Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XJT8

Protein Details
Accession A0A4P6XJT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-296RPKPEIKMKKIKTKKIRNSAKKRTHDDEBasic
589-615LHRYHGLAPKHKKERVTRKTTEEKVIHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-291PKPEIKMKKIKTKKIRNSAKKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.999, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAELIELSIEETNKLRAQLGLPLIPTLETSEKPENTQKRNLAENQGLDGFQGLNLPQIGDVSANHNPHSASSRHAFDDAENVAPVGENTRKKSEIGLNVDKKPKKILFTYDDVDTDSWLENLGGSRELQVPPVQKDGDMYDIDPENEAHTMVKHSTTRLAQIADGEVFTLADSGVLDEKDDELENEALKRETKLARDQKERQKEGFLKFGKPKDTDQNDDESEADEPELVALEGGSILLTQEKSKTTKDSSIPAGQTAVFEDLFDVADRPKPEIKMKKIKTKKIRNSAKKRTHDDEITDLGGPMYTTKLDAEEEAEDEFEEALNRARTKKIKTRKTLTAEEIAEEVRLHTRVDMATQIDSGLVYDDTKDFLDSIGVISERHLTEDGKETEGFTPNKSKDTRTVLEETSVHPSDSKNISNQQKLGILEKNKGDMDVNVPETKVLQKDHVSDHSQEPNLSSLSSTLKYLRSQSGTVDSGSKRSKSERERQKEAELAKIQINIEERIVREEMAQDGAFSRMKKEEQEKIVDRRLNERLVEKGIVAETRKSGRYARYNGPADPLQDYNPQVNVQYTDSRGNQLDTKQAWKELLHRYHGLAPKHKKERVTRKTTEEKVIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.2
5 0.25
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.22
12 0.21
13 0.19
14 0.18
15 0.16
16 0.22
17 0.3
18 0.31
19 0.35
20 0.44
21 0.49
22 0.52
23 0.6
24 0.6
25 0.57
26 0.64
27 0.65
28 0.63
29 0.6
30 0.55
31 0.5
32 0.45
33 0.4
34 0.32
35 0.27
36 0.19
37 0.13
38 0.13
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.13
49 0.19
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.27
56 0.22
57 0.22
58 0.25
59 0.28
60 0.29
61 0.3
62 0.28
63 0.24
64 0.29
65 0.26
66 0.22
67 0.19
68 0.17
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.18
74 0.21
75 0.26
76 0.32
77 0.33
78 0.34
79 0.4
80 0.43
81 0.44
82 0.48
83 0.54
84 0.55
85 0.61
86 0.7
87 0.67
88 0.61
89 0.61
90 0.56
91 0.5
92 0.49
93 0.5
94 0.47
95 0.5
96 0.51
97 0.44
98 0.41
99 0.38
100 0.33
101 0.25
102 0.2
103 0.15
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.28
120 0.26
121 0.23
122 0.24
123 0.24
124 0.23
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.2
143 0.21
144 0.24
145 0.24
146 0.24
147 0.21
148 0.2
149 0.21
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.18
179 0.21
180 0.31
181 0.39
182 0.46
183 0.54
184 0.63
185 0.67
186 0.75
187 0.75
188 0.67
189 0.67
190 0.65
191 0.6
192 0.6
193 0.53
194 0.49
195 0.51
196 0.54
197 0.51
198 0.46
199 0.47
200 0.48
201 0.5
202 0.48
203 0.44
204 0.45
205 0.4
206 0.38
207 0.34
208 0.25
209 0.2
210 0.15
211 0.13
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.07
229 0.09
230 0.12
231 0.14
232 0.18
233 0.2
234 0.26
235 0.28
236 0.3
237 0.32
238 0.35
239 0.34
240 0.3
241 0.28
242 0.22
243 0.2
244 0.17
245 0.13
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.08
255 0.09
256 0.12
257 0.14
258 0.16
259 0.24
260 0.32
261 0.4
262 0.48
263 0.53
264 0.61
265 0.67
266 0.74
267 0.77
268 0.8
269 0.81
270 0.81
271 0.86
272 0.86
273 0.89
274 0.9
275 0.9
276 0.87
277 0.84
278 0.78
279 0.72
280 0.63
281 0.55
282 0.47
283 0.39
284 0.31
285 0.25
286 0.2
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.15
314 0.2
315 0.26
316 0.35
317 0.43
318 0.51
319 0.58
320 0.64
321 0.69
322 0.71
323 0.7
324 0.64
325 0.6
326 0.5
327 0.42
328 0.36
329 0.27
330 0.21
331 0.15
332 0.12
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.19
372 0.19
373 0.18
374 0.19
375 0.19
376 0.2
377 0.26
378 0.25
379 0.2
380 0.26
381 0.25
382 0.31
383 0.31
384 0.31
385 0.32
386 0.39
387 0.39
388 0.37
389 0.39
390 0.34
391 0.36
392 0.34
393 0.29
394 0.28
395 0.26
396 0.22
397 0.18
398 0.18
399 0.21
400 0.24
401 0.24
402 0.21
403 0.28
404 0.35
405 0.38
406 0.39
407 0.35
408 0.35
409 0.34
410 0.35
411 0.33
412 0.29
413 0.29
414 0.3
415 0.31
416 0.27
417 0.27
418 0.23
419 0.18
420 0.2
421 0.2
422 0.22
423 0.19
424 0.19
425 0.18
426 0.18
427 0.2
428 0.19
429 0.16
430 0.17
431 0.19
432 0.23
433 0.27
434 0.31
435 0.32
436 0.32
437 0.36
438 0.38
439 0.36
440 0.33
441 0.3
442 0.27
443 0.24
444 0.21
445 0.16
446 0.11
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.18
452 0.2
453 0.23
454 0.27
455 0.27
456 0.27
457 0.27
458 0.3
459 0.29
460 0.28
461 0.29
462 0.25
463 0.29
464 0.32
465 0.31
466 0.28
467 0.33
468 0.41
469 0.44
470 0.54
471 0.58
472 0.63
473 0.7
474 0.72
475 0.72
476 0.69
477 0.62
478 0.61
479 0.53
480 0.46
481 0.4
482 0.39
483 0.33
484 0.3
485 0.31
486 0.23
487 0.22
488 0.22
489 0.2
490 0.21
491 0.21
492 0.18
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.17
497 0.16
498 0.12
499 0.12
500 0.15
501 0.17
502 0.16
503 0.17
504 0.18
505 0.21
506 0.27
507 0.33
508 0.39
509 0.42
510 0.51
511 0.55
512 0.59
513 0.66
514 0.62
515 0.57
516 0.55
517 0.55
518 0.5
519 0.46
520 0.41
521 0.37
522 0.38
523 0.37
524 0.29
525 0.26
526 0.23
527 0.24
528 0.23
529 0.22
530 0.22
531 0.26
532 0.27
533 0.28
534 0.31
535 0.36
536 0.44
537 0.48
538 0.52
539 0.57
540 0.59
541 0.57
542 0.58
543 0.52
544 0.45
545 0.42
546 0.35
547 0.29
548 0.31
549 0.32
550 0.29
551 0.29
552 0.27
553 0.25
554 0.26
555 0.25
556 0.23
557 0.25
558 0.25
559 0.3
560 0.3
561 0.34
562 0.33
563 0.33
564 0.34
565 0.32
566 0.37
567 0.34
568 0.39
569 0.38
570 0.39
571 0.39
572 0.36
573 0.42
574 0.44
575 0.48
576 0.47
577 0.46
578 0.47
579 0.53
580 0.57
581 0.57
582 0.57
583 0.6
584 0.64
585 0.72
586 0.73
587 0.73
588 0.78
589 0.82
590 0.82
591 0.82
592 0.79
593 0.79
594 0.85
595 0.83