Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YS22

Protein Details
Accession A0A4Q4YS22    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-83ESWLQMRDRKKLEKKAKQEKLLTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-76KKLEKKAK
142-150KGNKKKKPH
173-251RRIKVDVERGRTVKGWKPRRLGGGLGGRGYTKAAAARPAGPGGFGGGFGGGRDGFRGGFQGRGRGGGFRGGDRGFRGGG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDKLPPNLLALFAPRPPLRWVPHPDLPPEQRKTANITGVGEYLPALAAYKDKDGYVPTESWLQMRDRKKLEKKAKQEKLLTEGPLKYKPNEDPNIRGDPFKTLIVARLSYEANEHDLEKEFGRFGPIERIRIITDTHAHEKGNKKKKPHRGYAFVVFEPALDGCDGIRIKDRRIKVDVERGRTVKGWKPRRLGGGLGGRGYTKAAAARPAGPGGFGGGFGGGRDGFRGGFQGRGRGGGFRGGDRGFRGGGGFGGGRDRDRGFGGSNGFGAPPNAPAGPGSGGRSGGYGGDRDRYGSGSGYDSRGGGRSYDDRSGGRDGGRFGDRDRRSGANFEPVRDRGSREYRDYDRSREDDSRKRGYEGGYEDPRKLRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.28
4 0.32
5 0.38
6 0.39
7 0.45
8 0.52
9 0.53
10 0.6
11 0.61
12 0.61
13 0.63
14 0.66
15 0.66
16 0.63
17 0.59
18 0.56
19 0.54
20 0.57
21 0.53
22 0.51
23 0.44
24 0.41
25 0.38
26 0.35
27 0.32
28 0.24
29 0.18
30 0.13
31 0.1
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.08
36 0.1
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.21
44 0.2
45 0.18
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.24
50 0.26
51 0.29
52 0.35
53 0.41
54 0.43
55 0.54
56 0.62
57 0.7
58 0.77
59 0.79
60 0.84
61 0.87
62 0.89
63 0.87
64 0.84
65 0.77
66 0.73
67 0.68
68 0.6
69 0.55
70 0.49
71 0.44
72 0.44
73 0.42
74 0.37
75 0.38
76 0.4
77 0.44
78 0.48
79 0.48
80 0.47
81 0.5
82 0.56
83 0.51
84 0.47
85 0.38
86 0.35
87 0.33
88 0.27
89 0.24
90 0.16
91 0.19
92 0.21
93 0.2
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.21
114 0.22
115 0.24
116 0.24
117 0.26
118 0.24
119 0.25
120 0.24
121 0.16
122 0.19
123 0.21
124 0.24
125 0.24
126 0.23
127 0.28
128 0.36
129 0.44
130 0.5
131 0.49
132 0.54
133 0.62
134 0.73
135 0.77
136 0.79
137 0.77
138 0.74
139 0.75
140 0.74
141 0.69
142 0.58
143 0.5
144 0.39
145 0.3
146 0.23
147 0.18
148 0.09
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.15
156 0.16
157 0.19
158 0.25
159 0.27
160 0.28
161 0.31
162 0.34
163 0.32
164 0.41
165 0.43
166 0.43
167 0.45
168 0.41
169 0.4
170 0.37
171 0.37
172 0.32
173 0.36
174 0.4
175 0.43
176 0.46
177 0.48
178 0.5
179 0.48
180 0.44
181 0.41
182 0.38
183 0.32
184 0.29
185 0.26
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.13
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.08
216 0.08
217 0.13
218 0.13
219 0.17
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.15
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.17
232 0.18
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.17
291 0.18
292 0.17
293 0.14
294 0.16
295 0.18
296 0.22
297 0.25
298 0.27
299 0.26
300 0.29
301 0.32
302 0.31
303 0.29
304 0.27
305 0.25
306 0.27
307 0.29
308 0.27
309 0.26
310 0.33
311 0.33
312 0.34
313 0.36
314 0.36
315 0.36
316 0.4
317 0.4
318 0.4
319 0.4
320 0.4
321 0.43
322 0.4
323 0.41
324 0.38
325 0.4
326 0.38
327 0.45
328 0.49
329 0.48
330 0.54
331 0.56
332 0.64
333 0.64
334 0.63
335 0.61
336 0.59
337 0.59
338 0.6
339 0.63
340 0.63
341 0.67
342 0.69
343 0.64
344 0.63
345 0.6
346 0.54
347 0.53
348 0.49
349 0.5
350 0.5
351 0.51
352 0.52
353 0.56