FuNGI

A0A4Q9LS10

Protein Details

Accession

A0A4Q9LS10

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
962-982	LNKYKFKSSKRIRSHSVQEIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGRRKKVDSENIKNEEIKAVNNSEIGLKETKTCDRDVVTISETLPPQPTIHNNTHSPPSTTLYVTPVSLLDSAHPSSCPDSSACGPANTMENLNAPAISEGNRLMVLHSILDSVTAVEQEWPRSAMSAVQKRFEYYNGKFGRTVDIDVLKKLTHNEAEREIRREENGERRRTPTCLAEPCFLTDTTLYMNLREKFLCKIKELSEKEIGDVVVRTRKLPSELVDNKVLELINRITGEYAEFHVPKNVSDAARIIQAAHVCYDEETRKEKPRSAWKENIESKISKLVLSKDLLEKARKLEKLSTSETKKFNLDLSKINDLSEALVKKNEALNVYEKKITMYESRRKFRKENRMFELFRGRFHRGLSERVESEHVVYRDEISEFWSKMWNKNDKVVTYDEYLIPFVSDTQQTTFPSLEEFIDIINCLPNWKAAGIDGIYNFYINKLTGLHKYLYDIVKAICLEGTSKADWYYCRLTYLIPKGTPNTGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVRVEVERRGLLSDNQLGAVRGVQGAKEQALLNIAINKEYGNNLKATWIDVIISKWKIDISVGPEKIMSKKIDRGILQGDSLSPLLFVLCMDPLSRKLNEKYTKVTIKTDAESHATNHLLFIDDLKLLAKNGTTLEKMTEEVKMFMKNIGLEINKEKSATNDPCCEDTATLLEGIGVHKYLGIIEDSRGIPTSKSFEEVQTKLIARVERLCRTRLNARNLFQAINQHAISLLNYHIGVLRLEPADFLKLDDAVRAVLVKNKIHLRPGCKERLYLPRTELGRGLHSVEFKSEHMLLQLLDCLEKSKETSTRRAAILKVENDNKTRLALIKDFLQVKYGMAEEVTKKSLEEAQLAKLYNEIEKRKLHSKLYSARNNELVSVNDSSRWLKKGSVRPRDEAVFCYIQDRNVFWGAEGVCQHCNTSRKTVDHLATRCEKMLGHDYTRRHNEVVRCIHLLFLNKYKFKSSKRIRSHSVQEILDNEYAEIRVDTRIKTDVKIRNNRPDIFVLDKRRNKITLIEVGITSQDSLQIVETEKLRKYDLLANELGLIYKCSVEIISYVITWDGIVTKYHKTYLKRLQIPINVEAYIQSIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.57
3	0.47
4	0.39
5	0.34
6	0.31
7	0.29
8	0.28
9	0.27
10	0.24
11	0.23
12	0.24
13	0.21
14	0.19
15	0.22
16	0.27
17	0.34
18	0.33
19	0.34
20	0.35
21	0.35
22	0.38
23	0.37
24	0.36
25	0.31
26	0.3
27	0.29
28	0.3
29	0.28
30	0.26
31	0.25
32	0.22
33	0.21
34	0.25
35	0.31
36	0.33
37	0.4
38	0.44
39	0.44
40	0.47
41	0.54
42	0.52
43	0.48
44	0.44
45	0.41
46	0.38
47	0.36
48	0.34
49	0.29
50	0.28
51	0.24
52	0.22
53	0.18
54	0.17
55	0.15
56	0.14
57	0.13
58	0.16
59	0.17
60	0.17
61	0.18
62	0.18
63	0.2
64	0.2
65	0.2
66	0.16
67	0.2
68	0.21
69	0.27
70	0.27
71	0.24
72	0.25
73	0.24
74	0.27
75	0.24
76	0.23
77	0.18
78	0.18
79	0.19
80	0.19
81	0.17
82	0.13
83	0.13
84	0.12
85	0.13
86	0.13
87	0.11
88	0.12
89	0.13
90	0.12
91	0.12
92	0.14
93	0.12
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.09
98	0.1
99	0.09
100	0.08
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.11
105	0.14
106	0.15
107	0.17
108	0.17
109	0.17
110	0.18
111	0.18
112	0.19
113	0.27
114	0.34
115	0.35
116	0.39
117	0.4
118	0.41
119	0.42
120	0.42
121	0.41
122	0.35
123	0.42
124	0.41
125	0.43
126	0.42
127	0.41
128	0.44
129	0.37
130	0.35
131	0.3
132	0.34
133	0.33
134	0.33
135	0.33
136	0.26
137	0.25
138	0.26
139	0.26
140	0.26
141	0.29
142	0.31
143	0.37
144	0.46
145	0.49
146	0.51
147	0.48
148	0.44
149	0.41
150	0.41
151	0.4
152	0.42
153	0.47
154	0.51
155	0.52
156	0.54
157	0.56
158	0.55
159	0.52
160	0.49
161	0.49
162	0.49
163	0.49
164	0.49
165	0.47
166	0.46
167	0.45
168	0.36
169	0.29
170	0.21
171	0.18
172	0.16
173	0.2
174	0.17
175	0.17
176	0.24
177	0.24
178	0.26
179	0.26
180	0.25
181	0.28
182	0.35
183	0.36
184	0.33
185	0.36
186	0.4
187	0.49
188	0.51
189	0.51
190	0.51
191	0.48
192	0.46
193	0.43
194	0.37
195	0.28
196	0.25
197	0.22
198	0.2
199	0.21
200	0.2
201	0.2
202	0.23
203	0.25
204	0.27
205	0.26
206	0.3
207	0.35
208	0.38
209	0.41
210	0.38
211	0.35
212	0.34
213	0.32
214	0.21
215	0.2
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.13
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.16
228	0.21
229	0.21
230	0.2
231	0.22
232	0.24
233	0.19
234	0.2
235	0.21
236	0.17
237	0.19
238	0.19
239	0.16
240	0.14
241	0.15
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.11
246	0.12
247	0.15
248	0.16
249	0.18
250	0.22
251	0.27
252	0.36
253	0.39
254	0.44
255	0.48
256	0.56
257	0.62
258	0.66
259	0.69
260	0.66
261	0.73
262	0.74
263	0.71
264	0.64
265	0.56
266	0.49
267	0.46
268	0.41
269	0.32
270	0.28
271	0.26
272	0.26
273	0.27
274	0.28
275	0.25
276	0.3
277	0.32
278	0.33
279	0.31
280	0.33
281	0.39
282	0.38
283	0.37
284	0.39
285	0.41
286	0.43
287	0.48
288	0.51
289	0.5
290	0.55
291	0.54
292	0.5
293	0.46
294	0.41
295	0.39
296	0.37
297	0.33
298	0.33
299	0.35
300	0.4
301	0.38
302	0.37
303	0.33
304	0.27
305	0.25
306	0.23
307	0.19
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.16
312	0.18
313	0.19
314	0.15
315	0.16
316	0.23
317	0.26
318	0.28
319	0.28
320	0.26
321	0.25
322	0.24
323	0.25
324	0.25
325	0.3
326	0.36
327	0.44
328	0.52
329	0.58
330	0.63
331	0.69
332	0.71
333	0.74
334	0.75
335	0.75
336	0.73
337	0.75
338	0.71
339	0.67
340	0.68
341	0.57
342	0.52
343	0.48
344	0.45
345	0.38
346	0.37
347	0.41
348	0.32
349	0.37
350	0.36
351	0.35
352	0.32
353	0.31
354	0.33
355	0.25
356	0.25
357	0.25
358	0.21
359	0.18
360	0.18
361	0.17
362	0.16
363	0.16
364	0.14
365	0.12
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.21
370	0.22
371	0.27
372	0.36
373	0.4
374	0.38
375	0.45
376	0.48
377	0.42
378	0.43
379	0.4
380	0.35
381	0.29
382	0.29
383	0.23
384	0.19
385	0.19
386	0.16
387	0.13
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.1
394	0.13
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.11
402	0.09
403	0.09
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.08
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.1
431	0.12
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.16
436	0.2
437	0.2
438	0.18
439	0.16
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.14
455	0.17
456	0.15
457	0.16
458	0.16
459	0.16
460	0.21
461	0.27
462	0.27
463	0.24
464	0.25
465	0.25
466	0.27
467	0.27
468	0.22
469	0.22
470	0.21
471	0.21
472	0.22
473	0.24
474	0.22
475	0.22
476	0.22
477	0.17
478	0.15
479	0.17
480	0.17
481	0.21
482	0.2
483	0.21
484	0.25
485	0.24
486	0.27
487	0.28
488	0.27
489	0.22
490	0.29
491	0.29
492	0.28
493	0.31
494	0.31
495	0.32
496	0.33
497	0.35
498	0.32
499	0.33
500	0.29
501	0.25
502	0.22
503	0.18
504	0.17
505	0.17
506	0.15
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.11
512	0.1
513	0.08
514	0.06
515	0.06
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.09
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.11
546	0.11
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.1
553	0.13
554	0.2
555	0.2
556	0.2
557	0.21
558	0.21
559	0.23
560	0.25
561	0.21
562	0.16
563	0.21
564	0.24
565	0.27
566	0.27
567	0.28
568	0.27
569	0.25
570	0.23
571	0.18
572	0.15
573	0.12
574	0.11
575	0.09
576	0.06
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.08
587	0.12
588	0.13
589	0.16
590	0.19
591	0.28
592	0.33
593	0.35
594	0.37
595	0.41
596	0.45
597	0.43
598	0.43
599	0.38
600	0.35
601	0.34
602	0.31
603	0.25
604	0.22
605	0.21
606	0.2
607	0.18
608	0.16
609	0.15
610	0.13
611	0.11
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.07
625	0.09
626	0.09
627	0.1
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.12
632	0.13
633	0.12
634	0.13
635	0.14
636	0.14
637	0.14
638	0.14
639	0.14
640	0.11
641	0.11
642	0.13
643	0.12
644	0.13
645	0.16
646	0.18
647	0.17
648	0.18
649	0.17
650	0.16
651	0.24
652	0.28
653	0.28
654	0.31
655	0.32
656	0.33
657	0.34
658	0.32
659	0.23
660	0.19
661	0.16
662	0.12
663	0.1
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.06
669	0.05
670	0.04
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.1
679	0.1
680	0.1
681	0.11
682	0.11
683	0.1
684	0.11
685	0.15
686	0.12
687	0.15
688	0.15
689	0.18
690	0.24
691	0.25
692	0.25
693	0.25
694	0.25
695	0.24
696	0.26
697	0.22
698	0.18
699	0.24
700	0.28
701	0.32
702	0.33
703	0.35
704	0.34
705	0.38
706	0.46
707	0.47
708	0.51
709	0.5
710	0.5
711	0.54
712	0.54
713	0.5
714	0.42
715	0.39
716	0.32
717	0.29
718	0.27
719	0.2
720	0.18
721	0.18
722	0.17
723	0.12
724	0.1
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.09
730	0.09
731	0.08
732	0.1
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.1
740	0.08
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.09
745	0.07
746	0.07
747	0.08
748	0.07
749	0.11
750	0.15
751	0.15
752	0.2
753	0.26
754	0.28
755	0.35
756	0.39
757	0.4
758	0.45
759	0.52
760	0.56
761	0.51
762	0.51
763	0.49
764	0.55
765	0.52
766	0.46
767	0.41
768	0.39
769	0.39
770	0.39
771	0.36
772	0.27
773	0.27
774	0.24
775	0.25
776	0.21
777	0.21
778	0.2
779	0.19
780	0.19
781	0.17
782	0.19
783	0.16
784	0.14
785	0.13
786	0.14
787	0.12
788	0.11
789	0.12
790	0.09
791	0.09
792	0.08
793	0.1
794	0.09
795	0.1
796	0.11
797	0.14
798	0.21
799	0.25
800	0.34
801	0.38
802	0.42
803	0.44
804	0.45
805	0.42
806	0.42
807	0.45
808	0.42
809	0.42
810	0.44
811	0.46
812	0.45
813	0.45
814	0.39
815	0.32
816	0.29
817	0.25
818	0.23
819	0.22
820	0.21
821	0.23
822	0.28
823	0.3
824	0.28
825	0.27
826	0.23
827	0.21
828	0.21
829	0.17
830	0.11
831	0.09
832	0.12
833	0.13
834	0.16
835	0.17
836	0.16
837	0.15
838	0.17
839	0.2
840	0.19
841	0.21
842	0.2
843	0.23
844	0.27
845	0.27
846	0.25
847	0.23
848	0.22
849	0.22
850	0.27
851	0.26
852	0.28
853	0.31
854	0.36
855	0.43
856	0.47
857	0.49
858	0.48
859	0.53
860	0.57
861	0.63
862	0.67
863	0.64
864	0.62
865	0.61
866	0.56
867	0.49
868	0.42
869	0.34
870	0.28
871	0.26
872	0.23
873	0.19
874	0.21
875	0.22
876	0.23
877	0.24
878	0.22
879	0.24
880	0.32
881	0.41
882	0.5
883	0.57
884	0.59
885	0.61
886	0.64
887	0.65
888	0.58
889	0.5
890	0.46
891	0.37
892	0.32
893	0.33
894	0.29
895	0.26
896	0.26
897	0.25
898	0.22
899	0.23
900	0.23
901	0.19
902	0.23
903	0.2
904	0.22
905	0.23
906	0.21
907	0.2
908	0.2
909	0.22
910	0.22
911	0.27
912	0.27
913	0.34
914	0.38
915	0.39
916	0.44
917	0.51
918	0.51
919	0.55
920	0.54
921	0.52
922	0.52
923	0.51
924	0.46
925	0.39
926	0.34
927	0.3
928	0.36
929	0.34
930	0.34
931	0.39
932	0.41
933	0.5
934	0.56
935	0.55
936	0.48
937	0.49
938	0.49
939	0.52
940	0.56
941	0.51
942	0.47
943	0.44
944	0.44
945	0.41
946	0.4
947	0.35
948	0.36
949	0.4
950	0.41
951	0.42
952	0.48
953	0.53
954	0.53
955	0.6
956	0.62
957	0.65
958	0.72
959	0.79
960	0.78
961	0.8
962	0.82
963	0.8
964	0.77
965	0.67
966	0.59
967	0.52
968	0.5
969	0.42
970	0.34
971	0.24
972	0.18
973	0.17
974	0.15
975	0.13
976	0.1
977	0.13
978	0.16
979	0.16
980	0.18
981	0.24
982	0.25
983	0.28
984	0.36
985	0.4
986	0.48
987	0.58
988	0.63
989	0.68
990	0.75
991	0.74
992	0.69
993	0.65
994	0.59
995	0.57
996	0.56
997	0.55
998	0.57
999	0.62
1000	0.62
1001	0.63
1002	0.6
1003	0.54
1004	0.52
1005	0.5
1006	0.48
1007	0.45
1008	0.43
1009	0.37
1010	0.36
1011	0.35
1012	0.29
1013	0.22
1014	0.14
1015	0.11
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.13
1021	0.16
1022	0.19
1023	0.23
1024	0.26
1025	0.27
1026	0.28
1027	0.27
1028	0.29
1029	0.34
1030	0.35
1031	0.36
1032	0.34
1033	0.32
1034	0.32
1035	0.31
1036	0.28
1037	0.21
1038	0.17
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.09
1045	0.09
1046	0.1
1047	0.11
1048	0.1
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.09
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.09
1056	0.12
1057	0.14
1058	0.2
1059	0.22
1060	0.29
1061	0.34
1062	0.38
1063	0.47
1064	0.55
1065	0.63
1066	0.65
1067	0.69
1068	0.71
1069	0.72
1070	0.72
1071	0.67
1072	0.59
1073	0.49
1074	0.41
1075	0.35
1076	0.28

A0A4Q9LS10

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer