Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LPW3

Protein Details
Accession A0A4Q9LPW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-34FLTDIFKKKKNEKEASEPMKSHydrophilic
212-233VLNDRKKRNGLIKKKETFRKESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-234RKKRNGLIKKKETFRKESL
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MFREFLKSNILVNFLTDIFKKKKNEKEASEPMKSATKIFIKIRTITDDEIIGNLKNFNNNLIDLSDAYFVTNPKLIFPTLVIRMEDSLKISEIQENEGFFIDGDFMGKKEDKKSDLVHFECKNGESESFNVKESKNWDQFKANEQLFGIKSSFDESQYTVVLDKNSEFYKKNVEHAKKLAQEILSKKCTDRHRMEERGHFYDINEEEKYSSVLNDRKKRNGLIKKKETFRKESLRNGESKDYPHRPSSPIKENFRKESTRNGESKDYPHRPSSPIKENFKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.18
4 0.23
5 0.26
6 0.33
7 0.4
8 0.47
9 0.56
10 0.64
11 0.72
12 0.72
13 0.77
14 0.81
15 0.81
16 0.77
17 0.68
18 0.6
19 0.56
20 0.5
21 0.4
22 0.37
23 0.33
24 0.35
25 0.39
26 0.43
27 0.41
28 0.44
29 0.46
30 0.45
31 0.43
32 0.38
33 0.35
34 0.29
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.12
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.17
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.19
73 0.16
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.13
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.1
87 0.1
88 0.07
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.15
97 0.19
98 0.21
99 0.24
100 0.28
101 0.32
102 0.38
103 0.38
104 0.41
105 0.39
106 0.38
107 0.35
108 0.32
109 0.27
110 0.21
111 0.19
112 0.13
113 0.14
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.18
120 0.21
121 0.27
122 0.31
123 0.32
124 0.33
125 0.35
126 0.37
127 0.39
128 0.42
129 0.34
130 0.26
131 0.25
132 0.26
133 0.22
134 0.22
135 0.17
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.23
157 0.23
158 0.29
159 0.36
160 0.39
161 0.41
162 0.45
163 0.5
164 0.45
165 0.45
166 0.41
167 0.34
168 0.35
169 0.36
170 0.38
171 0.35
172 0.32
173 0.32
174 0.36
175 0.4
176 0.44
177 0.45
178 0.48
179 0.53
180 0.6
181 0.65
182 0.67
183 0.67
184 0.62
185 0.57
186 0.48
187 0.39
188 0.39
189 0.35
190 0.3
191 0.24
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.13
197 0.12
198 0.15
199 0.2
200 0.29
201 0.37
202 0.43
203 0.49
204 0.54
205 0.59
206 0.63
207 0.68
208 0.7
209 0.72
210 0.76
211 0.78
212 0.82
213 0.85
214 0.82
215 0.79
216 0.77
217 0.76
218 0.73
219 0.74
220 0.74
221 0.7
222 0.67
223 0.64
224 0.62
225 0.55
226 0.53
227 0.53
228 0.51
229 0.5
230 0.52
231 0.5
232 0.48
233 0.55
234 0.58
235 0.59
236 0.61
237 0.67
238 0.71
239 0.75
240 0.78
241 0.75
242 0.73
243 0.65
244 0.67
245 0.66
246 0.64
247 0.61
248 0.59
249 0.6
250 0.57
251 0.62
252 0.62
253 0.6
254 0.56
255 0.57
256 0.56
257 0.53
258 0.58
259 0.59
260 0.59
261 0.61
262 0.67