FuNGI

A0A4V1ADV2

Protein Details

Accession

A0A4V1ADV2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MDKRGSRRQRFGVGKRLRPM	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto 5.5, cyto_nucl 4.5, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MDKRGSRRQRFGVGKRLRPMAQRILSPVIGREVPTEETPTDARLGILHFKDSPNSLDSELSSPLETERDVPLPDANTSSSEQHIQLTRLRMAGLEGSADDDGKRLKGERVHTRTEKALFLNLEVAGRKTVSALLDTGATADFIDSRLVAELNVTKYALANEGCIRLASEGLTVPVESEVTLDITCNGVRTRRGFFVYPQLTESIVLGTPFAIDFAKELNLSTQEFNGLPLDVKRPQTLAGFQASPIVCINAARLERHCKSRDNMVFTLLVKVIEYQPGVQPNATVFPHFDLEEFADVVTDHLPEGLPPKGSIQHSIEIIPGSEAPHRSPYRLSLQDKKELTMQIDGLLQDGKIEPCGSPFGAPVIFVKKKDGSKRLCVDYRALNNITVRERFPLPLIDDIFDALAGAKVFSSLDLHSGYHQVRIADEDVYKTAFVTPFGQYAWRVMPFGLTNAPSTFQHLMNKIFHPLLHKFVVVYLDDILVYSKTPREHAEHLKIVLQTLRENKLIAKAKKCFFFQTELKFLGHVLRPDGIFPDPDKIRTIKEWTEIKSIKQAQSFLGLCGYYRRFIHHYSKYTACIHDYIAGKVPWTETQQSMFDSLREKLMNPPILILPQPTSTFVLYTDASNYYMGAVLNQVDEDNKLQGVVAFESRKFKGAELNYDVREKEFLAIIHALKKWRHYLLDKPFVLYTDHHSLQFVLTQKTPSGRIARWLDVLAEYNFEIRYIQGPRNVVADCLSRKDIEAPPGKVEDSEHARTVAQLNRMLWSTTEMVAEPAQLIQLQQEYKRDPHFAQFYHLLQNKDEVVPPKLQVQLDRYTLVDDLLYYAITSADELRLCVPQGLSRHTLLHNVHDSNVGGHRGVHKTYERLMRQFYWFRMFKTVKKYVAQCEVCQQNKTSSRLPVGLLKPLPVPARPWQHITMDFVSAFGKAGKFDSILVVVDRLTKMGHLIPTTVNLTSKECAHLLLKHVFSLHGFPQTIVSDQDRLFKKNMWGAFMKIWGIETRFAVKSHPQTDGQSERTIRTISDIMRTMLNKPGQTFRWDELLPMVEFAYNDSEHNATKVSPFYANYGFHPRFFDSLPPTSFDDTNERVSAYVFALDQQLILHQVRDRMAESQNDMAFHANRRRRDLTFSVGDQVLVHRELTLLAEEPGRKFTKLWIGPVKVTRVINENAYEVALPMYLLASRQVKAFNVNSLKEFVPLSSEFEALPPLTCVDMLERATDLIAISEVTTDSLVTHWANSRLPVTLSITDYEAFPLAKRLALENAYNATVSADASFHSNSGGFAVSSRAAPSRHTRRSASRLRGLNDHPPRVRGRTQI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.78
3	0.78
4	0.72
5	0.68
6	0.68
7	0.67
8	0.62
9	0.57
10	0.55
11	0.54
12	0.51
13	0.45
14	0.39
15	0.34
16	0.3
17	0.27
18	0.24
19	0.22
20	0.24
21	0.25
22	0.27
23	0.22
24	0.25
25	0.25
26	0.24
27	0.23
28	0.19
29	0.18
30	0.15
31	0.18
32	0.22
33	0.23
34	0.24
35	0.25
36	0.26
37	0.29
38	0.3
39	0.3
40	0.24
41	0.25
42	0.24
43	0.23
44	0.23
45	0.23
46	0.23
47	0.21
48	0.19
49	0.17
50	0.17
51	0.17
52	0.15
53	0.15
54	0.16
55	0.18
56	0.18
57	0.19
58	0.22
59	0.22
60	0.23
61	0.23
62	0.2
63	0.2
64	0.22
65	0.23
66	0.22
67	0.23
68	0.22
69	0.25
70	0.28
71	0.27
72	0.3
73	0.33
74	0.33
75	0.31
76	0.3
77	0.25
78	0.23
79	0.23
80	0.18
81	0.14
82	0.11
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.11
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.14
92	0.19
93	0.25
94	0.34
95	0.43
96	0.48
97	0.57
98	0.6
99	0.62
100	0.63
101	0.6
102	0.56
103	0.46
104	0.46
105	0.37
106	0.33
107	0.32
108	0.26
109	0.25
110	0.22
111	0.21
112	0.17
113	0.16
114	0.15
115	0.13
116	0.15
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.09
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.06
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.1
137	0.14
138	0.16
139	0.17
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.17
144	0.19
145	0.14
146	0.15
147	0.16
148	0.18
149	0.18
150	0.17
151	0.17
152	0.14
153	0.14
154	0.11
155	0.1
156	0.09
157	0.1
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.09
171	0.09
172	0.11
173	0.12
174	0.14
175	0.19
176	0.23
177	0.27
178	0.3
179	0.34
180	0.35
181	0.36
182	0.43
183	0.43
184	0.4
185	0.37
186	0.34
187	0.3
188	0.28
189	0.25
190	0.16
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.08
198	0.06
199	0.05
200	0.06
201	0.07
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.11
206	0.14
207	0.16
208	0.16
209	0.15
210	0.16
211	0.15
212	0.16
213	0.15
214	0.13
215	0.12
216	0.13
217	0.18
218	0.2
219	0.23
220	0.23
221	0.23
222	0.25
223	0.26
224	0.27
225	0.25
226	0.25
227	0.23
228	0.21
229	0.27
230	0.25
231	0.23
232	0.2
233	0.18
234	0.14
235	0.13
236	0.14
237	0.14
238	0.15
239	0.17
240	0.2
241	0.28
242	0.32
243	0.4
244	0.43
245	0.43
246	0.44
247	0.53
248	0.56
249	0.54
250	0.51
251	0.46
252	0.44
253	0.39
254	0.4
255	0.29
256	0.22
257	0.15
258	0.16
259	0.14
260	0.15
261	0.14
262	0.13
263	0.15
264	0.2
265	0.2
266	0.19
267	0.18
268	0.17
269	0.21
270	0.2
271	0.17
272	0.14
273	0.15
274	0.17
275	0.16
276	0.15
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.11
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.08
286	0.07
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.13
296	0.19
297	0.2
298	0.25
299	0.25
300	0.26
301	0.26
302	0.26
303	0.25
304	0.2
305	0.19
306	0.14
307	0.11
308	0.1
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.23
313	0.24
314	0.25
315	0.26
316	0.29
317	0.34
318	0.42
319	0.46
320	0.46
321	0.5
322	0.57
323	0.56
324	0.53
325	0.49
326	0.42
327	0.38
328	0.31
329	0.27
330	0.2
331	0.2
332	0.19
333	0.15
334	0.13
335	0.11
336	0.09
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.12
351	0.18
352	0.2
353	0.2
354	0.24
355	0.28
356	0.34
357	0.42
358	0.49
359	0.47
360	0.54
361	0.6
362	0.63
363	0.62
364	0.57
365	0.53
366	0.51
367	0.49
368	0.46
369	0.41
370	0.36
371	0.33
372	0.34
373	0.34
374	0.29
375	0.25
376	0.23
377	0.23
378	0.21
379	0.21
380	0.21
381	0.19
382	0.22
383	0.22
384	0.2
385	0.19
386	0.18
387	0.16
388	0.12
389	0.1
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.07
399	0.06
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.15
405	0.15
406	0.16
407	0.17
408	0.15
409	0.14
410	0.17
411	0.17
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.12
416	0.13
417	0.12
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.14
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.13
431	0.13
432	0.12
433	0.13
434	0.12
435	0.13
436	0.14
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.14
441	0.12
442	0.17
443	0.18
444	0.17
445	0.2
446	0.22
447	0.25
448	0.26
449	0.27
450	0.25
451	0.24
452	0.23
453	0.24
454	0.23
455	0.24
456	0.22
457	0.21
458	0.18
459	0.19
460	0.2
461	0.15
462	0.14
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.08
472	0.09
473	0.11
474	0.14
475	0.18
476	0.24
477	0.32
478	0.38
479	0.38
480	0.38
481	0.4
482	0.37
483	0.33
484	0.28
485	0.21
486	0.18
487	0.2
488	0.23
489	0.2
490	0.2
491	0.2
492	0.27
493	0.35
494	0.36
495	0.38
496	0.42
497	0.45
498	0.49
499	0.5
500	0.45
501	0.38
502	0.4
503	0.38
504	0.38
505	0.38
506	0.36
507	0.34
508	0.31
509	0.29
510	0.26
511	0.23
512	0.18
513	0.15
514	0.15
515	0.14
516	0.15
517	0.16
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.16
522	0.15
523	0.16
524	0.18
525	0.18
526	0.19
527	0.21
528	0.25
529	0.21
530	0.27
531	0.31
532	0.31
533	0.39
534	0.38
535	0.36
536	0.39
537	0.42
538	0.38
539	0.36
540	0.34
541	0.26
542	0.31
543	0.3
544	0.22
545	0.19
546	0.15
547	0.13
548	0.16
549	0.17
550	0.13
551	0.13
552	0.16
553	0.18
554	0.23
555	0.32
556	0.35
557	0.38
558	0.4
559	0.42
560	0.43
561	0.42
562	0.38
563	0.31
564	0.24
565	0.2
566	0.21
567	0.2
568	0.18
569	0.19
570	0.18
571	0.16
572	0.16
573	0.16
574	0.13
575	0.15
576	0.16
577	0.13
578	0.15
579	0.16
580	0.16
581	0.18
582	0.16
583	0.14
584	0.14
585	0.14
586	0.15
587	0.14
588	0.14
589	0.16
590	0.22
591	0.24
592	0.22
593	0.22
594	0.2
595	0.2
596	0.2
597	0.16
598	0.11
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.12
603	0.11
604	0.11
605	0.1
606	0.11
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.04
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.09
634	0.09
635	0.1
636	0.14
637	0.15
638	0.16
639	0.16
640	0.15
641	0.19
642	0.2
643	0.24
644	0.26
645	0.29
646	0.28
647	0.29
648	0.29
649	0.22
650	0.21
651	0.16
652	0.12
653	0.1
654	0.08
655	0.09
656	0.11
657	0.11
658	0.13
659	0.14
660	0.17
661	0.16
662	0.19
663	0.2
664	0.2
665	0.23
666	0.23
667	0.3
668	0.36
669	0.45
670	0.42
671	0.4
672	0.39
673	0.36
674	0.35
675	0.27
676	0.23
677	0.2
678	0.2
679	0.19
680	0.19
681	0.19
682	0.17
683	0.2
684	0.17
685	0.13
686	0.13
687	0.13
688	0.14
689	0.15
690	0.17
691	0.17
692	0.19
693	0.17
694	0.24
695	0.26
696	0.27
697	0.27
698	0.25
699	0.22
700	0.18
701	0.2
702	0.13
703	0.1
704	0.09
705	0.09
706	0.08
707	0.08
708	0.07
709	0.06
710	0.09
711	0.12
712	0.14
713	0.16
714	0.17
715	0.17
716	0.2
717	0.19
718	0.16
719	0.15
720	0.16
721	0.14
722	0.16
723	0.16
724	0.14
725	0.14
726	0.19
727	0.19
728	0.23
729	0.28
730	0.27
731	0.28
732	0.28
733	0.28
734	0.24
735	0.22
736	0.19
737	0.19
738	0.2
739	0.19
740	0.19
741	0.18
742	0.19
743	0.22
744	0.21
745	0.18
746	0.19
747	0.18
748	0.19
749	0.2
750	0.19
751	0.15
752	0.15
753	0.13
754	0.11
755	0.11
756	0.1
757	0.11
758	0.1
759	0.1
760	0.08
761	0.06
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.07
767	0.09
768	0.1
769	0.13
770	0.16
771	0.19
772	0.21
773	0.24
774	0.22
775	0.27
776	0.3
777	0.27
778	0.29
779	0.29
780	0.28
781	0.33
782	0.36
783	0.31
784	0.27
785	0.29
786	0.26
787	0.23
788	0.24
789	0.19
790	0.17
791	0.18
792	0.19
793	0.2
794	0.22
795	0.22
796	0.22
797	0.24
798	0.26
799	0.26
800	0.26
801	0.22
802	0.2
803	0.19
804	0.16
805	0.12
806	0.07
807	0.07
808	0.06
809	0.06
810	0.05
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.06
818	0.07
819	0.08
820	0.09
821	0.09
822	0.1
823	0.09
824	0.11
825	0.13
826	0.17
827	0.18
828	0.19
829	0.21
830	0.21
831	0.26
832	0.24
833	0.27
834	0.27
835	0.25
836	0.25
837	0.24
838	0.23
839	0.19
840	0.2
841	0.16
842	0.12
843	0.12
844	0.16
845	0.17
846	0.17
847	0.2
848	0.19
849	0.21
850	0.26
851	0.34
852	0.33
853	0.33
854	0.36
855	0.35
856	0.39
857	0.41
858	0.38
859	0.38
860	0.36
861	0.35
862	0.41
863	0.41
864	0.4
865	0.45
866	0.49
867	0.45
868	0.48
869	0.51
870	0.47
871	0.54
872	0.51
873	0.43
874	0.43
875	0.47
876	0.45
877	0.43
878	0.38
879	0.36
880	0.4
881	0.44
882	0.41
883	0.36
884	0.36
885	0.36
886	0.36
887	0.36
888	0.31
889	0.33
890	0.3
891	0.27
892	0.25
893	0.27
894	0.27
895	0.2
896	0.23
897	0.24
898	0.32
899	0.33
900	0.37
901	0.36
902	0.38
903	0.38
904	0.39
905	0.33
906	0.27
907	0.25
908	0.21
909	0.19
910	0.15
911	0.14
912	0.1
913	0.09
914	0.07
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.09
919	0.1
920	0.09
921	0.1
922	0.09
923	0.09
924	0.08
925	0.1
926	0.1
927	0.09
928	0.08
929	0.08
930	0.09
931	0.11
932	0.13
933	0.11
934	0.13
935	0.13
936	0.16
937	0.17
938	0.16
939	0.15
940	0.14
941	0.16
942	0.16
943	0.17
944	0.16
945	0.15
946	0.16
947	0.17
948	0.18
949	0.2
950	0.25
951	0.24
952	0.23
953	0.23
954	0.22
955	0.2
956	0.22
957	0.19
958	0.18
959	0.18
960	0.17
961	0.19
962	0.2
963	0.2
964	0.19
965	0.18
966	0.18
967	0.18
968	0.25
969	0.25
970	0.27
971	0.28
972	0.3
973	0.32
974	0.34
975	0.35
976	0.31
977	0.31
978	0.31
979	0.3
980	0.29
981	0.24
982	0.19
983	0.18
984	0.16
985	0.16
986	0.15
987	0.14
988	0.17
989	0.18
990	0.19
991	0.2
992	0.25
993	0.31
994	0.32
995	0.35
996	0.32
997	0.33
998	0.4
999	0.43
1000	0.4
1001	0.37
1002	0.36
1003	0.33
1004	0.34
1005	0.32
1006	0.25
1007	0.23
1008	0.23
1009	0.19
1010	0.23
1011	0.24
1012	0.22
1013	0.25
1014	0.26
1015	0.24
1016	0.28
1017	0.3
1018	0.26
1019	0.27
1020	0.32
1021	0.3
1022	0.33
1023	0.35
1024	0.3
1025	0.32
1026	0.31
1027	0.29
1028	0.26
1029	0.27
1030	0.23
1031	0.2
1032	0.18
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.12
1040	0.14
1041	0.13
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.11
