Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4WQD9

Protein Details
Accession A0A4Q4WQD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-211DEERRKARIRRWMVRCRVHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-258ARRRGKRVGGGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, nucl 12, cyto 10.5, cyto_mito 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MHETTAMEPCCTCAQLLSTGPRYYASSEKPLPEDRRNNPRFRNYCPYCQISQTSSALPPGLKDPPSYASAIASKPALPARDHRSQRHQDQDPDPDQPPPPYTPSSTNTPSNFHDEKKKADGPAPSEPAQDVLHFLDQPHDTVASLSLRYGVPAAALRRANNIHSDHLIQGRRTVVIPGARVSLSPRPVGGEDEERRKARIRRWMVRCRVHEYDVAVLYLEQAGYDLEAAVERYLADEEWERAHPLEARRRGKRVGGGGAGRSSGRVTTGLLGSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.24
4 0.28
5 0.31
6 0.31
7 0.32
8 0.32
9 0.31
10 0.3
11 0.32
12 0.3
13 0.33
14 0.36
15 0.39
16 0.42
17 0.49
18 0.53
19 0.56
20 0.61
21 0.61
22 0.68
23 0.73
24 0.77
25 0.76
26 0.8
27 0.75
28 0.73
29 0.76
30 0.7
31 0.72
32 0.7
33 0.67
34 0.58
35 0.58
36 0.53
37 0.45
38 0.43
39 0.36
40 0.32
41 0.27
42 0.26
43 0.23
44 0.2
45 0.18
46 0.17
47 0.19
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.21
52 0.23
53 0.23
54 0.2
55 0.17
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.13
61 0.15
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.22
66 0.27
67 0.36
68 0.41
69 0.45
70 0.52
71 0.58
72 0.64
73 0.67
74 0.65
75 0.63
76 0.63
77 0.66
78 0.58
79 0.54
80 0.48
81 0.41
82 0.37
83 0.32
84 0.29
85 0.23
86 0.24
87 0.22
88 0.24
89 0.26
90 0.27
91 0.32
92 0.33
93 0.36
94 0.34
95 0.35
96 0.34
97 0.37
98 0.36
99 0.32
100 0.38
101 0.35
102 0.37
103 0.4
104 0.41
105 0.35
106 0.37
107 0.38
108 0.34
109 0.37
110 0.38
111 0.32
112 0.3
113 0.28
114 0.26
115 0.23
116 0.18
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.17
145 0.18
146 0.19
147 0.21
148 0.22
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.19
153 0.24
154 0.25
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.17
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.19
177 0.23
178 0.25
179 0.32
180 0.38
181 0.37
182 0.38
183 0.43
184 0.45
185 0.44
186 0.5
187 0.53
188 0.57
189 0.66
190 0.75
191 0.77
192 0.81
193 0.79
194 0.77
195 0.71
196 0.64
197 0.56
198 0.48
199 0.43
200 0.35
201 0.3
202 0.22
203 0.17
204 0.15
205 0.13
206 0.1
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.14
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.22
231 0.28
232 0.37
233 0.44
234 0.52
235 0.57
236 0.62
237 0.64
238 0.66
239 0.65
240 0.62
241 0.59
242 0.56
243 0.53
244 0.5
245 0.47
246 0.43
247 0.35
248 0.3
249 0.24
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.12
254 0.15
255 0.18