Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LST3

Protein Details
Accession A0A4Q9LST3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MGRKKTRRSQIKTKKRSDRMENRFNCPECHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-16RKKTRRSQIKTKKR
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.666, nucl 10.5, mito 9.5, cyto_nucl 8.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007808  Elf1  
IPR038567  T_Elf1_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05129  Elf1  
Amino Acid Sequences MGRKKTRRSQIKTKKRSDRMENRFNCPECNNESVVKCKIEKSSRLGYAYCTLCEASYKCSVNNLSHPVDVYSSWIDNFNRKDLDLEEKSIIHKDIELSNEEMQRLNDLRSYCEMVKIVQNKDDTLSPTTNTDDNSIKIIYPGNIKFKIGIIENMKSTTNPKFYVGHLISKEVFEYMIEILCDINRINFKLPAFLYIQLINGIIGLKPETNFYFRSLLSRLNYWAFTGNHLNEIIENKNKLEFDNSFTKQFFYMTAFISYLNYLNISVTFLNSKMILSSSSITNYNTYPSKEKLDNRYNLIFEDKTLMVFFTNINEHNKLLYEWMFLEMDNIETITFLDLKSLNYINIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.92
4 0.92
5 0.92
6 0.91
7 0.91
8 0.86
9 0.83
10 0.82
11 0.74
12 0.68
13 0.59
14 0.54
15 0.48
16 0.46
17 0.41
18 0.37
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.4
23 0.36
24 0.36
25 0.42
26 0.44
27 0.48
28 0.49
29 0.53
30 0.55
31 0.56
32 0.53
33 0.47
34 0.47
35 0.43
36 0.36
37 0.29
38 0.23
39 0.21
40 0.24
41 0.22
42 0.19
43 0.25
44 0.25
45 0.24
46 0.29
47 0.32
48 0.32
49 0.37
50 0.39
51 0.34
52 0.34
53 0.34
54 0.29
55 0.27
56 0.23
57 0.2
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.18
62 0.18
63 0.24
64 0.26
65 0.27
66 0.26
67 0.26
68 0.27
69 0.25
70 0.32
71 0.28
72 0.29
73 0.26
74 0.26
75 0.27
76 0.27
77 0.26
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.22
86 0.23
87 0.23
88 0.22
89 0.19
90 0.21
91 0.19
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.23
98 0.2
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.24
103 0.28
104 0.27
105 0.27
106 0.27
107 0.25
108 0.26
109 0.27
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.16
128 0.18
129 0.22
130 0.23
131 0.23
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.18
136 0.2
137 0.17
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.17
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.2
150 0.29
151 0.27
152 0.28
153 0.25
154 0.26
155 0.24
156 0.22
157 0.22
158 0.13
159 0.11
160 0.06
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.04
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.15
184 0.11
185 0.11
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.19
202 0.18
203 0.22
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.18
210 0.22
211 0.18
212 0.19
213 0.23
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.21
228 0.19
229 0.2
230 0.28
231 0.3
232 0.31
233 0.31
234 0.31
235 0.27
236 0.26
237 0.22
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.21
273 0.23
274 0.25
275 0.27
276 0.32
277 0.38
278 0.45
279 0.5
280 0.57
281 0.59
282 0.6
283 0.62
284 0.57
285 0.51
286 0.49
287 0.39
288 0.3
289 0.29
290 0.23
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.15
299 0.17
300 0.22
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.22
306 0.22
307 0.2
308 0.18
309 0.16
310 0.19
311 0.18
312 0.16
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.18
328 0.19