FuNGI

A0A4Q9LZJ3

Protein Details

Accession

A0A4Q9LZJ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
685-735	GEGEGDRRKDKKKDKRKDRRKDKKKDKKKDKKKKNNHTKNKNNHPNTNTKN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
691-724	RRKDKKKDKRKDRRKDKKKDKKKDKKKKNNHTKN

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 14.333, cyto 7.5, cyto_mito 4.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MSECTTTMINDLLPSYLLTPFPYNTFYLIITSGAKGSIVNLSQISVLLGQQELEGKRVSNMISNKTLPCYSIKDMIEIESKGFIFDRFLTGIKENMYFFHCMAGREGLIDTAVKTSKSGYLQRCLVKHMEGVKVEYDMSVRQGKKVIQFIYGDDGIDCSKWSLIREYDMYKENCGYGDSNRVRDSTRDRDWDRDSNTISNSNPFSIYGRISTPIFNNNNTTPISTPISNNISTPLSNNISTPISMSSVINYFPPQLFIPSLKYFEDLKVYCDKNIGYNGDSNRDISNRDIGNRDIGNRDIGNRDIGNRDIGNRDSISNRDIGNNNDLRNNEIPYNNEIPYNNSLRNYNDIPFNNHNNTNTNTTNTNTSNTNHNTNHNTNNNTTNTNILVSYILKKYISSLVVAGESVGVLAAQSIGEPSTQMTLNTFHLAGVGSKNVTLGIPRLREILMVASKKIQTPVISVRYYNISNVLLERVMSCVVLKECVDRISVSEIGNRISVNLEINGRYFMGGISRGGECGGCIGDSKEYDSGSSIGGGKEYDNNTNNIDNTNNIDNTNNIDNTNNIDNITDTNTLNTNNTINTNTINDNNTNSYVVTSSSIYKVVKGKYLKMVDKSIKNLYGVLNNYKGSCIKVRGGGSSEGEGEGEGEGNSGSSEGSSEESKEIDEEYIGKVEDSSEEDEGEDEGEGEGDRRKDKKKDKRKDRRKDKKKDKKKDKKKKNNHTKNKNNHPNTNTKNNIRFYCISNLETSFVGRIINLSFDLNFDKNIILFPILEDTLNKVIVRCVEGLRNPICDKNILNINGNDLYSLCSVVNINKNIKNYKNFLDIEKSYCNDVYGMYKILGVEGCRSVLVREIESVFDVYGIGVDNRHLGLISDYLLVDGVYSSFSRFGMEKSESILLKMSFESCYSVLRDASHRELGDCLEGPSGCLTAGLPVRNGTGCFELLYDMEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.12
4	0.12
5	0.14
6	0.17
7	0.17
8	0.19
9	0.22
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.2
14	0.18
15	0.18
16	0.17
17	0.16
18	0.16
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.1
23	0.11
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.15
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.1
33	0.1
34	0.09
35	0.09
36	0.08
37	0.09
38	0.15
39	0.15
40	0.16
41	0.17
42	0.16
43	0.17
44	0.2
45	0.2
46	0.21
47	0.26
48	0.3
49	0.35
50	0.38
51	0.39
52	0.41
53	0.41
54	0.35
55	0.34
56	0.35
57	0.33
58	0.37
59	0.35
60	0.34
61	0.34
62	0.36
63	0.37
64	0.3
65	0.27
66	0.22
67	0.22
68	0.2
69	0.19
70	0.16
71	0.15
72	0.15
73	0.17
74	0.16
75	0.18
76	0.2
77	0.21
78	0.23
79	0.22
80	0.23
81	0.2
82	0.21
83	0.22
84	0.21
85	0.19
86	0.23
87	0.22
88	0.21
89	0.23
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.2
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.11
98	0.12
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.14
103	0.18
104	0.23
105	0.31
106	0.33
107	0.38
108	0.45
109	0.51
110	0.5
111	0.49
112	0.47
113	0.4
114	0.4
115	0.38
116	0.37
117	0.33
118	0.34
119	0.3
120	0.28
121	0.27
122	0.22
123	0.18
124	0.13
125	0.16
126	0.22
127	0.21
128	0.22
129	0.26
130	0.3
131	0.35
132	0.41
133	0.38
134	0.34
135	0.35
136	0.34
137	0.36
138	0.32
139	0.26
140	0.19
141	0.19
142	0.16
143	0.15
144	0.13
145	0.08
146	0.09
147	0.11
148	0.12
149	0.17
150	0.18
151	0.21
152	0.25
153	0.27
154	0.3
155	0.36
156	0.35
157	0.32
158	0.32
159	0.28
160	0.25
161	0.24
162	0.21
163	0.16
164	0.25
165	0.27
166	0.3
167	0.31
168	0.32
169	0.32
170	0.35
171	0.41
172	0.39
173	0.43
174	0.48
175	0.49
176	0.55
177	0.6
178	0.62
179	0.58
180	0.56
181	0.52
182	0.46
183	0.46
184	0.43
185	0.37
186	0.34
187	0.32
188	0.27
189	0.24
190	0.21
191	0.2
192	0.19
193	0.19
194	0.16
195	0.16
196	0.17
197	0.18
198	0.19
199	0.19
200	0.26
201	0.27
202	0.27
203	0.31
204	0.29
205	0.31
206	0.3
207	0.3
208	0.22
209	0.23
210	0.24
211	0.21
212	0.21
213	0.24
214	0.27
215	0.25
216	0.25
217	0.23
218	0.22
219	0.2
220	0.21
221	0.2
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.19
227	0.18
228	0.18
229	0.14
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.11
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.14
244	0.15
245	0.2
246	0.2
247	0.22
248	0.21
249	0.22
250	0.22
251	0.22
252	0.27
253	0.22
254	0.23
255	0.28
256	0.29
257	0.27
258	0.28
259	0.27
260	0.23
261	0.27
262	0.26
263	0.2
264	0.24
265	0.25
266	0.27
267	0.27
268	0.25
269	0.23
270	0.21
271	0.21
272	0.18
273	0.23
274	0.2
275	0.22
276	0.23
277	0.22
278	0.26
279	0.25
280	0.25
281	0.21
282	0.21
283	0.21
284	0.19
285	0.2
286	0.18
287	0.18
288	0.19
289	0.17
290	0.18
291	0.17
292	0.18
293	0.19
294	0.17
295	0.18
296	0.18
297	0.18
298	0.19
299	0.18
300	0.18
301	0.17
302	0.18
303	0.18
304	0.17
305	0.17
306	0.19
307	0.2
308	0.21
309	0.26
310	0.28
311	0.28
312	0.29
313	0.28
314	0.28
315	0.28
316	0.27
317	0.23
318	0.21
319	0.22
320	0.24
321	0.28
322	0.24
323	0.24
324	0.22
325	0.23
326	0.26
327	0.28
328	0.24
329	0.22
330	0.23
331	0.23
332	0.27
333	0.26
334	0.23
335	0.26
336	0.25
337	0.31
338	0.34
339	0.38
340	0.37
341	0.37
342	0.37
343	0.34
344	0.35
345	0.34
346	0.3
347	0.27
348	0.24
349	0.23
350	0.26
351	0.24
352	0.23
353	0.2
354	0.2
355	0.26
356	0.27
357	0.32
358	0.3
359	0.33
360	0.38
361	0.39
362	0.45
363	0.43
364	0.43
365	0.39
366	0.42
367	0.4
368	0.35
369	0.31
370	0.25
371	0.2
372	0.18
373	0.16
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.12
378	0.11
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.15
384	0.14
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.06
392	0.05
393	0.04
394	0.03
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.02
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.08
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.07
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.18
442	0.16
443	0.12
444	0.14
445	0.2
446	0.23
447	0.22
448	0.22
449	0.22
450	0.23
451	0.23
452	0.2
453	0.16
454	0.11
455	0.1
456	0.11
457	0.1
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.12
476	0.14
477	0.12
478	0.14
479	0.13
480	0.14
481	0.14
482	0.13
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.08
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.09
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.07
525	0.11
526	0.12
527	0.16
528	0.16
529	0.18
530	0.2
531	0.21
532	0.21
533	0.18
534	0.16
535	0.12
536	0.14
537	0.15
538	0.14
539	0.13
540	0.13
541	0.12
542	0.15
543	0.17
544	0.14
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.15
549	0.16
550	0.13
551	0.11
552	0.1
553	0.1
554	0.11
555	0.14
556	0.12
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.11
564	0.1
565	0.11
566	0.12
567	0.11
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.15
572	0.16
573	0.16
574	0.16
575	0.17
576	0.17
577	0.16
578	0.14
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.13
587	0.13
588	0.15
589	0.19
590	0.19
591	0.25
592	0.25
593	0.28
594	0.33
595	0.39
596	0.4
597	0.39
598	0.45
599	0.45
600	0.47
601	0.48
602	0.44
603	0.39
604	0.35
605	0.34
606	0.28
607	0.26
608	0.25
609	0.24
610	0.23
611	0.22
612	0.22
613	0.22
614	0.21
615	0.18
616	0.19
617	0.19
618	0.18
619	0.23
620	0.23
621	0.24
622	0.26
623	0.26
624	0.24
625	0.22
626	0.2
627	0.15
628	0.14
629	0.11
630	0.09
631	0.07
632	0.06
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.06
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.09
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.09
656	0.09
657	0.09
658	0.08
659	0.08
660	0.09
661	0.1
662	0.11
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.11
667	0.11
668	0.1
669	0.07
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.08
676	0.1
677	0.15
678	0.2
679	0.27
680	0.36
681	0.47
682	0.58
683	0.66
684	0.75
685	0.83
686	0.89
687	0.93
688	0.95
689	0.96
690	0.96
691	0.96
692	0.97
693	0.97
694	0.97
695	0.97
696	0.97
697	0.97
698	0.97
699	0.97
700	0.97
701	0.97
702	0.97
703	0.97
704	0.97
705	0.97
706	0.97
707	0.97
708	0.97
709	0.96
710	0.95
711	0.95
712	0.95
713	0.91
714	0.88
715	0.83
716	0.82
717	0.78
718	0.77
719	0.74
720	0.71
721	0.7
722	0.68
723	0.64
724	0.6
725	0.55
726	0.49
727	0.49
728	0.45
729	0.38
730	0.34
731	0.34
732	0.29
733	0.27
734	0.23
735	0.16
736	0.13
737	0.12
738	0.09
739	0.09
740	0.08
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.09
745	0.1
746	0.14
747	0.14
748	0.14
749	0.13
750	0.13
751	0.12
752	0.13
753	0.12
754	0.09
755	0.08
756	0.08
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.13
762	0.15
763	0.16
764	0.16
765	0.13
766	0.15
767	0.17
768	0.19
769	0.17
770	0.17
771	0.21
772	0.23
773	0.3
774	0.3
775	0.33
776	0.33
777	0.34
778	0.33
779	0.31
780	0.3
781	0.29
782	0.35
783	0.32
784	0.35
785	0.32
786	0.35
787	0.34
788	0.32
789	0.27
790	0.19
791	0.19
792	0.15
793	0.16
794	0.11
795	0.1
796	0.11
797	0.17
798	0.24
799	0.26
800	0.32
801	0.35
802	0.41
803	0.47
804	0.53
805	0.53
806	0.51
807	0.51
808	0.53
809	0.5
810	0.49
811	0.5
812	0.46
813	0.44
814	0.44
815	0.41
816	0.35
817	0.34
818	0.31
819	0.23
820	0.22
821	0.2
822	0.18
823	0.18
824	0.15
825	0.16
826	0.15
827	0.16
828	0.16
829	0.14
830	0.14
831	0.14
832	0.14
833	0.13
834	0.14
835	0.13
836	0.18
837	0.19
838	0.17
839	0.19
840	0.19
841	0.2
842	0.21
843	0.21
844	0.15
845	0.12
846	0.11
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.09
854	0.09
855	0.09
856	0.09
857	0.08
858	0.1
859	0.1
860	0.11
861	0.11
862	0.11
863	0.1
864	0.1
865	0.09
866	0.08
867	0.07
868	0.06
869	0.06
870	0.07
871	0.08
872	0.09
873	0.09
874	0.11
875	0.12
876	0.13
877	0.18
878	0.21
879	0.21
880	0.23
881	0.29
882	0.27
883	0.27
884	0.31
885	0.24
886	0.23
887	0.23
888	0.21
889	0.16
890	0.17
891	0.2
892	0.16
893	0.19
894	0.19
895	0.21
896	0.21
897	0.23
898	0.26
899	0.29
900	0.34
901	0.37
902	0.35
903	0.33
904	0.33
905	0.32
906	0.32
907	0.26
908	0.22
909	0.19
910	0.19
911	0.19
912	0.18
913	0.17
914	0.12
915	0.12
916	0.11
917	0.13
918	0.18
919	0.18
920	0.19
921	0.19
922	0.22
923	0.23
924	0.24
925	0.22
926	0.2
927	0.19
928	0.18
929	0.17
930	0.16

A0A4Q9LZJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer