Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PYP8

Protein Details
Accession J8PYP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-167FTEARATKTKKQGTRNPKKTKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-167TKTKKQGTRNPKKTKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSRKLKKTNLFNKDVSSLLYAYGDVPQPLQATVQCLDELVSGYLVDICTNAFHTAQNSQRNKLRLEDLKFALRNDPVKLGRAEELIATNKLITEAKKQFNETDNQNSLKRYRAGDEEGDEMEEDEDEQPITDEDDETNGRNNGKQFTEARATKTKKQGTRNPKKTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.43
3 0.35
4 0.26
5 0.2
6 0.18
7 0.14
8 0.12
9 0.14
10 0.13
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.09
27 0.08
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.1
41 0.15
42 0.21
43 0.3
44 0.32
45 0.35
46 0.4
47 0.42
48 0.42
49 0.39
50 0.4
51 0.37
52 0.39
53 0.4
54 0.38
55 0.41
56 0.41
57 0.38
58 0.34
59 0.29
60 0.27
61 0.22
62 0.25
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.15
81 0.21
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.36
88 0.33
89 0.34
90 0.33
91 0.34
92 0.34
93 0.34
94 0.32
95 0.33
96 0.31
97 0.25
98 0.24
99 0.25
100 0.27
101 0.27
102 0.28
103 0.25
104 0.23
105 0.21
106 0.19
107 0.15
108 0.12
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.12
123 0.12
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.23
129 0.24
130 0.25
131 0.29
132 0.27
133 0.31
134 0.39
135 0.39
136 0.42
137 0.48
138 0.52
139 0.55
140 0.63
141 0.66
142 0.65
143 0.72
144 0.77
145 0.78
146 0.84
147 0.87