Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LIM8

Protein Details
Accession A0A4Q9LIM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MKTPRSRITFKTPKKRNIKTPLSLKQSRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-38KTPKKRNIKTPLSLKQSRGSRESKESRD
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 4.666, mito 4.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031519  DUF5094  
IPR035992  Ricin_B-like_lectins  
IPR000772  Ricin_B_lectin  
Pfam View protein in Pfam  
PF17015  DUF5094  
CDD cd00161  RICIN  
Amino Acid Sequences MKTPRSRITFKTPKKRNIKTPLSLKQSRGSRESKESRDNKEVKERRDNRDTSLSLKHKDNHTVLTENKKLDSSIISTENTLSSLLESYREENKFLRNLKNDSLIFQRLIGLSIKEVEGKYECTHTVTVKGVTRYIVFLLIPDTSSYVYKPVSSCNVSLPEYLSDSICFTEEHIQMGVRDVLEDMLQKGVSYKESNGIIVKGVLLIKSNIEGVIKVVLVIKSNSIVVKGVLVIKSNIEGVRSLGRTVPKLVNKMDADFYEIDRVGNSLLEVTLEAVELDKVFDIEGNNKRLIYYPLHGYNNQQFQLFLDYSGAYRIMSNGLCMEYNELELAFMRETCRNDRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.9
3 0.9
4 0.89
5 0.89
6 0.87
7 0.88
8 0.87
9 0.86
10 0.82
11 0.75
12 0.73
13 0.7
14 0.66
15 0.62
16 0.58
17 0.55
18 0.59
19 0.64
20 0.64
21 0.67
22 0.69
23 0.7
24 0.75
25 0.75
26 0.71
27 0.73
28 0.73
29 0.7
30 0.74
31 0.74
32 0.73
33 0.76
34 0.72
35 0.67
36 0.69
37 0.62
38 0.56
39 0.58
40 0.56
41 0.5
42 0.54
43 0.54
44 0.49
45 0.55
46 0.53
47 0.48
48 0.46
49 0.46
50 0.45
51 0.49
52 0.49
53 0.42
54 0.41
55 0.37
56 0.33
57 0.29
58 0.26
59 0.2
60 0.19
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.17
67 0.14
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.2
76 0.21
77 0.22
78 0.23
79 0.28
80 0.32
81 0.37
82 0.42
83 0.4
84 0.44
85 0.44
86 0.5
87 0.46
88 0.41
89 0.41
90 0.36
91 0.3
92 0.26
93 0.24
94 0.17
95 0.18
96 0.16
97 0.12
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.15
112 0.17
113 0.16
114 0.18
115 0.2
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.19
231 0.2
232 0.24
233 0.29
234 0.28
235 0.32
236 0.33
237 0.37
238 0.35
239 0.36
240 0.34
241 0.28
242 0.27
243 0.24
244 0.23
245 0.2
246 0.19
247 0.17
248 0.14
249 0.15
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.06
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.08
270 0.16
271 0.22
272 0.26
273 0.27
274 0.27
275 0.27
276 0.28
277 0.3
278 0.27
279 0.25
280 0.28
281 0.34
282 0.39
283 0.39
284 0.43
285 0.47
286 0.5
287 0.47
288 0.4
289 0.33
290 0.3
291 0.36
292 0.3
293 0.22
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.17
298 0.16
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.18
310 0.15
311 0.16
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.11
318 0.11
319 0.13
320 0.18
321 0.22