FuNGI

A0A4Q9LSJ3

Protein Details

Accession

A0A4Q9LSJ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
734-754	SDSSRWLKRGNIRPRNKAVFC	Hydrophilic
799-818	LNRYKFKSSKRIRSHSVQEI	Hydrophilic
905-924	RIVTKYHKSHFKRLEIPMNV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGRIKKVTSENIKSEKIKALNTLKNSAGEIKTCDIEVEMIFERLIPQQTFHNTNNQAIVARLVQSAWFSPYPRFLVPMPLRVDQPTALKNPNIDAILKGNRLIVLHKILDSVAAVEQEWLRSVILAPANLRYYNEKFSRTIDLDVFKKLTQNEAERKTRQEENGERRRIASCLTKPCTLTDTTVYISLRDKFLSKIKEISEKEIGKEVVRTRKHPNKLFDSKYTDSYLPMTITAVCYDEATREEKPRSASKENIETEKALTSETKSLKKIMREFNLNLSSVTDLFEALMEEIPKRGSYGYLTVLNEHVVSRDEIVSFWSIMWNKDDGSGTPQADWFYCGLTYLIPKGIPQRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQIEVERRGWLSENQLGAVRGVQGAKEQALLNIAINKEYGNNLKTTWIDVKKAYDSIDHAYLTQCIENLNLPDWIKIERGDLQGDSLSPLLFVLLTVQTDAESHSTNHLLFIDDLKLLAKDSSTLSAMTGEAKEFLEVIGLEINKEKSATNDTCCEDTATLLEGVSVYKYLGIIEDSRGIPTRSSFEEVQSKLISRVERLCHTRLNAKNLSFAINQHAISLINYHIGVLRLEPADFSKLDDAVRAVLVKNKIHLRPGCKERLYLPRTELGRGLHSVELRSEHMLLLILDCLEKSKEISTRRAAILKVVNNNKTHLGLIKGFLKVKYRLVEEVTKKSLEEAQLAKLYNEIEKRKLHSNVSDSSRWLKRGNIRPRNKAVFCYIQDRNVFWRTDGMYHLATRCEKMLGHDCTRRHNEVVRCLHLLLLNRYKFKSSKRIRSHSVQEILDKEYAEIRVDTRIKTDVKIRNNRPEIFILDKKKNKITLIEVGITSQDSLQIVESEKLRKYDLLANELGLIYKCSVEIIPYVMTWDRIVTKYHKSHFKRLEIPMNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.56
4	0.51
5	0.51
6	0.54
7	0.54
8	0.57
9	0.57
10	0.51
11	0.49
12	0.48
13	0.45
14	0.38
15	0.33
16	0.32
17	0.3
18	0.29
19	0.27
20	0.25
21	0.19
22	0.19
23	0.16
24	0.17
25	0.15
26	0.15
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.17
31	0.22
32	0.18
33	0.18
34	0.24
35	0.31
36	0.37
37	0.37
38	0.43
39	0.41
40	0.43
41	0.45
42	0.39
43	0.33
44	0.27
45	0.28
46	0.2
47	0.18
48	0.16
49	0.14
50	0.13
51	0.14
52	0.15
53	0.18
54	0.18
55	0.18
56	0.21
57	0.26
58	0.29
59	0.28
60	0.3
61	0.25
62	0.34
63	0.36
64	0.41
65	0.41
66	0.39
67	0.4
68	0.39
69	0.41
70	0.33
71	0.34
72	0.32
73	0.32
74	0.34
75	0.34
76	0.33
77	0.33
78	0.34
79	0.3
80	0.26
81	0.22
82	0.25
83	0.29
84	0.29
85	0.28
86	0.25
87	0.24
88	0.24
89	0.24
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.22
94	0.21
95	0.2
96	0.2
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.12
106	0.11
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.13
111	0.15
112	0.16
113	0.16
114	0.19
115	0.22
116	0.22
117	0.24
118	0.25
119	0.27
120	0.33
121	0.36
122	0.36
123	0.35
124	0.37
125	0.43
126	0.39
127	0.39
128	0.35
129	0.36
130	0.35
131	0.37
132	0.36
133	0.29
134	0.31
135	0.28
136	0.29
137	0.3
138	0.37
139	0.42
140	0.48
141	0.55
142	0.55
143	0.59
144	0.58
145	0.58
146	0.54
147	0.55
148	0.57
149	0.59
150	0.66
151	0.67
152	0.63
153	0.59
154	0.56
155	0.47
156	0.41
157	0.4
158	0.37
159	0.42
160	0.46
161	0.47
162	0.46
163	0.47
164	0.46
165	0.38
166	0.34
167	0.27
168	0.25
169	0.22
170	0.25
171	0.24
172	0.22
173	0.24
174	0.23
175	0.21
176	0.2
177	0.2
178	0.19
179	0.26
180	0.3
181	0.29
182	0.32
183	0.34
184	0.42
185	0.43
186	0.45
187	0.47
188	0.44
189	0.43
190	0.43
191	0.41
192	0.32
193	0.36
194	0.36
195	0.37
196	0.39
197	0.42
198	0.46
199	0.55
200	0.64
201	0.66
202	0.68
203	0.68
204	0.74
205	0.75
206	0.72
207	0.71
208	0.64
209	0.6
210	0.55
211	0.46
212	0.37
213	0.34
214	0.28
215	0.2
216	0.18
217	0.15
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.13
228	0.16
229	0.2
230	0.22
231	0.24
232	0.29
233	0.34
234	0.4
235	0.43
236	0.45
237	0.46
238	0.53
239	0.53
240	0.53
241	0.47
242	0.41
243	0.36
244	0.32
245	0.27
246	0.18
247	0.16
248	0.14
249	0.19
250	0.23
251	0.26
252	0.26
253	0.32
254	0.35
255	0.41
256	0.46
257	0.48
258	0.49
259	0.51
260	0.52
261	0.54
262	0.53
263	0.47
264	0.39
265	0.31
266	0.26
267	0.2
268	0.19
269	0.11
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.11
286	0.14
287	0.18
288	0.18
289	0.19
290	0.19
291	0.18
292	0.17
293	0.14
294	0.12
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.11
303	0.09
304	0.09
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.15
312	0.16
313	0.12
314	0.16
315	0.19
316	0.18
317	0.18
318	0.18
319	0.17
320	0.16
321	0.17
322	0.12
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.08
332	0.09
333	0.14
334	0.18
335	0.19
336	0.2
337	0.26
338	0.29
339	0.33
340	0.38
341	0.37
342	0.33
343	0.33
344	0.33
345	0.28
346	0.23
347	0.24
348	0.2
349	0.23
350	0.23
351	0.23
352	0.27
353	0.26
354	0.3
355	0.31
356	0.29
357	0.24
358	0.28
359	0.27
360	0.26
361	0.3
362	0.28
363	0.28
364	0.29
365	0.31
366	0.29
367	0.29
368	0.25
369	0.22
370	0.2
371	0.16
372	0.15
373	0.16
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.17
378	0.17
379	0.15
380	0.14
381	0.1
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.09
389	0.08
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.12
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.13
406	0.13
407	0.14
408	0.2
409	0.19
410	0.2
411	0.21
412	0.23
413	0.22
414	0.23
415	0.21
416	0.15
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.14
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.12
425	0.1
426	0.08
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.12
441	0.13
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.08
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.07
476	0.08
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.15
511	0.17
512	0.18
513	0.22
514	0.23
515	0.23
516	0.24
517	0.23
518	0.16
519	0.14
520	0.12
521	0.1
522	0.08
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.12
544	0.14
545	0.13
546	0.17
547	0.17
548	0.19
549	0.25
550	0.26
551	0.27
552	0.25
553	0.24
554	0.21
555	0.24
556	0.21
557	0.16
558	0.21
559	0.21
560	0.26
561	0.3
562	0.31
563	0.31
564	0.32
565	0.39
566	0.38
567	0.43
568	0.43
569	0.39
570	0.4
571	0.38
572	0.39
573	0.31
574	0.27
575	0.25
576	0.22
577	0.22
578	0.18
579	0.18
580	0.14
581	0.14
582	0.14
583	0.09
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.07
