Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XJC4

Protein Details
Accession A0A4P6XJC4    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-93VTGSPKSPTQKHARHKEKRSDTSHRQHENSHydrophilic
221-241VSSIRPKPRGKRNITPRRPIIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-52K
68-81PKSPTQKHARHKEK
225-240RPKPRGKRNITPRRPI
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 8.5, mito 7, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09402  MSC  
Amino Acid Sequences MGHVSLSVSQSRKRKSMLDEINLKITTTPSKGNIFEVETDSEPEVLSSLRKKPRHDPEPLEKGVTGSPKSPTQKHARHKEKRSDTSHRQHENSGHAIAVAADPLPPITPERDLEKPLSPIQKQALPRTRIEPPVLQPVGAEPPSTDTSTVLSELTGEPSLWFKTQELFNPENAALLPAETSDAADGFDTALKKLKRENRSEDLLSSAQKKAELAKLLDIDVSSIRPKPRGKRNITPRRPIIVSRGSERVRDGETQKKSGPFEKKQQSTLDAEELSSDEEDSADSTVNLSRKNEHAENVPESIPPKLSRAARPSLFLAVVFFGLWLSLVGALLFGYWYREQTFLVGYCGTQINRRTVPDAPETPRFLVTLGDYLDANFKPACVECPQHARCFPRLEIACYDDFVVSAPWYYPYVPNFNLQAQKCVPDTKKAEKIEIMIDVALDLLRARNANENCGRADKDDVSAGLRVQELHDLLLALKAPYITVEEFEELWERSVVELEKEPELIVRQVTPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.53
3 0.61
4 0.64
5 0.65
6 0.67
7 0.65
8 0.68
9 0.61
10 0.54
11 0.44
12 0.37
13 0.33
14 0.28
15 0.29
16 0.27
17 0.32
18 0.33
19 0.35
20 0.35
21 0.33
22 0.32
23 0.31
24 0.3
25 0.26
26 0.27
27 0.25
28 0.22
29 0.19
30 0.16
31 0.13
32 0.11
33 0.14
34 0.17
35 0.25
36 0.34
37 0.4
38 0.45
39 0.55
40 0.66
41 0.7
42 0.74
43 0.74
44 0.75
45 0.8
46 0.76
47 0.69
48 0.58
49 0.51
50 0.45
51 0.42
52 0.33
53 0.26
54 0.27
55 0.32
56 0.39
57 0.41
58 0.45
59 0.5
60 0.58
61 0.65
62 0.73
63 0.77
64 0.81
65 0.87
66 0.9
67 0.9
68 0.9
69 0.88
70 0.87
71 0.87
72 0.87
73 0.87
74 0.84
75 0.76
76 0.71
77 0.67
78 0.63
79 0.56
80 0.46
81 0.36
82 0.28
83 0.25
84 0.2
85 0.15
86 0.1
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.1
95 0.12
96 0.14
97 0.19
98 0.22
99 0.25
100 0.28
101 0.29
102 0.3
103 0.34
104 0.39
105 0.35
106 0.36
107 0.37
108 0.4
109 0.41
110 0.47
111 0.51
112 0.47
113 0.49
114 0.49
115 0.51
116 0.49
117 0.49
118 0.43
119 0.37
120 0.44
121 0.41
122 0.36
123 0.31
124 0.28
125 0.3
126 0.25
127 0.22
128 0.12
129 0.16
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.11
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.14
151 0.16
152 0.2
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.28
157 0.27
158 0.24
159 0.22
160 0.18
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.05
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.22
181 0.31
182 0.37
183 0.44
184 0.51
185 0.51
186 0.56
187 0.56
188 0.5
189 0.45
190 0.39
191 0.33
192 0.28
193 0.24
194 0.19
195 0.18
196 0.17
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.17
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.16
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.11
211 0.12
212 0.17
213 0.23
214 0.3
215 0.4
216 0.5
217 0.56
218 0.62
219 0.73
220 0.79
221 0.81
222 0.81
223 0.75
224 0.69
225 0.63
226 0.55
227 0.5
228 0.45
229 0.39
230 0.34
231 0.37
232 0.33
233 0.32
234 0.32
235 0.27
236 0.22
237 0.24
238 0.25
239 0.26
240 0.28
241 0.3
242 0.31
243 0.32
244 0.32
245 0.36
246 0.4
247 0.37
248 0.44
249 0.5
250 0.51
251 0.51
252 0.51
253 0.47
254 0.41
255 0.38
256 0.31
257 0.22
258 0.19
259 0.15
260 0.14
261 0.11
262 0.09
263 0.07
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.15
278 0.2
279 0.21
280 0.2
281 0.23
282 0.25
283 0.27
284 0.27
285 0.25
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.17
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.2
294 0.25
295 0.29
296 0.35
297 0.34
298 0.35
299 0.35
300 0.31
301 0.28
302 0.22
303 0.17
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.06
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.13
329 0.11
330 0.13
331 0.12
332 0.1
333 0.11
334 0.14
335 0.13
336 0.16
337 0.18
338 0.23
339 0.25
340 0.26
341 0.28
342 0.29
343 0.32
344 0.34
345 0.37
346 0.35
347 0.38
348 0.4
349 0.39
350 0.36
351 0.32
352 0.26
353 0.21
354 0.17
355 0.15
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.15
361 0.13
362 0.14
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.14
369 0.17
370 0.19
371 0.3
372 0.33
373 0.36
374 0.41
375 0.42
376 0.44
377 0.46
378 0.43
379 0.43
380 0.42
381 0.4
382 0.39
383 0.38
384 0.34
385 0.29
386 0.29
387 0.2
388 0.17
389 0.14
390 0.12
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.11
397 0.15
398 0.17
399 0.23
400 0.23
401 0.26
402 0.27
403 0.31
404 0.38
405 0.35
406 0.38
407 0.33
408 0.36
409 0.34
410 0.4
411 0.37
412 0.38
413 0.44
414 0.47
415 0.54
416 0.53
417 0.55
418 0.49
419 0.5
420 0.43
421 0.38
422 0.3
423 0.21
424 0.19
425 0.15
426 0.12
427 0.1
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.18
435 0.2
436 0.28
437 0.33
438 0.35
439 0.35
440 0.39
441 0.4
442 0.33
443 0.37
444 0.3
445 0.28
446 0.27
447 0.26
448 0.23
449 0.23
450 0.21
451 0.18
452 0.17
453 0.15
454 0.14
455 0.17
456 0.15
457 0.14
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.13
469 0.11
470 0.12
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.17
475 0.2
476 0.17
477 0.18
478 0.17
479 0.15
480 0.13
481 0.17
482 0.17
483 0.17
484 0.21
485 0.22
486 0.23
487 0.23
488 0.23
489 0.21
490 0.23
491 0.22
492 0.19