Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YRC0

Protein Details
Accession A0A4Q4YRC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-454LRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHVVDGTBasic
587-607AEGKVEARGKTRPRKRKAAEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-448KANRRGTYHRKRRRWAKIR
586-607PAEGKVEARGKTRPRKRKAAEP
Subcellular Location(s) cyto 10, cysk 7, nucl 6, cyto_mito 6, cyto_pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDPRILFGCDIFNEKEELKPSNLIIQRPYHLTYELEDRRETENFNRLRVVPASELYSDILSSGTSSTSPGTTTPAPEDDDGGTATPMGVEYSLVDPDSGVVVAKTDRAQLDVSARQTLSMEEIEQLKRDATDAGKDLIAKLMLSHTAIDQKTQYSLAKYKLLKTRKYIRRFCVLPLDVPMLGNWLLEEKDPAKILEMREEMIALLGCWANVHFGGKDRCENSEPEADSENKVADGENKPESEPTAGRWLAVDDTGGLLVAAMAERMGVLYPAEADDSAATKQQPTSPQMKRGELVGQVESNINITTEDAQQATEQDTSKHTKTDEGEQAVVKATQPPRKRHSGDKHRHDDMHVPYARSNTLTLIHANSQPNLSYLRYFDFDHTNPNQGLDHPLARHLMMLSWLQLLEPEFDSAYSATPPQATPEELRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHVVDGTRGGGFSGLVVASAMDPISVLRHTVPLLTGGAPVAVYSQAIEPLTALADCYSVSRRAAWVANPPAEAAGRSAEELERWPGTDEFPLNPSLLLGASIQTSRVRRWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYVFTAWRVKPAEGKVEARGKTRPRKRKAAEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.26
4 0.29
5 0.27
6 0.28
7 0.28
8 0.34
9 0.37
10 0.36
11 0.38
12 0.39
13 0.4
14 0.41
15 0.43
16 0.36
17 0.34
18 0.32
19 0.29
20 0.35
21 0.37
22 0.35
23 0.34
24 0.34
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.35
29 0.38
30 0.37
31 0.39
32 0.41
33 0.37
34 0.4
35 0.38
36 0.36
37 0.3
38 0.29
39 0.3
40 0.26
41 0.26
42 0.23
43 0.21
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.14
58 0.15
59 0.18
60 0.2
61 0.21
62 0.24
63 0.23
64 0.25
65 0.21
66 0.2
67 0.18
68 0.15
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.22
98 0.24
99 0.25
100 0.26
101 0.25
102 0.24
103 0.23
104 0.22
105 0.19
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.12
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.18
139 0.2
140 0.2
141 0.18
142 0.23
143 0.25
144 0.31
145 0.32
146 0.38
147 0.44
148 0.5
149 0.51
150 0.54
151 0.62
152 0.64
153 0.73
154 0.74
155 0.71
156 0.72
157 0.68
158 0.63
159 0.63
160 0.54
161 0.45
162 0.4
163 0.37
164 0.29
165 0.27
166 0.23
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.1
175 0.09
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.16
181 0.17
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.11
201 0.15
202 0.17
203 0.22
204 0.22
205 0.25
206 0.26
207 0.27
208 0.26
209 0.29
210 0.28
211 0.25
212 0.26
213 0.24
214 0.23
215 0.23
216 0.19
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.2
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.11
270 0.15
271 0.18
272 0.26
273 0.28
274 0.36
275 0.39
276 0.4
277 0.37
278 0.35
279 0.33
280 0.26
281 0.25
282 0.18
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.08
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.12
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.16
308 0.18
309 0.2
310 0.26
311 0.28
312 0.26
313 0.27
314 0.25
315 0.25
316 0.22
317 0.21
318 0.14
319 0.14
320 0.17
321 0.23
322 0.3
323 0.36
324 0.4
325 0.49
326 0.52
327 0.56
328 0.63
329 0.67
330 0.71
331 0.74
332 0.76
333 0.72
334 0.7
335 0.61
336 0.57
337 0.49
338 0.48
339 0.4
340 0.34
341 0.31
342 0.32
343 0.31
344 0.24
345 0.21
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.18
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.16
366 0.2
367 0.19
368 0.25
369 0.26
370 0.28
371 0.26
372 0.26
373 0.24
374 0.19
375 0.22
376 0.17
377 0.18
378 0.14
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.15
410 0.18
411 0.24
412 0.24
413 0.27
414 0.29
415 0.32
416 0.37
417 0.44
418 0.46
419 0.44
420 0.49
421 0.58
422 0.65
423 0.71
424 0.75
425 0.78
426 0.81
427 0.86
428 0.9
429 0.91
430 0.91
431 0.9
432 0.9
433 0.9
434 0.85
435 0.82
436 0.76
437 0.65
438 0.59
439 0.53
440 0.43
441 0.33
442 0.28
443 0.21
444 0.17
445 0.15
446 0.11
447 0.07
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.03
456 0.04
457 0.04
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.12
468 0.11
469 0.11
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.08
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.14
495 0.15
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.28
500 0.33
501 0.35
502 0.34
503 0.33
504 0.3
505 0.28
506 0.26
507 0.18
508 0.13
509 0.11
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.12
514 0.14
515 0.17
516 0.15
517 0.16
518 0.18
519 0.18
520 0.19
521 0.23
522 0.23
523 0.2
524 0.22
525 0.22
526 0.2
527 0.19
528 0.17
529 0.13
530 0.11
531 0.1
532 0.08
533 0.07
534 0.09
535 0.09
536 0.11
537 0.15
538 0.18
539 0.2
540 0.28
541 0.33
542 0.36
543 0.4
544 0.49
545 0.54
546 0.59
547 0.63
548 0.61
549 0.63
550 0.6
551 0.56
552 0.48
553 0.43
554 0.39
555 0.35
556 0.33
557 0.25
558 0.28
559 0.27
560 0.25
561 0.2
562 0.18
563 0.17
564 0.16
565 0.15
566 0.12
567 0.19
568 0.19
569 0.24
570 0.26
571 0.25
572 0.3
573 0.35
574 0.43
575 0.42
576 0.45
577 0.47
578 0.53
579 0.54
580 0.51
581 0.55
582 0.57
583 0.62
584 0.7
585 0.72
586 0.73
587 0.81