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.12
603	0.11
604	0.09
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.12
609	0.16
610	0.16
611	0.2
612	0.26
613	0.27
614	0.34
615	0.37
616	0.39
617	0.44
618	0.51
619	0.55
620	0.5
621	0.5
622	0.48
623	0.54
624	0.51
625	0.45
626	0.41
627	0.38
628	0.38
629	0.38
630	0.35
631	0.26
632	0.26
633	0.24
634	0.24
635	0.2
636	0.19
637	0.19
638	0.17
639	0.17
640	0.16
641	0.16
642	0.15
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.1
647	0.09
648	0.08
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.06
654	0.07
655	0.08
656	0.11
657	0.17
658	0.21
659	0.28
660	0.31
661	0.36
662	0.38
663	0.4
664	0.37
665	0.36
666	0.39
667	0.37
668	0.41
669	0.43
670	0.45
671	0.43
672	0.45
673	0.41
674	0.36
675	0.32
676	0.25
677	0.22
678	0.19
679	0.2
680	0.22
681	0.24
682	0.25
683	0.26
684	0.29
685	0.28
686	0.32
687	0.33
688	0.32
689	0.31
690	0.33
691	0.4
692	0.4
693	0.44
694	0.43
695	0.39
696	0.36
697	0.35
698	0.35
699	0.28
700	0.27
701	0.22
702	0.23
703	0.26
704	0.27
705	0.25
706	0.23
707	0.22
708	0.22
709	0.26
710	0.26
711	0.27
712	0.31
713	0.35
714	0.41
715	0.45
716	0.45
717	0.45
718	0.47
719	0.48
720	0.51
721	0.49
722	0.44
723	0.47
724	0.46
725	0.43
726	0.39
727	0.39
728	0.43
729	0.51
730	0.6
731	0.63
732	0.68
733	0.74
734	0.81
735	0.84
736	0.77
737	0.7
738	0.65
739	0.63
740	0.57
741	0.55
742	0.48
743	0.45
744	0.45
745	0.43
746	0.42
747	0.39
748	0.37
749	0.3
750	0.32
751	0.27
752	0.28
753	0.28
754	0.25
755	0.23
756	0.24
757	0.25
758	0.25
759	0.24
760	0.24
761	0.23
762	0.21
763	0.19
764	0.23
765	0.31
766	0.33
767	0.39
768	0.44
769	0.45
770	0.53
771	0.59
772	0.57
773	0.52
774	0.53
775	0.52
776	0.56
777	0.61
778	0.56
779	0.52
780	0.48
781	0.46
782	0.41
783	0.39
784	0.37
785	0.39
786	0.39
787	0.41
788	0.42
789	0.45
790	0.47
791	0.49
792	0.52
793	0.53
794	0.6
795	0.66
796	0.74
797	0.76
798	0.8
799	0.81
800	0.8
801	0.76
802	0.67
803	0.62
804	0.56
805	0.52
806	0.45
807	0.37
808	0.28
809	0.24
810	0.23
811	0.2
812	0.18
813	0.16
814	0.22
815	0.25
816	0.25
817	0.24
818	0.29
819	0.29
820	0.31
821	0.4
822	0.4
823	0.47
824	0.57
825	0.63
826	0.68
827	0.74
828	0.74
829	0.69
830	0.64
831	0.59
832	0.57
833	0.56
834	0.54
835	0.56
836	0.6
837	0.62
838	0.65
839	0.65
840	0.6
841	0.57
842	0.55
843	0.54
844	0.52
845	0.5
846	0.43
847	0.38
848	0.36
849	0.3
850	0.25
851	0.16
852	0.12
853	0.09
854	0.1
855	0.1
856	0.11
857	0.13
858	0.16
859	0.19
860	0.23
861	0.26
862	0.27
863	0.28
864	0.27
865	0.29
866	0.34
867	0.36
868	0.36
869	0.34
870	0.32
871	0.32
872	0.31
873	0.28
874	0.21
875	0.17
876	0.12
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.1
881	0.11
882	0.12
883	0.13
884	0.13
885	0.13
886	0.16
887	0.16
888	0.17
889	0.16
890	0.18
891	0.19
892	0.2
893	0.25
894	0.27
895	0.35
896	0.43
897	0.51
898	0.59
899	0.62
900	0.71
901	0.76
902	0.8
903	0.79
904	0.79

A0A4Q9LSJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer