FuNGI

A0A4Q4ZCL8

Protein Details

Accession

A0A4Q4ZCL8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
68-89	DTYAKPQASTPKRNKKGSASSS	Hydrophilic
678-703	LPLLRLQSRAHRRHVHDRRRLPQGYF	Hydrophilic
763-786	GSTLGWGRSRRNRGRGRRGFVADL	Hydrophilic
788-808	EGPLRPPAGRRGPRRGCVRRW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-22	KGGKRERDEDGASRPKKK
324-341	AARTGGKRGAKRVPPKDK
661-692	AHEPPPQGRPRRRVRAWLPLLRLQSRAHRRHV
770-803	RSRRNRGRGRRGFVADLAEGPLRPPAGRRGPRRG

Subcellular Location(s)

plas 20, cyto 3, nucl 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016020 C:membrane GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MADKKGGKRERDEDGASRPKKKVAVQSSSSQSPQSNTIRVASIRTAKKFPPIIATSPGLCIPSSMRFDTYAKPQASTPKRNKKGSASSSELLLHSSSHPKLDYTAKEDGPGGREPHLKHYIGVFDPKTAQLTVVEAKKMAVRGVVRTLQPSEESTEERAMSKTMMQMRTDLGHAFGTKKAKKALASITENAIASEKAIAGTGGDANKLNASQQAVMESIGEVTVGMASREDLQAAADAAKPVPPGNFDAKEIQDVYKPEELIGEDVLNAIPIKDWQDQIKKNLNKQHSSAFVAGRLVSIGQGPDAAKRLRTLRYLDLLIKFQRAARTGGKRGAKRVPPKDKLREIMQPAPEPVIENIRRKFSTNGEMTKFYVDLVHTYCCALAAILANYRFDTSTLRYDMGLDDKQFAQYFREIGGRIRVERGFSGRRDDERSGRNVQYVLSPQGPGVSWVVVALQFSMHYKVFGYRKQLCPDGDESTIVRLFHLVEFYYWAIRIFALHHHHGERGSHRQEISEDHRDPLNEVLFLYATLFGVFGIVLARVYRCGAGLSDTDYYDVIFMGKTDIAIVILWLLPCCLSKLSILHLYHRVFRTRTVGIAAPLVAALSVLCVLAYVVANFTLVRPLSVYIEGTGTQRDDERRLEQPHPRLRRFWSAALVPRAPAHEPPPQGRPRRRVRAWLPLLRLQSRAHRRHVHDRRRLPQGYFLDDVEPAVDIVAACIPTMRPLLGRSEHSEHGTMKEGQSAERRLLDNPSANTDRETGSGGGSTLGWGRSRRNRGRGRRGFVADLAEGPLRPPAGRRGPRRGCVRRW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.65
3	0.62
4	0.64
5	0.59
6	0.57
7	0.58
8	0.6
9	0.61
10	0.6
11	0.63
12	0.61
13	0.66
14	0.68
15	0.67
16	0.61
17	0.54
18	0.46
19	0.39
20	0.43
21	0.4
22	0.38
23	0.35
24	0.36
25	0.37
26	0.35
27	0.37
28	0.35
29	0.38
30	0.42
31	0.45
32	0.47
33	0.45
34	0.53
35	0.54
36	0.49
37	0.49
38	0.46
39	0.45
40	0.46
41	0.46
42	0.39
43	0.36
44	0.36
45	0.27
46	0.23
47	0.2
48	0.17
49	0.21
50	0.25
51	0.25
52	0.25
53	0.27
54	0.3
55	0.33
56	0.39
57	0.41
58	0.37
59	0.37
60	0.38
61	0.46
62	0.53
63	0.59
64	0.61
65	0.64
66	0.72
67	0.78
68	0.81
69	0.8
70	0.81
71	0.79
72	0.77
73	0.73
74	0.64
75	0.6
76	0.56
77	0.46
78	0.37
79	0.28
80	0.22
81	0.17
82	0.23
83	0.21
84	0.22
85	0.22
86	0.22
87	0.25
88	0.31
89	0.33
90	0.32
91	0.37
92	0.35
93	0.36
94	0.37
95	0.36
96	0.32
97	0.32
98	0.29
99	0.27
100	0.32
101	0.32
102	0.39
103	0.43
104	0.4
105	0.36
106	0.37
107	0.38
108	0.34
109	0.4
110	0.32
111	0.28
112	0.29
113	0.29
114	0.28
115	0.23
116	0.21
117	0.14
118	0.17
119	0.2
120	0.22
121	0.22
122	0.19
123	0.2
124	0.22
125	0.22
126	0.19
127	0.18
128	0.16
129	0.19
130	0.25
131	0.28
132	0.27
133	0.29
134	0.3
135	0.27
136	0.27
137	0.26
138	0.23
139	0.21
140	0.23
141	0.22
142	0.24
143	0.23
144	0.23
145	0.22
146	0.19
147	0.17
148	0.17
149	0.19
150	0.24
151	0.26
152	0.26
153	0.26
154	0.27
155	0.28
156	0.27
157	0.22
158	0.16
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.18
163	0.26
164	0.27
165	0.31
166	0.34
167	0.36
168	0.36
169	0.4
170	0.44
171	0.43
172	0.46
173	0.44
174	0.41
175	0.4
176	0.38
177	0.33
178	0.26
179	0.17
180	0.12
181	0.11
182	0.08
183	0.06
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.06
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.09
205	0.08
206	0.06
207	0.06
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.13
232	0.19
233	0.2
234	0.21
235	0.24
236	0.24
237	0.26
238	0.26
239	0.23
240	0.2
241	0.2
242	0.22
243	0.22
244	0.21
245	0.18
246	0.18
247	0.18
248	0.15
249	0.15
250	0.1
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.04
258	0.05
259	0.1
260	0.12
261	0.13
262	0.19
263	0.28
264	0.31
265	0.38
266	0.47
267	0.48
268	0.52
269	0.58
270	0.59
271	0.54
272	0.53
273	0.51
274	0.45
275	0.44
276	0.4
277	0.33
278	0.27
279	0.24
280	0.22
281	0.17
282	0.13
283	0.09
284	0.07
285	0.07
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.08
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.14
295	0.18
296	0.2
297	0.23
298	0.26
299	0.26
300	0.28
301	0.3
302	0.31
303	0.29
304	0.3
305	0.27
306	0.25
307	0.22
308	0.2
309	0.21
310	0.19
311	0.21
312	0.25
313	0.31
314	0.33
315	0.39
316	0.44
317	0.42
318	0.46
319	0.5
320	0.5
321	0.53
322	0.6
323	0.64
324	0.66
325	0.73
326	0.76
327	0.73
328	0.7
329	0.64
330	0.61
331	0.56
332	0.54
333	0.48
334	0.41
335	0.36
336	0.33
337	0.29
338	0.23
339	0.18
340	0.2
341	0.21
342	0.25
343	0.26
344	0.3
345	0.31
346	0.32
347	0.33
348	0.29
349	0.33
350	0.32
351	0.35
352	0.33
353	0.34
354	0.33
355	0.31
356	0.27
357	0.19
358	0.16
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.13
382	0.14
383	0.15
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.16
388	0.15
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.17
403	0.16
404	0.16
405	0.19
406	0.18
407	0.17
408	0.17
409	0.21
410	0.2
411	0.2
412	0.25
413	0.24
414	0.27
415	0.31
416	0.33
417	0.33
418	0.33
419	0.36
420	0.36
421	0.34
422	0.32
423	0.27
424	0.25
425	0.22
426	0.21
427	0.19
428	0.15
429	0.14
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.11
434	0.1
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.13
450	0.16
451	0.19
452	0.26
453	0.3
454	0.36
455	0.39
456	0.43
457	0.38
458	0.38
459	0.38
460	0.33
461	0.28
462	0.23
463	0.2
464	0.18
465	0.19
466	0.16
467	0.13
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.1
472	0.08
473	0.07
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.07
483	0.12
484	0.16
485	0.18
486	0.2
487	0.21
488	0.23
489	0.23
490	0.25
491	0.24
492	0.28
493	0.29
494	0.29
495	0.29
496	0.28
497	0.28
498	0.31
499	0.33
500	0.33
501	0.32
502	0.3
503	0.31
504	0.3
505	0.3
506	0.28
507	0.22
508	0.13
509	0.12
510	0.12
511	0.1
512	0.1
513	0.09
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.08
534	0.09
535	0.11
536	0.12
537	0.12
538	0.12
539	0.12
540	0.11
541	0.09
542	0.09
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.09
565	0.1
566	0.14
567	0.22
568	0.22
569	0.25
570	0.32
571	0.33
572	0.37
573	0.39
574	0.39
575	0.32
576	0.34
577	0.36
578	0.3
579	0.29
580	0.26
581	0.25
582	0.21
583	0.21
584	0.18
585	0.13
586	0.11
587	0.1
588	0.07
589	0.05
590	0.04
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.04
598	0.05
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.06
604	0.06
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.11
610	0.12
611	0.14
612	0.14
613	0.1
614	0.12
615	0.13
616	0.13
617	0.13
618	0.12
619	0.11
620	0.14
621	0.17
622	0.19
623	0.22
624	0.26
625	0.32
626	0.37
627	0.42
628	0.47
629	0.54
630	0.6
631	0.66
632	0.66
633	0.63
634	0.64
635	0.67
636	0.64
637	0.58
638	0.54
639	0.5
640	0.54
641	0.55
642	0.51
643	0.41
644	0.38
645	0.37
646	0.32
647	0.29
648	0.26
649	0.27
650	0.3
651	0.33
652	0.41
653	0.47
654	0.55
655	0.62
656	0.67
657	0.71
658	0.77
659	0.78
660	0.79
661	0.78
662	0.79
663	0.79
664	0.77
665	0.72
666	0.68
667	0.69
668	0.61
669	0.57
670	0.49
671	0.49
672	0.52
673	0.53
674	0.56
675	0.59
676	0.64
677	0.72
678	0.8
679	0.81
680	0.81
681	0.85
682	0.83
683	0.84
684	0.81
685	0.72
686	0.7
687	0.65
688	0.6
689	0.52
690	0.45
691	0.36
692	0.32
693	0.29
694	0.2
695	0.15
696	0.1
697	0.07
698	0.07
699	0.05
700	0.06
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.1
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.13
711	0.2
712	0.23
713	0.27
714	0.31
715	0.36
716	0.38
717	0.39
718	0.41
719	0.36
720	0.34
721	0.35
722	0.31
723	0.27
724	0.29
725	0.26
726	0.27
727	0.33
728	0.34
729	0.32
730	0.35
731	0.36
732	0.32
733	0.37
734	0.39
735	0.38
736	0.37
737	0.42
738	0.4
739	0.39
740	0.39
741	0.36
742	0.31
743	0.26
744	0.27
745	0.19
746	0.17
747	0.17
748	0.15
749	0.14
750	0.12
751	0.12
752	0.11
753	0.13
754	0.15
755	0.17
756	0.26
757	0.35
758	0.46
759	0.55
760	0.63
761	0.71
762	0.79
763	0.88
764	0.89
765	0.87
766	0.86
767	0.82
768	0.75
769	0.67
770	0.61
771	0.5
772	0.41
773	0.36
774	0.28
775	0.23
776	0.19
777	0.2
778	0.16
779	0.15
780	0.17
781	0.24
782	0.34
783	0.43
784	0.51
785	0.6
786	0.68
787	0.76
788	0.84

A0A4Q4ZCL8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer