Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XR80

Protein Details
Accession A0A4P6XR80    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-198LQERVRRRLEFEKKKAQRRRERKKKNVVSEEVETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-189RRRLEFEKKKAQRRRERKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSEKTSTDQYGRKQWDVEAYAAEAQHGSKNQSKTRENDALKRKLKLQTFVDHRADLLGQAVDAVGKHTLVGGEKTTLTYGRNKRFGFSCPTCDLSFRDTLALVDHLNSPQHLHNVQKLLGKDFGTGEELEGGVRRASKAQVLQTIEELVKRLLREKSTQDDVLSLQERVRRRLEFEKKKAQRRRERKKKNVVSEEVETEMGKLMGFEGFGSTKSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.44
4 0.4
5 0.31
6 0.27
7 0.26
8 0.25
9 0.23
10 0.15
11 0.13
12 0.16
13 0.16
14 0.19
15 0.23
16 0.3
17 0.35
18 0.43
19 0.48
20 0.49
21 0.56
22 0.61
23 0.59
24 0.62
25 0.66
26 0.68
27 0.67
28 0.65
29 0.63
30 0.6
31 0.6
32 0.59
33 0.54
34 0.53
35 0.55
36 0.61
37 0.58
38 0.5
39 0.46
40 0.39
41 0.34
42 0.24
43 0.18
44 0.1
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.19
66 0.26
67 0.32
68 0.4
69 0.39
70 0.41
71 0.42
72 0.43
73 0.44
74 0.38
75 0.37
76 0.32
77 0.35
78 0.33
79 0.33
80 0.31
81 0.25
82 0.23
83 0.18
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.15
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.2
108 0.17
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.11
125 0.14
126 0.16
127 0.21
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.21
133 0.18
134 0.16
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.16
139 0.18
140 0.21
141 0.25
142 0.29
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.34
147 0.32
148 0.29
149 0.3
150 0.27
151 0.21
152 0.18
153 0.21
154 0.24
155 0.27
156 0.32
157 0.28
158 0.32
159 0.42
160 0.51
161 0.58
162 0.64
163 0.7
164 0.75
165 0.84
166 0.87
167 0.87
168 0.87
169 0.88
170 0.91
171 0.91
172 0.93
173 0.94
174 0.96
175 0.95
176 0.95
177 0.94
178 0.89
179 0.84
180 0.77
181 0.7
182 0.6
183 0.51
184 0.4
185 0.3
186 0.24
187 0.17
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.09