Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XJX2

Protein Details
Accession A0A4Q4XJX2    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-39EAEATVPRKKSKKEKKDKKSKLQNDDSGVSHydrophilic
49-87ASDAAEEKPKKKKKKDKKDKKDKKDMKEKEKKRDSEQSGBasic
89-117NGDDSERRSKKEKRDKKKKRDAEDDGEANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-30PRKKSKKEKKDKKSK
56-83KPKKKKKKDKKDKKDKKDMKEKEKKRDS
93-108SERRSKKEKRDKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSKHILEDVEAEATVPRKKSKKEKKDKKSKLQNDDSGVSTPVQDGEVVASDAAEEKPKKKKKKDKKDKKDKKDMKEKEKKRDSEQSGENGDDSERRSKKEKRDKKKKRDAEDDGEANGISNGHAHGEETVAEVVNGTEPSTTTTGHYQQTSALAAVPQAEITSFLNAHQITITDPLSDKPLRPIMQFSQLPSSALISKNPFACFKAPTPIQAASWPFGLSGRDIVGVAETGSGKTMGFGLPLVTAVLGMPKTKGPGRIRAVVVSPTRELAMQTNEQLSKLGELVGLNTVCVYGGASKDDQRALLRKGDIIVATPGRLKDFLEEGAVKPDNAKFVVLDEADRMLDKGFEDDIKQILSACPRKEGRQTLMYTATWPQSVQALASTFMVSPVNIQIGGNPSGDLQANARIEQRVEVVDPKVKEQRLLQLLKAQPRNERVLVFCLYKKEATRVENFLRQRGGLKVAGIHGDLKQEQRTRSLEAFKKGETPVLVATDVAARGLDIPEVKLVINCTFPLTIEDYVHRIGRTGRAGKTGLAITLFTEHDKSHSGELINILKAAGQPVPDELLKFGTTVKKKTHGTYGAFFKDVDMSQKGTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.28
4 0.34
5 0.44
6 0.55
7 0.64
8 0.72
9 0.79
10 0.87
11 0.9
12 0.95
13 0.97
14 0.97
15 0.97
16 0.96
17 0.95
18 0.94
19 0.9
20 0.85
21 0.77
22 0.68
23 0.59
24 0.5
25 0.39
26 0.3
27 0.23
28 0.17
29 0.14
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.16
41 0.18
42 0.23
43 0.34
44 0.44
45 0.55
46 0.64
47 0.75
48 0.79
49 0.88
50 0.93
51 0.94
52 0.96
53 0.97
54 0.98
55 0.97
56 0.97
57 0.96
58 0.95
59 0.95
60 0.94
61 0.93
62 0.93
63 0.91
64 0.91
65 0.91
66 0.87
67 0.84
68 0.84
69 0.79
70 0.77
71 0.74
72 0.69
73 0.63
74 0.57
75 0.49
76 0.39
77 0.33
78 0.27
79 0.24
80 0.27
81 0.26
82 0.29
83 0.37
84 0.45
85 0.55
86 0.64
87 0.72
88 0.73
89 0.82
90 0.9
91 0.93
92 0.96
93 0.94
94 0.93
95 0.93
96 0.9
97 0.87
98 0.84
99 0.75
100 0.64
101 0.55
102 0.45
103 0.34
104 0.25
105 0.17
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.16
131 0.2
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.21
138 0.17
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.14
159 0.14
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.19
167 0.25
168 0.26
169 0.27
170 0.31
171 0.28
172 0.36
173 0.37
174 0.33
175 0.32
176 0.31
177 0.3
178 0.26
179 0.24
180 0.19
181 0.19
182 0.2
183 0.17
184 0.2
185 0.22
186 0.23
187 0.23
188 0.22
189 0.24
190 0.24
191 0.23
192 0.28
193 0.25
194 0.26
195 0.29
196 0.27
197 0.26
198 0.26
199 0.26
200 0.19
201 0.2
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.09
239 0.11
240 0.19
241 0.21
242 0.29
243 0.33
244 0.38
245 0.39
246 0.38
247 0.37
248 0.34
249 0.33
250 0.26
251 0.22
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.16
289 0.16
290 0.19
291 0.17
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.12
297 0.13
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.08
320 0.08
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.05
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.09
342 0.15
343 0.19
344 0.19
345 0.25
346 0.26
347 0.29
348 0.36
349 0.39
350 0.37
351 0.39
352 0.4
353 0.37
354 0.39
355 0.36
356 0.31
357 0.28
358 0.25
359 0.18
360 0.16
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.11
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.09
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.11
398 0.12
399 0.14
400 0.15
401 0.19
402 0.19
403 0.22
404 0.28
405 0.27
406 0.28
407 0.27
408 0.33
409 0.37
410 0.38
411 0.35
412 0.37
413 0.41
414 0.47
415 0.5
416 0.45
417 0.43
418 0.45
419 0.49
420 0.43
421 0.41
422 0.35
423 0.34
424 0.34
425 0.31
426 0.28
427 0.27
428 0.27
429 0.28
430 0.27
431 0.29
432 0.32
433 0.33
434 0.36
435 0.39
436 0.42
437 0.46
438 0.47
439 0.45
440 0.41
441 0.37
442 0.35
443 0.31
444 0.3
445 0.23
446 0.22
447 0.2
448 0.19
449 0.2
450 0.18
451 0.17
452 0.14
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.24
457 0.28
458 0.29
459 0.33
460 0.35
461 0.36
462 0.39
463 0.46
464 0.45
465 0.48
466 0.49
467 0.45
468 0.47
469 0.42
470 0.41
471 0.32
472 0.28
473 0.22
474 0.21
475 0.2
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.13
480 0.1
481 0.08
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.13
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.15
497 0.14
498 0.15
499 0.16
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.2
504 0.2
505 0.22
506 0.24
507 0.22
508 0.19
509 0.2
510 0.24
511 0.31
512 0.34
513 0.34
514 0.37
515 0.38
516 0.37
517 0.39
518 0.33
519 0.26
520 0.21
521 0.18
522 0.14
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.15
527 0.14
528 0.15
529 0.18
530 0.19
531 0.19
532 0.22
533 0.21
534 0.22
535 0.27
536 0.29
537 0.26
538 0.25
539 0.21
540 0.19
541 0.19
542 0.19
543 0.15
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.17
548 0.16
549 0.17
550 0.16
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.19
555 0.25
556 0.3
557 0.35
558 0.41
559 0.46
560 0.5
561 0.54
562 0.6
563 0.59
564 0.59
565 0.6
566 0.63
567 0.58
568 0.55
569 0.51
570 0.42
571 0.38
572 0.33
573 0.31
574 0.25
575 0.25
576 0.27
577 0.31
578 0.32