Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P6XYB1

Protein Details
Accession A0A4P6XYB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61SEAQALKRQKPVRPPRELKKQRDELGFRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-51QKPVRPPRELK
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 12, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002125  CMP_dCMP_dom  
IPR016193  Cytidine_deaminase-like  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0016814  F:hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF18785  Inv-AAD  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51747  CYT_DCMP_DEAMINASES_2  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MRRILTQQLRKFNMSNPEKSVSPIPAISSDQDSEAQALKRQKPVRPPRELKKQRDELGFRLKQQSVDKNVLVSTGEKTKTIHEEETEGAHYEIDGPLRRVTPYFFTYLTYCKLRWRDRKLIDIFVDEFRDKDPEFYRKAIAEGRVLLNKSPSNIDSIVRNGDLISHRLHRHEPAVTSRPIKIVFEDKNMIAIDKPSGMPVHPAGRYRYNTITKIMQHENGITVHPCNRLDRLTLGLMFLGKNAKGAESMVKQMRERSVRKEYIARVKGKFPLGLHTVDKPLTTASPKHALNVVDLENGKPAETEFVRISYDAKSDTSIVKCHPLTGRTHQIRVHLQYLGHPIANDPIYLSEFIWGSPELGKGNNGILDPGIVSRLDTIGKTRACSTWIHPQEDGEVLGNDECPECNVPLYTDPGPNDLDLWLHAYKYEAADKLWSYKVDYPEWALSPHRPFMELALENANKCGETQTQFNVGAVLVLDGEVLETGHSRELPGNTHAEQCALEKYLARTGSKDVPEGTELYTTMEPCSYRLSGNLPCVERVLASNIKTCFVGIVEPDTFVKENTGKKKLAEAGVEYIHIPGYEDECLRVAKLGHEKMELTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.54
4 0.53
5 0.49
6 0.5
7 0.48
8 0.41
9 0.37
10 0.32
11 0.28
12 0.27
13 0.29
14 0.28
15 0.27
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.22
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.25
24 0.33
25 0.36
26 0.44
27 0.5
28 0.54
29 0.6
30 0.7
31 0.74
32 0.76
33 0.81
34 0.82
35 0.87
36 0.91
37 0.9
38 0.9
39 0.89
40 0.85
41 0.85
42 0.8
43 0.77
44 0.77
45 0.72
46 0.65
47 0.64
48 0.58
49 0.54
50 0.56
51 0.57
52 0.53
53 0.54
54 0.5
55 0.44
56 0.43
57 0.38
58 0.31
59 0.24
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.31
67 0.34
68 0.34
69 0.28
70 0.3
71 0.3
72 0.32
73 0.29
74 0.24
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.2
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.25
91 0.23
92 0.24
93 0.25
94 0.27
95 0.29
96 0.27
97 0.25
98 0.3
99 0.38
100 0.46
101 0.54
102 0.6
103 0.66
104 0.68
105 0.77
106 0.73
107 0.72
108 0.63
109 0.57
110 0.51
111 0.42
112 0.41
113 0.32
114 0.28
115 0.21
116 0.23
117 0.19
118 0.22
119 0.25
120 0.27
121 0.31
122 0.33
123 0.35
124 0.32
125 0.34
126 0.34
127 0.31
128 0.27
129 0.26
130 0.27
131 0.29
132 0.29
133 0.27
134 0.26
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.21
141 0.21
142 0.19
143 0.21
144 0.22
145 0.19
146 0.18
147 0.14
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.21
153 0.22
154 0.25
155 0.28
156 0.27
157 0.29
158 0.3
159 0.3
160 0.32
161 0.36
162 0.37
163 0.37
164 0.35
165 0.35
166 0.32
167 0.3
168 0.25
169 0.27
170 0.26
171 0.28
172 0.29
173 0.26
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.18
178 0.16
179 0.13
180 0.11
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.18
188 0.18
189 0.21
190 0.24
191 0.3
192 0.32
193 0.34
194 0.39
195 0.39
196 0.38
197 0.39
198 0.4
199 0.35
200 0.39
201 0.38
202 0.32
203 0.28
204 0.27
205 0.26
206 0.22
207 0.2
208 0.15
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.12
235 0.17
236 0.19
237 0.21
238 0.21
239 0.24
240 0.29
241 0.33
242 0.34
243 0.36
244 0.42
245 0.42
246 0.44
247 0.47
248 0.46
249 0.49
250 0.53
251 0.51
252 0.44
253 0.45
254 0.47
255 0.42
256 0.39
257 0.29
258 0.28
259 0.25
260 0.25
261 0.24
262 0.21
263 0.21
264 0.19
265 0.19
266 0.14
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.13
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.22
276 0.21
277 0.2
278 0.21
279 0.18
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.1
297 0.11
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.18
307 0.17
308 0.19
309 0.2
310 0.2
311 0.23
312 0.27
313 0.37
314 0.34
315 0.37
316 0.36
317 0.39
318 0.41
319 0.4
320 0.36
321 0.27
322 0.25
323 0.25
324 0.28
325 0.24
326 0.2
327 0.16
328 0.14
329 0.16
330 0.16
331 0.13
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.09
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.18
369 0.18
370 0.19
371 0.2
372 0.22
373 0.27
374 0.31
375 0.33
376 0.31
377 0.31
378 0.31
379 0.3
380 0.27
381 0.17
382 0.11
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.15
397 0.16
398 0.18
399 0.18
400 0.2
401 0.2
402 0.19
403 0.18
404 0.14
405 0.12
406 0.09
407 0.13
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.16
415 0.13
416 0.13
417 0.16
418 0.17
419 0.2
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.25
424 0.28
425 0.27
426 0.28
427 0.27
428 0.27
429 0.28
430 0.26
431 0.23
432 0.25
433 0.27
434 0.29
435 0.26
436 0.24
437 0.24
438 0.24
439 0.29
440 0.24
441 0.22
442 0.26
443 0.27
444 0.25
445 0.26
446 0.24
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.14
451 0.15
452 0.18
453 0.21
454 0.25
455 0.25
456 0.25
457 0.23
458 0.18
459 0.16
460 0.13
461 0.1
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.03
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.04
471 0.05
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.12
476 0.14
477 0.17
478 0.19
479 0.23
480 0.23
481 0.26
482 0.25
483 0.23
484 0.22
485 0.2
486 0.2
487 0.17
488 0.16
489 0.16
490 0.19
491 0.23
492 0.25
493 0.25
494 0.24
495 0.27
496 0.34
497 0.33
498 0.33
499 0.28
500 0.28
501 0.29
502 0.28
503 0.25
504 0.19
505 0.17
506 0.18
507 0.19
508 0.17
509 0.16
510 0.17
511 0.15
512 0.15
513 0.2
514 0.17
515 0.16
516 0.18
517 0.23
518 0.25
519 0.32
520 0.37
521 0.34
522 0.33
523 0.34
524 0.32
525 0.27
526 0.24
527 0.24
528 0.23
529 0.23
530 0.28
531 0.28
532 0.28
533 0.28
534 0.26
535 0.2
536 0.16
537 0.16
538 0.12
539 0.16
540 0.16
541 0.17
542 0.17
543 0.2
544 0.2
545 0.18
546 0.22
547 0.22
548 0.3
549 0.38
550 0.44
551 0.43
552 0.44
553 0.51
554 0.52
555 0.52
556 0.48
557 0.42
558 0.41
559 0.4
560 0.39
561 0.32
562 0.26
563 0.21
564 0.17
565 0.15
566 0.11
567 0.12
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.17
572 0.18
573 0.17
574 0.18
575 0.16
576 0.21
577 0.3
578 0.34
579 0.35
580 0.37