Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LVT2

Protein Details
Accession A0A4Q9LVT2    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39ASEIKFKYKNLEKKETLRQKDKIHydrophilic
41-68NIYLIKILKKKFKKIKEKIYKSIKYCTIHydrophilic
165-191YLKSFCSRAKIRKNKKIENKKQENENEHydrophilic
316-341RCEICKNKKIRGRKEFFKHFKQPEHLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-58LKKKFKKIKEK
174-180KIRKNKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
Amino Acid Sequences MKNIRNVYKILKLIEKASEIKFKYKNLEKKETLRQKDKIVNIYLIKILKKKFKKIKEKIYKSIKYCTIGEVNTVIYDFYEDIEWLKSKKEKIKIYNEIENKIRNKIENIFSKEERYGRCVDLKSIFEKYRSIMKFTEYKEFLEDFLCVEKYNFSYFSYLKELNEYLKSFCSRAKIRKNKKIENKKQENENESIENKKQEIELRDFFDSRTFCEGCNRIIMTKMVCFHIKSKRHMKNISCNLLNIKYEEIYKLEKEIKIFTKILKDEIELSKSLCNVIEIESISNEEISDTKKFAVEKNEEIPSWLKKYYGLDITFRCEICKNKKIRGRKEFFKHFKQPEHLENLETHNIEYCDLFYGITTFSGIENMKTRIFLDQNIFIEEVEDEEGNVYDKKTFEDLKKMGII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.4
4 0.41
5 0.45
6 0.41
7 0.47
8 0.48
9 0.48
10 0.54
11 0.59
12 0.63
13 0.64
14 0.72
15 0.7
16 0.74
17 0.8
18 0.81
19 0.81
20 0.81
21 0.77
22 0.75
23 0.77
24 0.75
25 0.72
26 0.65
27 0.62
28 0.54
29 0.52
30 0.48
31 0.43
32 0.4
33 0.39
34 0.4
35 0.44
36 0.5
37 0.58
38 0.64
39 0.71
40 0.78
41 0.83
42 0.88
43 0.9
44 0.91
45 0.9
46 0.91
47 0.89
48 0.82
49 0.8
50 0.75
51 0.67
52 0.59
53 0.54
54 0.48
55 0.4
56 0.37
57 0.3
58 0.24
59 0.2
60 0.19
61 0.14
62 0.09
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.17
73 0.21
74 0.27
75 0.35
76 0.43
77 0.49
78 0.57
79 0.67
80 0.72
81 0.73
82 0.76
83 0.72
84 0.68
85 0.63
86 0.61
87 0.53
88 0.49
89 0.45
90 0.38
91 0.37
92 0.39
93 0.42
94 0.44
95 0.48
96 0.49
97 0.48
98 0.49
99 0.49
100 0.47
101 0.42
102 0.37
103 0.34
104 0.3
105 0.35
106 0.32
107 0.32
108 0.32
109 0.32
110 0.31
111 0.34
112 0.33
113 0.29
114 0.29
115 0.27
116 0.31
117 0.3
118 0.3
119 0.25
120 0.27
121 0.32
122 0.34
123 0.41
124 0.33
125 0.32
126 0.32
127 0.32
128 0.29
129 0.23
130 0.2
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.11
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.21
145 0.21
146 0.19
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.23
151 0.2
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.19
157 0.23
158 0.26
159 0.34
160 0.44
161 0.52
162 0.61
163 0.7
164 0.78
165 0.8
166 0.85
167 0.87
168 0.87
169 0.88
170 0.88
171 0.83
172 0.82
173 0.79
174 0.72
175 0.64
176 0.55
177 0.47
178 0.38
179 0.36
180 0.29
181 0.25
182 0.21
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.25
190 0.27
191 0.26
192 0.25
193 0.25
194 0.21
195 0.18
196 0.2
197 0.18
198 0.16
199 0.22
200 0.23
201 0.2
202 0.23
203 0.21
204 0.16
205 0.17
206 0.18
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.19
214 0.27
215 0.32
216 0.37
217 0.47
218 0.53
219 0.6
220 0.66
221 0.66
222 0.68
223 0.71
224 0.7
225 0.6
226 0.53
227 0.48
228 0.43
229 0.39
230 0.29
231 0.21
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.16
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.25
243 0.26
244 0.28
245 0.29
246 0.28
247 0.3
248 0.3
249 0.31
250 0.27
251 0.25
252 0.25
253 0.27
254 0.27
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.18
260 0.13
261 0.11
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.18
281 0.26
282 0.28
283 0.3
284 0.34
285 0.37
286 0.34
287 0.36
288 0.36
289 0.31
290 0.3
291 0.26
292 0.22
293 0.22
294 0.25
295 0.28
296 0.31
297 0.29
298 0.31
299 0.32
300 0.36
301 0.37
302 0.35
303 0.31
304 0.28
305 0.34
306 0.38
307 0.45
308 0.46
309 0.51
310 0.6
311 0.68
312 0.75
313 0.78
314 0.78
315 0.8
316 0.84
317 0.86
318 0.87
319 0.86
320 0.86
321 0.82
322 0.81
323 0.8
324 0.76
325 0.72
326 0.71
327 0.62
328 0.54
329 0.48
330 0.46
331 0.43
332 0.36
333 0.29
334 0.25
335 0.24
336 0.23
337 0.21
338 0.16
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.24
358 0.26
359 0.28
360 0.29
361 0.33
362 0.34
363 0.35
364 0.35
365 0.28
366 0.27
367 0.22
368 0.18
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.13
379 0.16
380 0.21
381 0.28
382 0.31
383 0.4
384 0.41