FuNGI

A0A4Q9LW06

Protein Details

Accession

A0A4Q9LW06

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
520-541	VSDYSRWRNKRNIRPRNEAMFC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MNESLNVYEKKIAMHESSKQFLKENRMFELFRGRFYRGLSERVESEHVVSRDEIVGFWSTMWNKNDETVMYDDYLIPFVSDNHPTTLTYLIPKGIPRRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQIEVERRGLLAENQLGTVRGVQGAKEQALLNIALNKEYGNNLKAAWIDVKKAYDSIDHAYLNQCIENLNLPDCILKFIRVIISKWKIDISVGPEKIMNKKIDRGILQRDSLSPLLFVLCMDPLSRKLNEKYTKVTVQTDAESYSTIHLLFINDLKLLAKDSSTLSAMTDEAKEFLDVIGLEINKEKSATNDTCCEDTATLLEGVSVYKYLGIIKDSRGIPTRSSFEEVQSKLIARVERLSHTRLNAKNLFSVINQPAISLIHFHIGLDDAVRAVLVKNKIHLRLGCKERLYLPRTELGRGLHSVELRSEHMLLQLLECLKKSKEISTRRAAILKVENNNKTHLALIKGFLKVKYRLVEEVTKKSLEEAQLAKLYNEIEKRKLHSKLYNARKNELVSVSDYSRWRNKRNIRPRNEAMFCYIQDRNVFWGADGICQHCGKSGKTVDHLATRCEKMLGHDYTRLHNEVVRCLHLLLLNRYKFKSSKRIRSHSVQEILDNEYAEIRVDTRIKTDVKIRNNRPDIFILDMKKNKITLIEVGITSQDSLQIVETEKLRKYDLLANELGLIYKCSVEIILYVMTWDGIVTKYHKSHLKRLEIPMNVDAYIQSIVLKKTVEIISFDRRRGLESGLNAEESGRERPWVLLWE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.38
3	0.41
4	0.46
5	0.48
6	0.47
7	0.48
8	0.49
9	0.54
10	0.52
11	0.49
12	0.49
13	0.51
14	0.5
15	0.47
16	0.52
17	0.43
18	0.43
19	0.43
20	0.4
21	0.38
22	0.39
23	0.47
24	0.39
25	0.43
26	0.4
27	0.39
28	0.38
29	0.39
30	0.4
31	0.31
32	0.3
33	0.32
34	0.3
35	0.28
36	0.27
37	0.25
38	0.24
39	0.24
40	0.2
41	0.15
42	0.16
43	0.15
44	0.15
45	0.18
46	0.18
47	0.25
48	0.27
49	0.28
50	0.26
51	0.28
52	0.3
53	0.25
54	0.26
55	0.23
56	0.23
57	0.21
58	0.21
59	0.2
60	0.18
61	0.19
62	0.15
63	0.11
64	0.1
65	0.11
66	0.14
67	0.18
68	0.19
69	0.21
70	0.22
71	0.22
72	0.23
73	0.23
74	0.21
75	0.2
76	0.19
77	0.18
78	0.19
79	0.23
80	0.29
81	0.33
82	0.35
83	0.35
84	0.43
85	0.47
86	0.51
87	0.56
88	0.59
89	0.55
90	0.55
91	0.53
92	0.47
93	0.42
94	0.41
95	0.35
96	0.35
97	0.32
98	0.33
99	0.37
100	0.35
101	0.4
102	0.41
103	0.39
104	0.33
105	0.38
106	0.37
107	0.36
108	0.41
109	0.39
110	0.4
111	0.41
112	0.43
113	0.41
114	0.41
115	0.35
116	0.3
117	0.26
118	0.2
119	0.18
120	0.19
121	0.19
122	0.17
123	0.18
124	0.18
125	0.18
126	0.17
127	0.17
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.15
133	0.18
134	0.18
135	0.19
136	0.19
137	0.16
138	0.17
139	0.17
140	0.14
141	0.15
142	0.15
143	0.13
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.17
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.16
153	0.16
154	0.17
155	0.2
156	0.18
157	0.2
158	0.22
159	0.23
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.17
164	0.19
165	0.2
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.21
170	0.22
171	0.21
172	0.18
173	0.14
174	0.1
175	0.11
176	0.14
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.14
182	0.14
183	0.17
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.14
188	0.19
189	0.19
190	0.2
191	0.26
192	0.32
193	0.31
194	0.32
195	0.31
196	0.26
197	0.25
198	0.27
199	0.24
200	0.27
201	0.26
202	0.26
203	0.27
204	0.29
205	0.34
206	0.37
207	0.34
208	0.28
209	0.33
210	0.36
211	0.39
212	0.41
213	0.41
214	0.43
215	0.43
216	0.42
217	0.38
218	0.35
219	0.34
220	0.31
221	0.26
222	0.17
223	0.13
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.1
233	0.14
234	0.16
235	0.2
236	0.23
237	0.32
238	0.38
239	0.4
240	0.43
241	0.45
242	0.47
243	0.45
244	0.44
245	0.37
246	0.33
247	0.31
248	0.26
249	0.21
250	0.18
251	0.16
252	0.13
253	0.11
254	0.1
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.07
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.16
298	0.18
299	0.19
300	0.23
301	0.24
302	0.24
303	0.25
304	0.24
305	0.17
306	0.15
307	0.13
308	0.1
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.15
325	0.15
326	0.17
327	0.2
328	0.21
329	0.21
330	0.23
331	0.25
332	0.21
333	0.24
334	0.22
335	0.22
336	0.27
337	0.26
338	0.25
339	0.23
340	0.21
341	0.18
342	0.21
343	0.18
344	0.12
345	0.15
346	0.15
347	0.17
348	0.19
349	0.21
350	0.2
351	0.22
352	0.29
353	0.28
354	0.33
355	0.34
356	0.32
357	0.3
358	0.29
359	0.28
360	0.21
361	0.24
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.15
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.09
370	0.09
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.08
385	0.1
386	0.11
387	0.14
388	0.18
389	0.19
390	0.22
391	0.24
392	0.26
393	0.31
394	0.36
395	0.37
396	0.34
397	0.34
398	0.36
399	0.42
400	0.39
401	0.33
402	0.3
403	0.31
404	0.31
405	0.31
406	0.28
407	0.22
408	0.21
409	0.19
410	0.19
411	0.16
412	0.15
413	0.14
414	0.13
415	0.13
416	0.13
417	0.13
418	0.12
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.1
430	0.14
431	0.15
432	0.2
433	0.28
434	0.35
435	0.42
436	0.47
437	0.51
438	0.49
439	0.5
440	0.44
441	0.39
442	0.38
443	0.36
444	0.36
445	0.39
446	0.41
447	0.39
448	0.41
449	0.38
450	0.31
451	0.28
452	0.23
453	0.19
454	0.16
455	0.18
456	0.19
457	0.2
458	0.21
459	0.21
460	0.24
461	0.23
462	0.26
463	0.27
464	0.26
465	0.25
466	0.27
467	0.34
468	0.34
469	0.37
470	0.36
471	0.33
472	0.31
473	0.3
474	0.3
475	0.23
476	0.22
477	0.18
478	0.19
479	0.22
480	0.22
481	0.21
482	0.19
483	0.18
484	0.18
485	0.22
486	0.22
487	0.23
488	0.26
489	0.3
490	0.37
491	0.41
492	0.43
493	0.43
494	0.5
495	0.55
496	0.63
497	0.67
498	0.62
499	0.6
500	0.57
501	0.52
502	0.46
503	0.38
504	0.29
505	0.24
506	0.24
507	0.23
508	0.24
509	0.24
510	0.25
511	0.32
512	0.36
513	0.38
514	0.46
515	0.54
516	0.61
517	0.71
518	0.77
519	0.77
520	0.81
521	0.83
522	0.82
523	0.75
524	0.66
525	0.6
526	0.52
527	0.44
528	0.4
529	0.33
530	0.26
531	0.24
532	0.24
533	0.22
534	0.21
535	0.21
536	0.16
537	0.19
538	0.17
539	0.19
540	0.19
541	0.17
542	0.18
543	0.18
544	0.18
545	0.18
546	0.2
547	0.18
548	0.25
549	0.28
550	0.28
551	0.32
552	0.36
553	0.34
554	0.39
555	0.39
556	0.35
557	0.35
558	0.33
559	0.3
560	0.27
561	0.25
562	0.22
563	0.29
564	0.3
565	0.27
566	0.32
567	0.32
568	0.36
569	0.39
570	0.37
571	0.29
572	0.27
573	0.26
574	0.27
575	0.28
576	0.26
577	0.23
578	0.21
579	0.22
580	0.22
581	0.25
582	0.26
583	0.32
584	0.34
585	0.37
586	0.38
587	0.41
588	0.42
589	0.45
590	0.48
591	0.5
592	0.57
593	0.64
594	0.71
595	0.73
596	0.77
597	0.79
598	0.77
599	0.73
600	0.63
601	0.55
602	0.49
603	0.46
604	0.39
605	0.31
606	0.22
607	0.16
608	0.15
609	0.13
610	0.11
611	0.08
612	0.11
613	0.14
614	0.14
615	0.16
616	0.21
617	0.22
618	0.25
619	0.33
620	0.37
621	0.45
622	0.55
623	0.61
624	0.66
625	0.72
626	0.72
627	0.67
628	0.62
629	0.54
630	0.5
631	0.47
632	0.4
633	0.41
634	0.44
635	0.43
636	0.42
637	0.39
638	0.34
639	0.32
640	0.3
641	0.25
642	0.25
643	0.25
644	0.23
645	0.22
646	0.22
647	0.2
648	0.18
649	0.14
650	0.11
651	0.08
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.12
656	0.14
657	0.17
658	0.21
659	0.23
660	0.25
661	0.25
662	0.25
663	0.27
664	0.31
665	0.33
666	0.33
667	0.31
668	0.3
669	0.3
670	0.29
671	0.26
672	0.19
673	0.16
674	0.11
675	0.1
676	0.09
677	0.08
678	0.09
679	0.08
680	0.08
681	0.09
682	0.09
683	0.08
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.09
692	0.12
693	0.18
694	0.21
695	0.27
696	0.35
697	0.4
698	0.49
699	0.56
700	0.63
701	0.64
702	0.71
703	0.73
704	0.69
705	0.68
706	0.62
707	0.55
708	0.45
709	0.38
710	0.29
711	0.22
712	0.18
713	0.14
714	0.12
715	0.13
716	0.14
717	0.16
718	0.16
719	0.14
720	0.21
721	0.24
722	0.23
723	0.24
724	0.28
725	0.37
726	0.42
727	0.43
728	0.42
729	0.4
730	0.42
731	0.4
732	0.4
733	0.34
734	0.33
735	0.39
736	0.35
737	0.36
738	0.32
739	0.3
740	0.27
741	0.25
742	0.25
743	0.19
744	0.18
745	0.19
746	0.2

A0A4Q9LW06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer