Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PKG7

Protein Details
Accession J8PKG7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-423KEEIQKREIEKERNLRRLKRETDRLSRRGRRRLDDLETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-417EKERNLRRLKRETDRLSRRGRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017393  Sfh1/SNF5  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSHQNQLIPQAYISNFHNRLTNEDDGIPIFTMAQQTRQHKRAKVVNYAEYDNDIFDEFNMNGSNFASTDTHYKDNATSHENTPALANGVTTDGSEYNALDNINNTENILSNHKYDVGSNMVVESLSGLNNNNNVGNGPNNAKAQAQDIGNAVLPDLQDQHHSPFNVLRYPKIRDTFINGKVVTPYRLNIDDKTKANANSGEAIMIPITLDIEHMGHTIKDQFLWNYNDDSITPEEFASIYCKDLDMTSATLQTQIANVIKEQLKDLENVAATEIMSDLHVIINLTCNLQDRFFEDNFQWNLNDKSLTPEIFAVSIVQDLGLTREFIPLISQALHETILKIKKDWVDGHLIQDHVPNDAAFGYLSGIRLDIDELGSNWCPRVEILTKEEIQKREIEKERNLRRLKRETDRLSRRGRRRLDDLETTMRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.36
5 0.32
6 0.37
7 0.39
8 0.39
9 0.32
10 0.31
11 0.31
12 0.26
13 0.27
14 0.22
15 0.16
16 0.13
17 0.11
18 0.17
19 0.16
20 0.22
21 0.28
22 0.36
23 0.45
24 0.52
25 0.59
26 0.58
27 0.66
28 0.68
29 0.68
30 0.7
31 0.68
32 0.68
33 0.64
34 0.61
35 0.54
36 0.48
37 0.41
38 0.31
39 0.25
40 0.18
41 0.13
42 0.11
43 0.13
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.1
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.17
56 0.2
57 0.23
58 0.23
59 0.24
60 0.24
61 0.27
62 0.29
63 0.28
64 0.28
65 0.27
66 0.34
67 0.32
68 0.3
69 0.27
70 0.24
71 0.21
72 0.17
73 0.15
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.18
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.09
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.19
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.09
145 0.11
146 0.13
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.18
151 0.2
152 0.23
153 0.22
154 0.24
155 0.25
156 0.3
157 0.35
158 0.34
159 0.34
160 0.29
161 0.36
162 0.4
163 0.39
164 0.4
165 0.35
166 0.32
167 0.33
168 0.34
169 0.28
170 0.21
171 0.18
172 0.15
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.23
177 0.27
178 0.27
179 0.29
180 0.29
181 0.26
182 0.27
183 0.26
184 0.22
185 0.18
186 0.17
187 0.14
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.05
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.17
217 0.13
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.13
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.15
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.18
279 0.18
280 0.2
281 0.18
282 0.25
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.22
290 0.14
291 0.19
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.16
324 0.21
325 0.22
326 0.22
327 0.26
328 0.28
329 0.33
330 0.35
331 0.32
332 0.34
333 0.35
334 0.39
335 0.37
336 0.35
337 0.3
338 0.31
339 0.28
340 0.21
341 0.2
342 0.15
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.19
368 0.2
369 0.23
370 0.27
371 0.34
372 0.37
373 0.44
374 0.5
375 0.46
376 0.43
377 0.45
378 0.44
379 0.47
380 0.53
381 0.53
382 0.56
383 0.65
384 0.73
385 0.76
386 0.81
387 0.8
388 0.81
389 0.83
390 0.83
391 0.83
392 0.84
393 0.83
394 0.85
395 0.87
396 0.86
397 0.87
398 0.88
399 0.87
400 0.87
401 0.86
402 0.83
403 0.81
404 0.81
405 0.78
406 0.76
407 0.73