1045	0.12
1046	0.14
1047	0.14
1048	0.15
1049	0.16
1050	0.2
1051	0.24
1052	0.25
1053	0.26
1054	0.34
1055	0.33
1056	0.32
1057	0.35
1058	0.33
1059	0.3
1060	0.3
1061	0.32
1062	0.28
1063	0.33
1064	0.33
1065	0.32
1066	0.34
1067	0.34
1068	0.34
1069	0.3
1070	0.31
1071	0.28
1072	0.31
1073	0.28
1074	0.25
1075	0.22
1076	0.22
1077	0.21
1078	0.15
1079	0.14
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.11
1083	0.11
1084	0.1
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.11
1088	0.12
1089	0.13
1090	0.13
1091	0.17
1092	0.18
1093	0.2
1094	0.21
1095	0.21
1096	0.24
1097	0.26
1098	0.27
1099	0.3
1100	0.29
1101	0.28
1102	0.27
1103	0.27
1104	0.25
1105	0.29
1106	0.35
1107	0.36
1108	0.4
1109	0.47
1110	0.51
1111	0.5
1112	0.56
1113	0.54
1114	0.52
1115	0.51
1116	0.48
1117	0.45
1118	0.4
1119	0.37
1120	0.3
1121	0.27
1122	0.22
1123	0.17
1124	0.15
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.12
1129	0.12
1130	0.09
1131	0.1
1132	0.13
1133	0.16
1134	0.17
1135	0.23
1136	0.24
1137	0.23
1138	0.22
1139	0.27
1140	0.34
1141	0.35
1142	0.43
1143	0.46
1144	0.48
1145	0.52
1146	0.57
1147	0.56
1148	0.51
1149	0.48
1150	0.41
1151	0.38
1152	0.36
1153	0.35
1154	0.31
1155	0.28
1156	0.23
1157	0.22
1158	0.2
1159	0.15
1160	0.13
1161	0.09
1162	0.07
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.05
1166	0.06
1167	0.11
1168	0.13
1169	0.14
1170	0.16
1171	0.18
1172	0.19
1173	0.25
1174	0.26
1175	0.3
1176	0.34
1177	0.36
1178	0.36
1179	0.37
1180	0.36
1181	0.32
1182	0.3
1183	0.21
1184	0.2
1185	0.19
1186	0.22
1187	0.2
1188	0.2
1189	0.19
1190	0.19
1191	0.21
1192	0.16
1193	0.16
1194	0.12
1195	0.11
1196	0.11
1197	0.11
1198	0.11
1199	0.11
1200	0.16
1201	0.16
1202	0.16
1203	0.16
1204	0.15
1205	0.15
1206	0.15
1207	0.12
1208	0.08
1209	0.08
1210	0.07
1211	0.06
1212	0.07
1213	0.07
1214	0.07
1215	0.07
1216	0.06
1217	0.06
1218	0.07
1219	0.1
1220	0.09
1221	0.12
1222	0.15
1223	0.19
1224	0.2
1225	0.23
1226	0.24
1227	0.23
1228	0.24
1229	0.24
1230	0.25
1231	0.25
1232	0.25
1233	0.24
1234	0.25
1235	0.23
1236	0.22
1237	0.21
1238	0.17
1239	0.14
1240	0.13
1241	0.16
1242	0.15
1243	0.17
1244	0.17
1245	0.19
1246	0.22
1247	0.25
1248	0.27
1249	0.25
1250	0.27
1251	0.26
1252	0.25
1253	0.22
1254	0.18
1255	0.15
1256	0.13
1257	0.11
1258	0.08
1259	0.07
1260	0.11
1261	0.11
1262	0.1
1263	0.11
1264	0.11
1265	0.11
1266	0.12
1267	0.12
1268	0.09
1269	0.09
1270	0.12
1271	0.12
1272	0.13
1273	0.15
1274	0.17
1275	0.17
1276	0.22
1277	0.32
1278	0.4
1279	0.48
1280	0.53
1281	0.58
1282	0.63
1283	0.73
1284	0.79
1285	0.78
1286	0.76
1287	0.74
1288	0.72
1289	0.74
1290	0.69
1291	0.7
1292	0.69
1293	0.69
1294	0.64
1295	0.62
1296	0.64
1297	0.63

A0A4V1ADV2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer