Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XK39

Protein Details
Accession A0A4P6XK39    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37KPGLKFKPKAVARKSEKDRAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-67KKTAAKPGLKFKPKAVARKSEKDRAKEAPEVKSEDRFRNPNATRGRGLGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSQRLELLNPKKTAAKPGLKFKPKAVARKSEKDRAKEAPEVKSEDRFRNPNATRGRGLGRGRGRGRGGAYVGTHVVSAGPLAMGSVGVGGGMTSLKTGLTSDRIYGAGDSASVAPLANLKLKLRDGVKKLEEDSDSDGDDPTKINMNKEYAFDETETVLFPVRPQKAVATVLEPQLVLDTSTLPLLSATPGLRDESVMSVNSVKTEDFNGVKPEFEPSFTPPVLVNPDEKQESDEHDRILDDQRLIVDLITLGLDSMKTDDDTADDDKYVLLHVPQITPKPTETENDEIVEPSATKHEKIDVSKLHYASSNAQNFEGQVGSLNFHQLGKITMSFGDSVFQCAGGNPLSFLQELYIIEDSSVEAKPEEEDASVLDADGNKILGRIYRLGDISGKIVATPAIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.56
3 0.55
4 0.64
5 0.73
6 0.75
7 0.75
8 0.7
9 0.71
10 0.68
11 0.71
12 0.69
13 0.69
14 0.69
15 0.77
16 0.8
17 0.8
18 0.8
19 0.76
20 0.75
21 0.72
22 0.69
23 0.67
24 0.65
25 0.63
26 0.6
27 0.61
28 0.57
29 0.58
30 0.58
31 0.57
32 0.58
33 0.56
34 0.54
35 0.58
36 0.57
37 0.57
38 0.59
39 0.57
40 0.51
41 0.5
42 0.51
43 0.48
44 0.48
45 0.49
46 0.47
47 0.51
48 0.51
49 0.54
50 0.52
51 0.48
52 0.47
53 0.42
54 0.37
55 0.31
56 0.29
57 0.25
58 0.23
59 0.19
60 0.17
61 0.13
62 0.11
63 0.08
64 0.07
65 0.05
66 0.04
67 0.03
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.02
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.07
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.07
103 0.08
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.16
108 0.17
109 0.21
110 0.24
111 0.3
112 0.31
113 0.37
114 0.39
115 0.38
116 0.39
117 0.39
118 0.35
119 0.3
120 0.31
121 0.24
122 0.22
123 0.2
124 0.18
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.09
129 0.15
130 0.15
131 0.17
132 0.19
133 0.22
134 0.23
135 0.24
136 0.25
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.08
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.19
154 0.21
155 0.21
156 0.16
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.16
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.14
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.15
219 0.19
220 0.24
221 0.24
222 0.21
223 0.21
224 0.21
225 0.21
226 0.23
227 0.21
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.08
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.07
258 0.06
259 0.08
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.17
264 0.19
265 0.21
266 0.21
267 0.21
268 0.21
269 0.22
270 0.24
271 0.26
272 0.25
273 0.25
274 0.25
275 0.22
276 0.21
277 0.19
278 0.14
279 0.1
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.15
284 0.19
285 0.24
286 0.26
287 0.33
288 0.32
289 0.38
290 0.43
291 0.42
292 0.38
293 0.36
294 0.35
295 0.34
296 0.38
297 0.36
298 0.31
299 0.32
300 0.31
301 0.29
302 0.28
303 0.22
304 0.13
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.1
314 0.11
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.15
323 0.12
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.15
370 0.17
371 0.19
372 0.23
373 0.24
374 0.25
375 0.28
376 0.26
377 0.24
378 0.23
379 0.2
380 0.16
381 0.15