FuNGI

A0A4Q9LSL9

Protein Details

Accession

A0A4Q9LSL9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
840-860	SDSSRWLKRRNIRPRNEAVNV	Hydrophilic
909-930	LNRYKFKSSKRIRSHSVQKILD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL

Amino Acid Sequences

MGRRKKVDSENIKSEKIKAVNNLENSAGEILMRDVDVAMLSERLLPPPTFHNTTHQPPSSSCKTSPVCLVDTIPSSSANGMTNLNTDALLEGNRLMVLHSILDSVTVVEQEWPRSAILAVQKRFERMPRNGWPATLRYYNEKFSCTLDIDAFKKLAQNEAEREIRQEENGERRRIATYNFLSKLKEISEKDIGKVVVRTRKLPTELVDSKVLDLINRIIGEYADSCVAMTITAIARIIQAAQVCYDEAKRKEKPRSAWKINIESKISKLVLSKDLLEKARKQEKLSTSETKSLKKIMREFNLNLSSVTDLSEALVKKNESLNVYEEKITMYERRKQFRKENRMFEIFRGRFYRGLSERVESEHVVSRDEIVSFWSTMWNKNDDTVTYDDYSIPSVSDNHPTTFPSLDEFVNIINWLPNWKAAGIDDIYNFFIQKLTTLHKYIYDIVKVICLEGTPQADWFYCGLTYLIPKGIPRRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQIEVEKRGLLVENQLGAVRGVQEAKEQIDVKKAYDSIDHAYLTQYIENLNLPDWILKFIKVIISKWKIDISLGPEKIMSKKIERGILQGDSLSPLLFVLCMDPLNRKLNEKYTKVTVQTDAESYSTNHLFSTLSAITDEAKDFLEVNGLEINKEKSATNDKCCEDTATLLEGVSVYKYLGIIEDSRGIPTRSSFEEVQSKLISRVEKLLLRLEPDDFSKLDDAVRAVLVKNKVHLRPGCKERLYLLRTELGRGLHSVELRSEHMLLQLLDYEQQSSRENNNKTHLALIKGFLKVKYRLVEEVTKKSLDEAQLAKLYNEIEKRKLHSKLYNARKNELVSVSDSSRWLKRRNIRPRNEAVNVFWGADGMCQHCGKSGKTVDHLATRCEKMLGHDYTRRHNEVVICLHHLLLNRYKFKSSKRIRSHSVQKILDNEYAEIRVDTRIKTDVKIWNNRPDIFILDKKKNNITLIEVGITSQDSLKIVETEKLRKYDLLANELGLIYKCSVEIIPYVMTWDGIVTKYHKSHLKRLEIPMNVEANIQSIVLKKTVETISFDRRRGLESGLNAEESWERASMGVIMRAEMHEEPTSPLKEEEREEDGAKNFKPKNKAPFISQGGTTLEEPTNNINKESDLEEETKVVKEVEENI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.61
3	0.55
4	0.51
5	0.49
6	0.52
7	0.54
8	0.56
9	0.55
10	0.48
11	0.43
12	0.39
13	0.32
14	0.23
15	0.15
16	0.12
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.07
21	0.06
22	0.07
23	0.07
24	0.07
25	0.08
26	0.07
27	0.08
28	0.11
29	0.12
30	0.14
31	0.18
32	0.17
33	0.18
34	0.24
35	0.31
36	0.32
37	0.33
38	0.39
39	0.43
40	0.51
41	0.58
42	0.56
43	0.51
44	0.49
45	0.56
46	0.55
47	0.54
48	0.47
49	0.47
50	0.46
51	0.46
52	0.51
53	0.46
54	0.41
55	0.37
56	0.38
57	0.32
58	0.32
59	0.31
60	0.25
61	0.21
62	0.2
63	0.19
64	0.19
65	0.16
66	0.15
67	0.15
68	0.15
69	0.16
70	0.16
71	0.16
72	0.13
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.12
96	0.14
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.17
101	0.18
102	0.17
103	0.17
104	0.24
105	0.31
106	0.32
107	0.37
108	0.38
109	0.41
110	0.44
111	0.47
112	0.47
113	0.45
114	0.51
115	0.55
116	0.62
117	0.6
118	0.59
119	0.56
120	0.5
121	0.49
122	0.46
123	0.39
124	0.39
125	0.42
126	0.47
127	0.45
128	0.43
129	0.39
130	0.36
131	0.37
132	0.31
133	0.29
134	0.25
135	0.28
136	0.28
137	0.29
138	0.27
139	0.23
140	0.25
141	0.23
142	0.26
143	0.25
144	0.29
145	0.3
146	0.36
147	0.4
148	0.37
149	0.39
150	0.37
151	0.33
152	0.29
153	0.29
154	0.29
155	0.35
156	0.42
157	0.43
158	0.4
159	0.41
160	0.43
161	0.41
162	0.38
163	0.37
164	0.35
165	0.4
166	0.43
167	0.43
168	0.42
169	0.4
170	0.4
171	0.34
172	0.36
173	0.29
174	0.31
175	0.39
176	0.39
177	0.39
178	0.41
179	0.38
180	0.32
181	0.34
182	0.35
183	0.34
184	0.35
185	0.38
186	0.38
187	0.44
188	0.45
189	0.44
190	0.41
191	0.42
192	0.43
193	0.43
194	0.42
195	0.36
196	0.33
197	0.32
198	0.29
199	0.19
200	0.17
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.13
205	0.11
206	0.11
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.09
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.06
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.08
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.11
232	0.14
233	0.2
234	0.23
235	0.31
236	0.38
237	0.46
238	0.56
239	0.62
240	0.68
241	0.72
242	0.78
243	0.79
244	0.8
245	0.79
246	0.79
247	0.78
248	0.75
249	0.68
250	0.59
251	0.52
252	0.5
253	0.42
254	0.34
255	0.3
256	0.27
257	0.27
258	0.27
259	0.28
260	0.26
261	0.31
262	0.34
263	0.35
264	0.36
265	0.41
266	0.49
267	0.49
268	0.48
269	0.51
270	0.53
271	0.55
272	0.57
273	0.56
274	0.51
275	0.56
276	0.57
277	0.53
278	0.48
279	0.49
280	0.47
281	0.46
282	0.5
283	0.51
284	0.53
285	0.56
286	0.55
287	0.56
288	0.55
289	0.49
290	0.41
291	0.32
292	0.27
293	0.2
294	0.19
295	0.11
296	0.08
297	0.08
298	0.12
299	0.11
300	0.12
301	0.15
302	0.14
303	0.16
304	0.19
305	0.21
306	0.19
307	0.21
308	0.23
309	0.23
310	0.25
311	0.24
312	0.21
313	0.19
314	0.18
315	0.18
316	0.2
317	0.21
318	0.28
319	0.34
320	0.43
321	0.49
322	0.56
323	0.64
324	0.69
325	0.76
326	0.77
327	0.79
328	0.77
329	0.78
330	0.71
331	0.65
332	0.65
333	0.55
334	0.5
335	0.45
336	0.39
337	0.34
338	0.34
339	0.38
340	0.29
341	0.33
342	0.3
343	0.29
344	0.28
345	0.28
346	0.29
347	0.21
348	0.21
349	0.22
350	0.2
351	0.2
352	0.19
353	0.18
354	0.17
355	0.16
356	0.14
357	0.1
358	0.11
359	0.1
360	0.11
361	0.14
362	0.15
363	0.19
364	0.22
365	0.23
366	0.22
367	0.24
368	0.24
369	0.19
370	0.22
371	0.2
372	0.21
373	0.19
374	0.19
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.13
379	0.11
380	0.08
381	0.1
382	0.11
383	0.18
384	0.19
385	0.19
386	0.2
387	0.21
388	0.22
389	0.2
390	0.19
391	0.13
392	0.14
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.11
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.09
418	0.09
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.12
423	0.15
424	0.17
425	0.17
426	0.18
427	0.2
428	0.22
429	0.23
430	0.19
431	0.17
432	0.16
433	0.18
434	0.16
435	0.14
436	0.1
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.1
441	0.08
442	0.09
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.09
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.1
457	0.14
458	0.18
459	0.2
460	0.21
461	0.28
462	0.32
463	0.35
464	0.42
465	0.45
466	0.42
467	0.42
468	0.41
469	0.35
470	0.31
471	0.31
472	0.24
473	0.24
474	0.22
475	0.22
476	0.26
477	0.25
478	0.28
479	0.29
480	0.28
481	0.23
482	0.27
483	0.26
484	0.25
485	0.28
486	0.26
487	0.27
488	0.28
489	0.3
490	0.28
491	0.27
492	0.23
493	0.2
494	0.18
495	0.13
496	0.11
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.11
513	0.12
514	0.12
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.16
521	0.16
522	0.17
523	0.13
524	0.15
525	0.14
526	0.13
527	0.13
528	0.13
529	0.12
530	0.1
531	0.08
532	0.06
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.07
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.13
547	0.13
548	0.13
549	0.19
550	0.23
551	0.23
552	0.24
553	0.24
554	0.21
555	0.2
556	0.21
557	0.18
558	0.22
559	0.22
560	0.21
561	0.2
562	0.21
563	0.23
564	0.25
565	0.2
566	0.15
567	0.2
568	0.23
569	0.27
570	0.26
571	0.27
572	0.26
573	0.25
574	0.22
575	0.18
576	0.15
577	0.11
578	0.11
579	0.08
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.07
590	0.11
591	0.16
592	0.16
593	0.19
594	0.21
595	0.29
596	0.36
597	0.36
598	0.35
599	0.35
600	0.38
601	0.37
602	0.37
603	0.3
604	0.25
605	0.23
606	0.21
607	0.17
608	0.14
609	0.13
610	0.12
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.1
616	0.09
617	0.08
618	0.12
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.1
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.06
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.1
635	0.1
636	0.1
637	0.11
638	0.12
639	0.1
640	0.11
641	0.1
642	0.11
643	0.21
644	0.25
645	0.29
646	0.34
647	0.35
648	0.35
649	0.36
650	0.35
651	0.25
652	0.22
653	0.18
654	0.13
655	0.12
656	0.11
657	0.1
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.05
668	0.06
669	0.07
670	0.1
671	0.1
672	0.11
673	0.13
674	0.13
675	0.12
676	0.12
677	0.14
678	0.13
679	0.17
680	0.17
681	0.19
682	0.25
683	0.26
684	0.27
685	0.25
686	0.24
687	0.21
688	0.24
689	0.21
690	0.15
691	0.18
692	0.18
693	0.19
694	0.2
695	0.23
696	0.21
697	0.22
698	0.22
699	0.2
700	0.18
701	0.17
702	0.18
703	0.14
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.11
708	0.11
709	0.1
710	0.08
711	0.09
712	0.08
713	0.08
714	0.12
715	0.15
716	0.15
717	0.19
718	0.24
719	0.25
720	0.32
721	0.36
722	0.37
723	0.42
724	0.49
725	0.52
726	0.48
727	0.47
728	0.44
729	0.49
730	0.45
731	0.38
732	0.33
733	0.3
734	0.29
735	0.3
736	0.29
737	0.2
738	0.19
739	0.17
740	0.17
741	0.14
742	0.15
743	0.14
744	0.12
745	0.14
746	0.14
747	0.15
748	0.14
749	0.12
750	0.12
751	0.13
752	0.12
753	0.1
754	0.1
755	0.09
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.09
760	0.11
761	0.13
762	0.15
763	0.21
764	0.28
765	0.31
766	0.34
767	0.39
768	0.39
769	0.38
770	0.4
771	0.36
772	0.31
773	0.29
774	0.27
775	0.25
776	0.26
777	0.27
778	0.24
779	0.27
780	0.26
781	0.29
782	0.3
783	0.29
784	0.28
785	0.3
786	0.37
787	0.37
788	0.41
789	0.39
790	0.36
791	0.34
792	0.33
793	0.32
794	0.25
795	0.25
796	0.2
797	0.21
798	0.24
799	0.24
800	0.23
801	0.21
802	0.2
803	0.2
804	0.24
805	0.23
806	0.25
807	0.28
808	0.33
809	0.39
810	0.44
811	0.46
812	0.46
813	0.53
814	0.58
815	0.66
816	0.69
817	0.65
818	0.62
819	0.59
820	0.54
821	0.49
822	0.41
823	0.31
824	0.26
825	0.26
826	0.25
827	0.23
828	0.23
829	0.22
830	0.26
831	0.29
832	0.32
833	0.37
834	0.46
835	0.55
836	0.65
837	0.72
838	0.76
839	0.79
840	0.82
841	0.81
842	0.77
843	0.68
844	0.59
845	0.54
846	0.46
847	0.37
848	0.29
849	0.21
850	0.16
851	0.14
852	0.13
853	0.09
854	0.12
855	0.12
856	0.12
857	0.16
858	0.19
859	0.19
860	0.25
861	0.29
862	0.3
863	0.33
864	0.37
865	0.35
866	0.4
867	0.4
868	0.36
869	0.36
870	0.34
871	0.31
872	0.28
873	0.26
874	0.23
875	0.3
876	0.31
877	0.31
878	0.35
879	0.38
880	0.46
881	0.52
882	0.5
883	0.43
884	0.41
885	0.39
886	0.39
887	0.41
888	0.35
889	0.32
890	0.29
891	0.29
892	0.27
893	0.27
894	0.25
895	0.27
896	0.32
897	0.34
898	0.36
899	0.4
900	0.43
901	0.48
902	0.54
903	0.57
904	0.61
905	0.65
906	0.71
907	0.73
908	0.79
909	0.83
910	0.82
911	0.81
912	0.74
913	0.66
914	0.64
915	0.61
916	0.55
917	0.45
918	0.36
919	0.28
920	0.26
921	0.23
922	0.18
923	0.14
924	0.15
925	0.16
926	0.16
927	0.17
928	0.21
929	0.22
930	0.24
931	0.3
932	0.34
933	0.4
934	0.5
935	0.54
936	0.58
937	0.62
938	0.62
939	0.57
940	0.5
941	0.45
942	0.41
943	0.43
944	0.41
945	0.44
946	0.47
947	0.5
948	0.54
949	0.54
950	0.51
951	0.45
952	0.43
953	0.38
954	0.35
955	0.32
956	0.26
957	0.22
958	0.2
959	0.18
960	0.13
961	0.09
962	0.08
963	0.08
964	0.09
965	0.1
966	0.11
967	0.12
968	0.17
969	0.21
970	0.28
971	0.33
972	0.35
973	0.36
974	0.34
975	0.37
976	0.39
977	0.39
978	0.37
979	0.32
980	0.29
981	0.29
982	0.28
983	0.25
984	0.18
985	0.15
986	0.1
987	0.1
988	0.09
989	0.09
990	0.09
991	0.09
992	0.1
993	0.11
994	0.11
995	0.11
996	0.13
997	0.12
998	0.12
999	0.1
1000	0.1
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.19
1006	0.21
1007	0.28
1008	0.34
1009	0.38
1010	0.47
1011	0.55
1012	0.62
1013	0.63
1014	0.69
1015	0.72
1016	0.68
1017	0.67
1018	0.63
1019	0.55
1020	0.46
1021	0.39
1022	0.31
1023	0.24
1024	0.21
1025	0.16
1026	0.11
1027	0.13
1028	0.14
1029	0.15
1030	0.15
1031	0.13
1032	0.19
1033	0.22
1034	0.23
1035	0.25
1036	0.29
1037	0.38
1038	0.45
1039	0.46
1040	0.45
1041	0.43
1042	0.45
1043	0.41
1044	0.4
1045	0.35
1046	0.32
1047	0.37
1048	0.34
1049	0.34
1050	0.3
1051	0.3
1052	0.26
1053	0.22
1054	0.2
1055	0.14
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.12
1059	0.13
1060	0.14
1061	0.17
1062	0.15
1063	0.16
1064	0.16
1065	0.17
1066	0.2
1067	0.17
1068	0.19
1069	0.16
1070	0.17
1071	0.2
1072	0.25
1073	0.27
1074	0.25
1075	0.27
1076	0.27
1077	0.3
1078	0.32
1079	0.34
1080	0.33
1081	0.35
1082	0.35
1083	0.37
1084	0.38
1085	0.4
1086	0.38
1087	0.42
1088	0.42
1089	0.46
1090	0.53
1091	0.56
1092	0.62
1093	0.67
1094	0.69
1095	0.66
1096	0.71
1097	0.71
1098	0.66
1099	0.59
1100	0.51
1101	0.43
1102	0.41
1103	0.36
1104	0.3
1105	0.24
1106	0.2
1107	0.22
1108	0.26
1109	0.32
1110	0.3
1111	0.31
1112	0.28
1113	0.28
1114	0.29
1115	0.3
1116	0.26
1117	0.23
1118	0.24
1119	0.24
1120	0.25
1121	0.26
1122	0.24
1123	0.23
1124	0.2
1125	0.16

A0A4Q9LSL9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer