Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XVF8

Protein Details
Accession A0A4Q4XVF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-280DLRKAEEVRMRKRRERMAKNGDDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-269RKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPTKKRKTASSAKTTADTDTAAPTESTEQMVDNSEETSGADSTEQPATKPERHEEGESSTTTPTTNPADKAKERMARFRALQARAKTSSDQNLQEATKESQRLATDPTALTALHRRRDIAAHKLLKAETEEGGEDFERKRAWDWTAEESERWDRRLRKKAAHRDNNAFQDYRAEGVKVYKRQVRDMAAPDLERYARDKMAAIERAAASGGLDIVETEDGELVAVDRDGSFYSTADSTAFVENRPDRAAVDRLVSDLRKAEEVRMRKRRERMAKNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTADIRDSFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.61
3 0.54
4 0.45
5 0.36
6 0.26
7 0.23
8 0.2
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.16
19 0.16
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.16
32 0.16
33 0.14
34 0.2
35 0.25
36 0.29
37 0.34
38 0.36
39 0.38
40 0.42
41 0.45
42 0.42
43 0.42
44 0.41
45 0.37
46 0.34
47 0.27
48 0.24
49 0.21
50 0.18
51 0.16
52 0.18
53 0.2
54 0.22
55 0.27
56 0.34
57 0.35
58 0.41
59 0.45
60 0.47
61 0.47
62 0.53
63 0.51
64 0.5
65 0.49
66 0.52
67 0.52
68 0.5
69 0.55
70 0.49
71 0.51
72 0.48
73 0.49
74 0.43
75 0.4
76 0.41
77 0.39
78 0.37
79 0.33
80 0.34
81 0.31
82 0.3
83 0.29
84 0.24
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.19
100 0.22
101 0.24
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.31
106 0.34
107 0.34
108 0.38
109 0.37
110 0.37
111 0.39
112 0.37
113 0.33
114 0.3
115 0.23
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.17
131 0.2
132 0.23
133 0.27
134 0.27
135 0.25
136 0.26
137 0.31
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.31
142 0.4
143 0.5
144 0.52
145 0.54
146 0.63
147 0.71
148 0.77
149 0.79
150 0.75
151 0.72
152 0.74
153 0.7
154 0.62
155 0.52
156 0.4
157 0.34
158 0.28
159 0.22
160 0.17
161 0.11
162 0.1
163 0.15
164 0.2
165 0.21
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.31
170 0.35
171 0.33
172 0.33
173 0.33
174 0.33
175 0.31
176 0.3
177 0.27
178 0.25
179 0.21
180 0.17
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.21
188 0.23
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.16
195 0.1
196 0.07
197 0.07
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.19
229 0.2
230 0.22
231 0.23
232 0.21
233 0.19
234 0.23
235 0.25
236 0.2
237 0.21
238 0.19
239 0.19
240 0.23
241 0.22
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.21
247 0.25
248 0.3
249 0.38
250 0.48
251 0.55
252 0.61
253 0.65
254 0.73
255 0.77
256 0.8
257 0.81
258 0.82
259 0.83
260 0.82
261 0.8
262 0.75
263 0.65
264 0.55
265 0.45
266 0.38
267 0.28
268 0.22
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.26
273 0.27
274 0.31
275 0.38
276 0.48
277 0.5
278 0.57
279 0.65
280 0.66
281 0.73
282 0.74
283 0.76
284 0.7
285 0.7
286 0.7
287 0.63
288 0.61
289 0.57
290 0.54
291 0.5
292 0.48
293 0.48
294 0.44
295 0.43
296 0.39