Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XRC8

Protein Details
Accession A0A4V1XRC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-33PVPGYRLGIHKRRLKRRGEERDAASPSBasic
192-212ETEQQQQQRRRRGSRRSGDDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-24HKRRLKRRG
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.5, cyto 7.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MGPFALPVPGYRLGIHKRRLKRRGEERDAASPSPAPDDPYSHLPSGVINPRSHPPDLLRQFAVAGLAPEEANPADNFPPFPHKALPPDHDDAGGGGKRRRGNASRSGAESSDVGTDADAKADGNGVPVTLKHHSARLRHLSTMTAILHRCLSEGDIPRAKRAFGLLVQTREVDIRLNHLWAVGSEILMRDGETEQQQQQRRRRGSRRSGDDTTAAVAEAAGDTTDHGEAHGQGEEDETPRRWGSAANVDKVRTYFENLIQQYPHDPHRPRLTSALDFWPVLFGIEIYNIDAEYRRALRRLAAAEDEEGGGDDDDDDDDDDEGGAGLEVGEDPGLDPYADDEDAEASGLLRRRGDDGTREWRWAARDELRRETAIAAQQIAARMDRLMENAPYSKHLELLRLRGMLALFVGDLCLPARLVESAGRGTAGGGRRTKTPSFSSLADDLASRAGGPEERSAVARRREELERAKGFFFRIAENGGALDGWARKLVEEEEEEEQEQDYDDAASPDEYGFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.5
3 0.54
4 0.62
5 0.72
6 0.79
7 0.82
8 0.83
9 0.86
10 0.88
11 0.89
12 0.87
13 0.82
14 0.82
15 0.77
16 0.67
17 0.58
18 0.49
19 0.41
20 0.37
21 0.32
22 0.27
23 0.24
24 0.27
25 0.29
26 0.34
27 0.37
28 0.33
29 0.32
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.36
34 0.34
35 0.3
36 0.33
37 0.39
38 0.44
39 0.43
40 0.39
41 0.35
42 0.41
43 0.45
44 0.47
45 0.41
46 0.37
47 0.36
48 0.33
49 0.29
50 0.19
51 0.14
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.15
65 0.23
66 0.24
67 0.27
68 0.29
69 0.31
70 0.36
71 0.42
72 0.44
73 0.43
74 0.45
75 0.43
76 0.38
77 0.35
78 0.29
79 0.27
80 0.25
81 0.22
82 0.21
83 0.25
84 0.28
85 0.32
86 0.39
87 0.39
88 0.44
89 0.5
90 0.56
91 0.54
92 0.54
93 0.53
94 0.46
95 0.41
96 0.34
97 0.25
98 0.18
99 0.15
100 0.11
101 0.08
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.15
119 0.22
120 0.27
121 0.3
122 0.39
123 0.44
124 0.45
125 0.44
126 0.44
127 0.39
128 0.35
129 0.36
130 0.28
131 0.23
132 0.2
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.17
137 0.13
138 0.13
139 0.16
140 0.2
141 0.25
142 0.3
143 0.3
144 0.35
145 0.35
146 0.33
147 0.27
148 0.25
149 0.21
150 0.17
151 0.25
152 0.25
153 0.26
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.23
158 0.21
159 0.15
160 0.11
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.11
168 0.14
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.1
180 0.13
181 0.17
182 0.23
183 0.3
184 0.37
185 0.44
186 0.52
187 0.58
188 0.65
189 0.7
190 0.74
191 0.78
192 0.8
193 0.81
194 0.79
195 0.74
196 0.67
197 0.59
198 0.49
199 0.39
200 0.29
201 0.2
202 0.12
203 0.08
204 0.06
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.02
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.1
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.2
232 0.23
233 0.25
234 0.27
235 0.27
236 0.28
237 0.27
238 0.26
239 0.17
240 0.16
241 0.14
242 0.15
243 0.22
244 0.23
245 0.24
246 0.22
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.23
253 0.27
254 0.36
255 0.38
256 0.37
257 0.39
258 0.39
259 0.33
260 0.35
261 0.33
262 0.26
263 0.23
264 0.22
265 0.17
266 0.13
267 0.11
268 0.08
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.2
287 0.19
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.15
293 0.11
294 0.09
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.03
316 0.02
317 0.02
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.04
333 0.07
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.21
342 0.26
343 0.33
344 0.35
345 0.36
346 0.34
347 0.34
348 0.34
349 0.32
350 0.31
351 0.31
352 0.38
353 0.41
354 0.47
355 0.47
356 0.45
357 0.43
358 0.38
359 0.33
360 0.29
361 0.25
362 0.19
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.18
367 0.15
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.14
376 0.16
377 0.17
378 0.18
379 0.21
380 0.19
381 0.22
382 0.21
383 0.26
384 0.27
385 0.32
386 0.33
387 0.3
388 0.3
389 0.28
390 0.27
391 0.2
392 0.16
393 0.11
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.11
412 0.11
413 0.15
414 0.18
415 0.22
416 0.25
417 0.26
418 0.3
419 0.36
420 0.38
421 0.39
422 0.39
423 0.37
424 0.38
425 0.38
426 0.39
427 0.34
428 0.33
429 0.28
430 0.23
431 0.19
432 0.16
433 0.14
434 0.09
435 0.08
436 0.09
437 0.1
438 0.12
439 0.14
440 0.16
441 0.17
442 0.2
443 0.24
444 0.3
445 0.36
446 0.38
447 0.38
448 0.41
449 0.44
450 0.5
451 0.55
452 0.57
453 0.55
454 0.55
455 0.54
456 0.51
457 0.48
458 0.43
459 0.36
460 0.29
461 0.25
462 0.24
463 0.23
464 0.21
465 0.2
466 0.15
467 0.14
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.15
476 0.16
477 0.18
478 0.19
479 0.22
480 0.24
481 0.27
482 0.28
483 0.26
484 0.25
485 0.2
486 0.18
487 0.15
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.11