FuNGI

A0A4Q9LYG1

Protein Details

Accession

A0A4Q9LYG1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-102	KTSPKLWVIKVKPHKEKRILQQLM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14, nucl 13, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
CDD	cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MPKNKHSEFIDIEAEESSSSSYESTYSTPSSPVATRDWTHFTDQLIKKYQDVDEELEEGEVEEEYVESEMAQQNLLPTKTSPKLWVIKVKPHKEKRILQQLMVKFANSPILSLFCRDNLPGYIYIESYSKQHIQEHIRSRITLVPLEEMVDALSTATDENVVFKSGMYVRIGKGKYKNDIGQVIGVQGPGRTKIRLVPRLPTKKMFDPTEFPNEVFKTKDYFIYKKEIYKNGFLEKVFDSTQLTIIEPSFSEMSMFCENGIMSGERIRVLEGEMTNSVGIVESVSGQELFIRTINNNQTDKNYLKRNSNNLIQVHSSFVKRDFKEGDLVVFEQTPGVILNVTNSTAVVAFNNFTEQKSVKIDFLRLANTVPTIIKNSSVPRQRLKRDPFLYKEVLLQEGEFKGYKGVVKDCYGDTFRVQLNSNLKYVNIGRDKVQKVGGFEGSKNYIFNEKYGGTPGYKTPGHMYGQTPGYKTPGHRYKEKFGETPGYKTPGHRYKDKFGETPGYSTSNKYTGETPGYSTTNKSLGSQTPGYSNKFSNQENNYKGIILKTDDGFDVVEKLYKSTYFTRNGKEFDISDVEYAPPVVFDRCCVVETNEKGIVLSMKGDVCIVRFGNGSVKEVSVDKLAKSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.21
3	0.17
4	0.13
5	0.08
6	0.08
7	0.08
8	0.07
9	0.08
10	0.1
11	0.12
12	0.15
13	0.17
14	0.18
15	0.19
16	0.2
17	0.23
18	0.23
19	0.24
20	0.24
21	0.27
22	0.28
23	0.32
24	0.37
25	0.36
26	0.39
27	0.38
28	0.37
29	0.41
30	0.44
31	0.47
32	0.49
33	0.47
34	0.44
35	0.46
36	0.46
37	0.4
38	0.39
39	0.35
40	0.29
41	0.3
42	0.28
43	0.23
44	0.21
45	0.16
46	0.13
47	0.09
48	0.06
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.06
53	0.05
54	0.05
55	0.08
56	0.11
57	0.12
58	0.12
59	0.11
60	0.14
61	0.2
62	0.21
63	0.19
64	0.17
65	0.25
66	0.29
67	0.31
68	0.31
69	0.34
70	0.41
71	0.45
72	0.54
73	0.52
74	0.59
75	0.67
76	0.73
77	0.77
78	0.79
79	0.83
80	0.82
81	0.85
82	0.85
83	0.86
84	0.79
85	0.73
86	0.72
87	0.65
88	0.63
89	0.55
90	0.44
91	0.34
92	0.31
93	0.33
94	0.24
95	0.22
96	0.15
97	0.18
98	0.18
99	0.2
100	0.2
101	0.15
102	0.17
103	0.17
104	0.18
105	0.16
106	0.19
107	0.19
108	0.2
109	0.19
110	0.18
111	0.18
112	0.17
113	0.16
114	0.14
115	0.17
116	0.19
117	0.2
118	0.23
119	0.29
120	0.36
121	0.44
122	0.51
123	0.55
124	0.53
125	0.51
126	0.5
127	0.47
128	0.42
129	0.36
130	0.28
131	0.22
132	0.2
133	0.21
134	0.19
135	0.14
136	0.12
137	0.09
138	0.08
139	0.05
140	0.05
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.04
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.12
152	0.12
153	0.15
154	0.15
155	0.17
156	0.17
157	0.25
158	0.26
159	0.29
160	0.35
161	0.37
162	0.41
163	0.44
164	0.47
165	0.44
166	0.45
167	0.4
168	0.34
169	0.29
170	0.25
171	0.2
172	0.16
173	0.12
174	0.1
175	0.1
176	0.12
177	0.13
178	0.12
179	0.13
180	0.18
181	0.28
182	0.35
183	0.37
184	0.42
185	0.51
186	0.6
187	0.63
188	0.63
189	0.59
190	0.57
191	0.62
192	0.57
193	0.5
194	0.45
195	0.46
196	0.49
197	0.44
198	0.38
199	0.36
200	0.34
201	0.31
202	0.28
203	0.25
204	0.2
205	0.2
206	0.25
207	0.25
208	0.27
209	0.29
210	0.35
211	0.36
212	0.4
213	0.45
214	0.46
215	0.44
216	0.46
217	0.47
218	0.43
219	0.44
220	0.37
221	0.34
222	0.28
223	0.28
224	0.22
225	0.2
226	0.17
227	0.14
228	0.16
229	0.14
230	0.13
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.07
249	0.06
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.11
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.05
266	0.05
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.12
281	0.17
282	0.21
283	0.22
284	0.22
285	0.23
286	0.27
287	0.29
288	0.28
289	0.32
290	0.3
291	0.36
292	0.4
293	0.45
294	0.45
295	0.48
296	0.48
297	0.41
298	0.4
299	0.34
300	0.3
301	0.26
302	0.23
303	0.19
304	0.14
305	0.17
306	0.22
307	0.21
308	0.24
309	0.24
310	0.23
311	0.26
312	0.26
313	0.22
314	0.16
315	0.16
316	0.13
317	0.11
318	0.1
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.16
345	0.17
346	0.17
347	0.18
348	0.19
349	0.19
350	0.2
351	0.19
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.1
358	0.09
359	0.11
360	0.1
361	0.11
362	0.13
363	0.16
364	0.22
365	0.29
366	0.32
367	0.37
368	0.45
369	0.5
370	0.58
371	0.62
372	0.64
373	0.64
374	0.67
375	0.64
376	0.62
377	0.58
378	0.49
379	0.45
380	0.36
381	0.31
382	0.24
383	0.19
384	0.16
385	0.14
386	0.15
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.12
392	0.12
393	0.14
394	0.16
395	0.17
396	0.19
397	0.19
398	0.22
399	0.22
400	0.21
401	0.19
402	0.19
403	0.19
404	0.2
405	0.2
406	0.22
407	0.26
408	0.27
409	0.27
410	0.24
411	0.23
412	0.23
413	0.24
414	0.27
415	0.25
416	0.24
417	0.26
418	0.35
419	0.37
420	0.36
421	0.39
422	0.32
423	0.3
424	0.32
425	0.34
426	0.27
427	0.26
428	0.27
429	0.25
430	0.24
431	0.22
432	0.2
433	0.21
434	0.19
435	0.19
436	0.2
437	0.18
438	0.18
439	0.21
440	0.21
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.21
445	0.2
446	0.21
447	0.21
448	0.24
449	0.25
450	0.26
451	0.26
452	0.26
453	0.31
454	0.32
455	0.3
456	0.26
457	0.27
458	0.26
459	0.27
460	0.32
461	0.36
462	0.38
463	0.46
464	0.51
465	0.57
466	0.64
467	0.66
468	0.58
469	0.53
470	0.59
471	0.52
472	0.52
473	0.47
474	0.42
475	0.38
476	0.39
477	0.45
478	0.43
479	0.46
480	0.5
481	0.52
482	0.56
483	0.65
484	0.67
485	0.59
486	0.55
487	0.59
488	0.51
489	0.48
490	0.42
491	0.37
492	0.33
493	0.32
494	0.31
495	0.27
496	0.26
497	0.25
498	0.25
499	0.24
500	0.28
501	0.27
502	0.27
503	0.27
504	0.29
505	0.28
506	0.28
507	0.27
508	0.26
509	0.25
510	0.24
511	0.24
512	0.25
513	0.3
514	0.31
515	0.29
516	0.33
517	0.36
518	0.39
519	0.37
520	0.36
521	0.36
522	0.38
523	0.4
524	0.41
525	0.44
526	0.49
527	0.49
528	0.51
529	0.46
530	0.42
531	0.4
532	0.33
533	0.29
534	0.23
535	0.23
536	0.2
537	0.21
538	0.2
539	0.19
540	0.18
541	0.16
542	0.15
543	0.12
544	0.14
545	0.13
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.19
550	0.24
551	0.31
552	0.37
553	0.42
554	0.5
555	0.54
556	0.56
557	0.55
558	0.52
559	0.45
560	0.41
561	0.4
562	0.33
563	0.27
564	0.26
565	0.23
566	0.19
567	0.19
568	0.14
569	0.1
570	0.1
571	0.12
572	0.11
573	0.12
574	0.16
575	0.17
576	0.18
577	0.2
578	0.23
579	0.29
580	0.33
581	0.37
582	0.36
583	0.34
584	0.33
585	0.32
586	0.3
587	0.21
588	0.19
589	0.16
590	0.14
591	0.14
592	0.16
593	0.15
594	0.14
595	0.18
596	0.17
597	0.16
598	0.16
599	0.17
600	0.24
601	0.25
602	0.27
603	0.23
604	0.23
605	0.23
606	0.24
607	0.25
608	0.23
609	0.24

A0A4Q9LYG1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer