0.14
259 0.18
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.23
266 0.3
267 0.31
268 0.31
269 0.31
270 0.32
271 0.32
272 0.32
273 0.28
274 0.2
275 0.17
276 0.16
277 0.2