Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XLH5

Protein Details
Accession A0A4P6XLH5    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-33ASKSAPSEAKAKKPRRKAKSKKFELLIDYHydrophilic
174-202VKSRLKQQKVKLKSEKKKLEKAKTRSIKDBasic
238-300KNKSLKLSQAEKKKNKNISSSKKAKQTKVEEQQATKTPGTTLKSKAPKKKQRAEKPSATSTPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-26SEAKAKKPRRKAKSKK
177-204RLKQQKVKLKSEKKKLEKAKTRSIKDGK
247-263AEKKKNKNISSSKKAKQ
279-292LKSKAPKKKQRAEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MLKMASKSAPSEAKAKKPRRKAKSKKFELLIDYGDPNTKVVVRLLPPTLEMKEFIKQAADHSSTFKSGYKSLTYRRGSQAAQAFEEPNFSLAFVKFHSPEAADLFRSEITGVLFSETSSGDNIKCSTAKSIFGEISAAAPASDSTIDSAVFSVFADLREKNEGHVDINTAIDAVKSRLKQQKVKLKSEKKKLEKAKTRSIKDGKSTKEELNRHSTDKDERSSVLSAPDDKSSDASSIKNKSLKLSQAEKKKNKNISSSKKAKQTKVEEQQATKTPGTTLKSKAPKKKQRAEKPSATSTPSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.7
4 0.76
5 0.84
6 0.86
7 0.91
8 0.92
9 0.93
10 0.93
11 0.94
12 0.93
13 0.88
14 0.83
15 0.77
16 0.7
17 0.62
18 0.53
19 0.45
20 0.36
21 0.33
22 0.27
23 0.22
24 0.19
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.19
29 0.18
30 0.22
31 0.24
32 0.23
33 0.23
34 0.26
35 0.26
36 0.22
37 0.21
38 0.19
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.2
45 0.25
46 0.26
47 0.22
48 0.25
49 0.27
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.22
54 0.22
55 0.24
56 0.26
57 0.3
58 0.35
59 0.44
60 0.44
61 0.47
62 0.49
63 0.5
64 0.45
65 0.46
66 0.46
67 0.38
68 0.37
69 0.33
70 0.29
71 0.25
72 0.26
73 0.2
74 0.14
75 0.12
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.14
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.13
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.07
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.1
163 0.18
164 0.25
165 0.3
166 0.37
167 0.45
168 0.54
169 0.57
170 0.67
171 0.7
172 0.74
173 0.78
174 0.82
175 0.84
176 0.82
177 0.84
178 0.83
179 0.84
180 0.83
181 0.81
182 0.81
183 0.8
184 0.76
185 0.76
186 0.73
187 0.68
188 0.66
189 0.66
190 0.6
191 0.57
192 0.57
193 0.52
194 0.54
195 0.53
196 0.5
197 0.51
198 0.5
199 0.46
200 0.43
201 0.42
202 0.4
203 0.41
204 0.39
205 0.32
206 0.31
207 0.31
208 0.31
209 0.29
210 0.24
211 0.21
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.18
222 0.22
223 0.26
224 0.31
225 0.33
226 0.33
227 0.35
228 0.39
229 0.42
230 0.43
231 0.48
232 0.5
233 0.57
234 0.67
235 0.72
236 0.76
237 0.79
238 0.81
239 0.78
240 0.8
241 0.81
242 0.8
243 0.82
244 0.82
245 0.8
246 0.81
247 0.83
248 0.8
249 0.79
250 0.77
251 0.78
252 0.78
253 0.81
254 0.77
255 0.72
256 0.72
257 0.69
258 0.65
259 0.55
260 0.45
261 0.38
262 0.38
263 0.38
264 0.37
265 0.35
266 0.39
267 0.49
268 0.57
269 0.66
270 0.71
271 0.78
272 0.83
273 0.89
274 0.9
275 0.91
276 0.93
277 0.92
278 0.91
279 0.88
280 0.86
281 0.81